本发明提供了含重组碱性磷酸酶的酵母细胞在制备治疗肠道疾病和提高肠道免疫力的药物中的用途；同时，本发明也提供了以酵母细胞为载体将重组碱性磷酸酶递送至肠道的给药方法。本发明源于本发明人在全球的首次发现，即各种酵母表达的分泌型重组碱性磷酸酶都有一定比例滞留在细胞内且不断积累，只要分泌到胞外的重组碱性磷酸酶有活性，胞内积累的部分就有活性。本发明人是实验以酵母细胞为载体将重组碱性磷酸酶递送至人或动物肠道用于治疗疾病和提高肠道免疫力而且观察到效果的第一人，并提供了实验结果。