本发明提供一种试验模型刚度效应补偿方法及系统，所述方法包括：确定初始的试验模型，对所述初始的试验模型的工况加载点进行荷载分级加载，获取各级荷载对应的试验模型变形量；确定标准模型，基于所述初始的试验模型的工况加载点确定所述标准模型的工况加载点，对所述标准模型的工况加载点进行荷载分级加载，获取各级荷载对应的标准模型变形量；基于所述试验模型变形量和标准模型变形量计算所述初始的试验模型的补偿力值；基于计算得到的所述补偿力值对所述初始的试验模型进行刚度效应补偿得到补偿后的试验模型。本发明能够提高试验模型的性能试验结果的准确性。