本发明公开了一种基于特征融合的图像处理方法及系统，应用于图像智能处理技术领域，方法包括：形成预处理图像；提取GLCM特征图；提取第一特征和第二特征；形成第一交叉投影特征和第二交叉投影特征；对第一交叉投影特征和第二交叉投影特征进行特征融合形成具有融合特征的图像。本发明有效缓解在基于深度学习的医学图像处理中面临的数据集较小、DRR影像成像情况复杂的问题，改善了传统卷积神经网络在提取特征时的局部信息感受能力，平滑模型的损失景观，提高模型的特征提取能力，抗噪能力，较好的应对医学图像数据集样本不均衡的问题、样本少的问题，拥有较好的泛化能力。