本发明涉及船舶通行调度技术领域，尤其涉及一种船舶航道通行管理系统。包括：信息获取模块，用以获取航道信息和船舶信息；区域划分模块，用以构建航道节点参数；船舶分类模块，用以对船舶类型进行分析；船舶分析模块，用以对船舶位置参数进行分析；航行分析模块，用以对预计相遇时间、相遇船舶数量和宽度余量进行分析；航道分析模块，用以根据船舶信息、航道节点参数和船舶位置参数对深度安全参数进行分析，还用以根据航道节点参数和船舶信息对起始安全参数进行分析；调度分析模块，用以对载重安全参数和船舶调度参数进行分析；调度管理模块，用以管理船舶信息。本发明实现了对船舶航道通信的精确调度。