本发明属于基因工程领域，涉及一种广盐性嗜盐古菌蛋白酶C端延伸突变体的制备方法及其应用；步骤为：以嗜盐古菌的基因组为模板，通过Overlap PCR技术获得HlyAHap与HlyBHap的CTE融合表达蛋白的编码基因hlyAHap‑hlyBHapCTE，记为hlyAHap‑CTE，其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。然后将hlyAHap‑CTE连接到载体上构建重组质粒，并将其转化原核宿主，诱导表达后对其进行镍亲和层析纯化和透析复性，孵育后得到嗜盐古菌蛋白酶C端延伸突变体，记为HlyAHap‑CTE。本发明得到了稳定性良好的广盐性蛋白酶，可以作为生物催化剂广泛应用于食品、医药、化工等工业领域。