本发明属于航空检测技术领域，本发明提供了一种基于航空发动机的油气分离器的故障识别方法及系统，包括：获取油气分离器在运行监测时段内不同转速下运行时的噪音数据并分析，得到运行异常值YC，根据运行异常值YC对油气分离器的疑似异常程度进行判断，获取环境噪音数据并分析，得到环境影响值HJ，根据环境影响值HJ确定环境噪音对油气分离器运行监测的影响程度，基于影响强信号，则将环境异常时段在运行监测时段中进行去除，得到运行监测正常时段，获取运行监测正常时段内的油气分离器的第二运行异常值DYC，将第二运行异常值与第二运行异常阈值进行比较，判断油气分离器是否真正异常，提高了油气分离器的故障检测精度。