靶向amyloid-beta结构的肽配基及应用

    公开(公告)号:CN113072618B

    公开(公告)日:2023-10-20

    申请号:CN202110361512.0

    申请日:2021-04-02

    IPC分类号: C07K7/06 A61K38/08 A61P25/28

    摘要: 本发明涉及一种靶向amyloid‑beta结构的肽配基及应用,借助于计算机辅助设计,在靶向amyloid‑beta晶体结构的基础上,通过分子对接虚拟筛选技术,搜寻虚拟肽配基数据库中与靶标蛋白结合模式与亲和力最佳的肽配基P2702,其序列为RERWCC。固相合成RERWCC,利用Aβ1‑42蛋白标品分别进行硫磺素T ThT荧光、表面等离子共振和细胞毒性实验,结果表明,肽配基P2702对Aβ1‑42蛋白聚集有良好的结合能力,由此证明,借助本发明设计而成的肽配基,可用于抑制Aβ1‑42聚集的毒性。

    一条抑制猪病毒性腹泻病毒的多肽及其序列

    公开(公告)号:CN116496348A

    公开(公告)日:2023-07-28

    申请号:CN202310066990.8

    申请日:2023-01-13

    摘要: 本发明借助于机器学习模型,针对PEDV Nsp5蛋白晶体结构的解析,通过多肽虚拟筛选技术,筛选到与靶标蛋白具备潜,其多肽序列为KYRRQH(177080)。人工固相合成177080序列,并利用人工表达的PEDV Nsp5蛋白,借助ELISA实验对多肽进行筛选;借助表面等离子共振实验(SPR)鉴定多肽与靶蛋白的亲和力常数;通过CCK‑8试剂盒检验多肽177080对细胞毒性;借助荧光定量PCR和间接免疫荧光实验试验其抑制病毒感染的活性,结果表明177080可显著抑制PEDV的感染。

    基于结构的肽配基与靶蛋白平衡解离常数评估模型

    公开(公告)号:CN115331729A

    公开(公告)日:2022-11-11

    申请号:CN202210993384.6

    申请日:2022-08-18

    摘要: 本发明提供一种基于结构的针对肽配基分子与靶蛋白的平衡解离常数评估模型,包括:肽配基平衡解离常数数据的获取;肽配基与其受体蛋白相互作用关系特征数据获取;用于算法系统构建的数据集:靶向IgG系列多肽特征库和靶向αβ42系列多肽特征库的构建,独立验证数据集的构建;使用靶向IgG系列多肽特征库构建机器学习算法分类器系统,优化相关参数并用靶向αβ42系列多肽特征库进行测试并评估系统性能;使用构建的相关独立数据集对系统实际预测性能进行评估。本发明利用虚拟筛选的方法对肽配基与靶标蛋白相互作用区域进行研究,将进一步提高药物筛选效率并降低相应成本。