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公开(公告)号：CN106566850A
公开(公告)日：2017-04-19
申请号：CN201610976350.0
申请日：2016-11-07
申请人： 上海交通大学
CPC分类号： C12P13/001 , C12N9/1096 , C12N15/76 , C12Y206/01
摘要： 本发明公开了一种井冈霉烯胺的生物制备方法；包括在体外条件下用氨基转移酶WecE完成井冈霉烯酮向井冈霉烯胺的生物转化，或是将WecE基因整合入可以产生井冈霉烯酮前体化合物的菌株，使整合有WecE基因的菌株直接通过发酵生产井冈霉烯胺。本发明解决了制备井冈霉烯胺的化学合成方法所固有的反应步骤多、收率低、反应条件苛刻及有机试剂污染等缺陷；基于具有氨基转移酶催化的氨基转移反应，建立了方便、高效、立体选择性强的井冈酶烯胺直接生物合成策略，为II型糖尿病临床药物伏格列波糖、阿卡波糖的合成及糖苷酶抑制剂药物开发提供了合成中间体。
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公开(公告)号：CN105218583B
公开(公告)日：2017-03-29
申请号：CN201510573534.8
申请日：2015-09-10
申请人： 上海交通大学
摘要： 本发明属于酶工程领域，公开了一种基于羧基香豆素的磷酸三酯酶荧光底物，以及基于该底物的磷酸三酯酶的高通量筛选方法。该方法为磷酸三酯酶的体外区室化-荧光激活细胞分选超高通量筛选技术。本发明基于羧基香豆素的磷酸三酯酶底物，反应后的荧光产物具有非常好的液滴保留性，在进行酶活性定量与筛选中具有灵敏度高、定量准确的优点。底物和反应产物之间亲水性的差异，使底物可以加入外水相中并通透油相进行酶反应；生成的产物由于亲水性提高而保留在液滴中，从而实现“液滴荧光捕获”的效应，准确地控制反应时间、降低荧光背景干扰、提高筛选准确性。
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公开(公告)号：CN102796714A
公开(公告)日：2012-11-28
申请号：CN201210015196.2
申请日：2012-01-18
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： C12N9/16 , C12N15/55 , C12N1/21 , A62D3/02 , C12R1/19 , A62D101/04 , A62D101/28
摘要： 本发明提供了一种磷酸三酯酶突变体及其制备方法和应用。本发明由来源于嗜热细菌的Geobacillus kaustophilus HTA426的磷酸三酯酶基因出发，利用易错PCR的方法，经过多轮的突变和筛选，最终获得一个磷酸三酯酶活力显著提高的突变体，在该突变体的氨基酸序列中涉及到的突变为：Phe28Ile、Tyr99Leu、Thr171Ser、Phe228Leu、Asn269Ser、Val270Gly、Trp271Cys、Gly273Asp。突变体对于几种常见的有机磷杀虫剂的比活力相比野生型得到了显著提高，在有机磷毒物的生物降解领域具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN102660517A
公开(公告)日：2012-09-12
申请号：CN201110406922.9
申请日：2011-12-08
申请人： 上海交通大学
摘要： 本发明提供了一种热稳定性提高的脂肪酶突变体及其构建方法。热稳定性提高的脂肪酶突变体由南极假丝酵母脂肪酶B基因出发，运用多轮定点饱和突变而获得；所述南极假丝酵母脂肪酶B具有SEQ ID No：1所示的氨基酸残基序列；所述脂肪酶突变体具有SEQ ID No：2、SEQ ID No：3或SEQ ID No：4所示的氨基酸残基序列，SEQ ID No：2、SEQ ID No：3和SEQ ID No：4均由317个氨基酸组成。本发明运用半理性设计的方法，对南极假丝酵母脂肪酶B基因进行多轮定点饱和突变，获取脂肪酶突变体，这些突变体包含氨基酸突变D223G、L278M及它们的组合。以各自的T5015及48℃的半衰期t1/2来表示，脂肪酶突变体的热稳定性得到了提高。具有较高的实际应用价值和广阔的市场前景。
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公开(公告)号：CN114164194B
公开(公告)日：2024-04-02
申请号：CN202111319543.6
申请日：2021-11-09
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： C12N9/22 , C12N15/55 , C12N9/14 , C12N15/63 , C12N15/113
摘要： 本发明涉及施氏假单胞杆菌来源的PsPIWI‑RE核酸酶及其应用，属于生物技术领域。本发明以PIWI‑RE家族为对象，首次公开施氏假单胞杆菌(Pseudomonasstutzeri DSM 4166)来源的PIWI‑RE(PsPIWI‑RE)的核酸酶催化特性和作用机制。本发明公开的蛋白、核酸、多酶体系、试剂盒和方法能够对细胞内和细胞外的遗传物质进行位点特异性修饰，为开发基于原核生物来源PIWI‑RE介导的基因编辑、修饰及分子检测技术提供了一种新工具，可应用于核酸检测、基因编辑和基因修饰等生物技术领域。该研究首次阐明PIWI‑RE蛋白工作模式，对于拓展对PIWI超家族的认识，挖掘PIWI家族的新型基因编辑酶具有重要的意义。
