本发明公开一种醛缩酶及其在果糖‑6‑磷酸生物合成中的应用。本发明通过数据库挖掘、序列保守性分析、晶体结构模拟分析，获得了5条潜在具有催化二羟丙酮和3‑磷酸甘油醛合成果糖‑6‑磷酸的醛缩酶FSA，进一步研究发现得到耐受羟基乙醛，且针对3‑磷酸甘油醛的催化效率是甲醛的10倍的果糖‑6‑磷酸醛缩酶CsFSA。还通过定点突变提升该醛缩酶活性的突变体CsFSAA165G。由此还构建了人工转化一碳合成果糖‑6‑磷酸的高效合成体系，因此具有较大的应用价值。