本发明提供一种多层FPC的层间对准度测量方法，包括步骤S1、提供多个线路板，该线路板上具有第一开窗和靶标圆环，从俯视方向看，所述靶标圆环位于所述第一开窗区域内，所述多个线路板的靶标圆环的直径不同；S2、将多个线路板进行叠板得到多层FPC板，使所述靶标圆环按照直径由大致小依次排列，使叠板后，每一层线路板的靶标圆环均能够通过上一层线路板的第一开窗观察到；S3、将制备得到的多层FPC板置于测试台上，使用影像测量仪器测量所述靶标圆环的对准度数据，得到相邻叠层线路板上的两个所述靶标圆环之间的间距数据，根据得到的间距数据，从而判断叠层线路板之间的对准度情况。