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公开(公告)号：CN117384981A
公开(公告)日：2024-01-12
申请号：CN202210822665.5
申请日：2022-07-12
申请人： 上海交通大学
摘要： 本发明提供了南极假丝酵母脂肪酶B和突变体及其制法和应用。具体地，本发明涉及一种南极假丝酵母脂肪酶B的体外定向进化及催化高效合成内酯类化合物。本发明的脂肪酶是来自南极假丝酵母的脂肪酶B(CalB)及其突变体(包括对催化合成内酯类化合物活性显著提高的脂肪酶B突变体)。本发明还提供了体外环化缩合反应方法，包括步骤：在南极假丝酵母的脂肪酶B(CalB)或其突变体存在下，使得特定底物发生环化缩合反应转化为内酯类化合物。本发明的酶和突变体可用于体外酶法合成内酯类化合物。
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公开(公告)号：CN116694816A
公开(公告)日：2023-09-05
申请号：CN202210179759.5
申请日：2022-02-25
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12N15/11
摘要： 本发明提供了一种SARS‑CoV‑2、甲型流感病毒和乙型流感病毒核酸等温多重检测试剂及检测方法。本发明的检测方法包括：经特别设计优化的等温扩增引物，与酶切试剂进行偶联，从而建立一种检测试剂及检测方法。本发明具有多重、快速、便携的优势，弥补了等温检测特异性不高、多重检测困难的缺陷，可准确区分鉴别症状相似的SARS‑CoV‑2、甲型流感病毒和乙型流感病毒感染病例，为精准防控疫情提供有力支持。
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公开(公告)号：CN114085892B
公开(公告)日：2023-07-28
申请号：CN202111437007.6
申请日：2021-11-30
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： C12Q1/6844
摘要： 本发明涉及用于检测靶标核酸分子的可视化检测体系、试剂或试剂盒及检测方法，其中用于检测靶标核酸分子的可视化检测体系，包含向导ssDNA(gDNA)，死亡基因编辑酶Clostridium perfringens Argonaute(dAGO)和呈递脱氧核酸(DNAer)。与现有技术相比，本发明核酸检测方法灵敏度高、特异性好、价格低廉，可广泛应用于分子医学诊断、食品安全检测以及环境监测等诸多领域。
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公开(公告)号：CN108498523B
公开(公告)日：2023-06-20
申请号：CN201710102185.0
申请日：2017-02-24
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： A61K31/7028 , A61P25/00 , C12P19/44
摘要： 本发明涉及到一组含有不饱和脂肪酸链的神经节苷脂衍生物在促进神经突起生长中的应用。通过鞘脂神经酰胺N‑去酰基化酶酶法合成带有不饱和脂肪酸链的神经节苷脂衍生物库，结合经典的促神经突起生长的细胞模型，发现带有不饱和脂肪酸链的神经节苷脂衍生物具有显著提高的促神经突起生长的生物学活性，且神经节苷脂鞘氨醇碱基的碳链数量的不同也对其促神经突起生长的生物学活性有显著影响。
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公开(公告)号：CN114164194A
公开(公告)日：2022-03-11
申请号：CN202111319543.6
申请日：2021-11-09
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： C12N9/22 , C12N15/55 , C12N9/14 , C12N15/63 , C12N15/113
摘要： 本发明涉及施氏假单胞杆菌来源的PsPIWI‑RE核酸酶及其应用，属于生物技术领域。本发明以PIWI‑RE家族为对象，首次公开施氏假单胞杆菌(Pseudomonasstutzeri DSM 4166)来源的PIWI‑RE(PsPIWI‑RE)的核酸酶催化特性和作用机制。本发明公开的蛋白、核酸、多酶体系、试剂盒和方法能够对细胞内和细胞外的遗传物质进行位点特异性修饰，为开发基于原核生物来源PIWI‑RE介导的基因编辑、修饰及分子检测技术提供了一种新工具，可应用于核酸检测、基因编辑和基因修饰等生物技术领域。该研究首次阐明PIWI‑RE蛋白工作模式，对于拓展对PIWI超家族的认识，挖掘PIWI家族的新型基因编辑酶具有重要的意义。
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