本发明公开了运用网络药理学确定岩藻多糖抗肥胖合并Ⅱ型糖尿病作用机制的方法，1)通过SuperPred、Genecard等在线数据库分析获得岩藻多糖药理靶点及Ⅱ型糖尿病、肥胖疾病靶点；2)将岩藻多糖治疗肥胖合并Ⅱ型糖尿病靶点取交集得到药物‑疾病交集靶基因靶点并构建相关蛋白互作网络筛选核心靶点；3)进一步利用R语言相关包对核心靶点进行基因本体GO生物过程和KEGG通路富集分析；4)进行分子对接验证活性成分与核心靶点对应蛋白的对接合理性；5)岩藻多糖体内抗肥胖合并Ⅱ型糖尿病动物实验结果提示，岩藻多糖显著改善高脂饮食喂养下糖尿病小鼠的体重增长，棕色脂肪产热增加，白色脂肪沉积减少。