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公开(公告)号：CN117007789A
公开(公告)日：2023-11-07
申请号：CN202310734833.X
申请日：2023-06-20
申请人： 交弘生物科技(上海)有限公司 , 上海交通大学
IPC分类号： G01N33/53 , G01N33/543 , G01N33/577 , G01N33/58 , C12Q1/686 , G01N33/569 , C12Q1/70 , C12R1/93
摘要： 本发明公开了一种基于Argonaute的多重免疫层析核酸检测方法及应用，包括步骤：一，对核酸样品进行等温多重扩增；二，在扩增产物加入Argonaute、向导ssDNA和探针进行剪切；三，将剪切产物滴加于免疫层析侧流片，所述试纸设有若干条检测线和质控线，观察检测线和质控线的颜色，确定检测结果。本发明采用Argonaute级联剪切与免疫层析相结合的方法，通过特别的探针修饰和层析侧流片设计，实现了一条免疫层析侧流片的多重核酸检测，并应用于SARS‑CoV‑2、甲型流感、非洲猪瘟和Actin‑β基因检测中，相比于已有技术灵敏度更高、特异性更强，且操作简便，无仪器局限性，有重要的应用价值。
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公开(公告)号：CN117004679A
公开(公告)日：2023-11-07
申请号：CN202210469532.4
申请日：2022-04-28
申请人： 上海交通大学
摘要： 本发明提供了南极假丝酵母脂肪酶B和突变体及其制法和应用。具体地，本发明涉及一种南极假丝酵母脂肪酶B的体外定向进化及其催化动力学拆分(R,S)‑1,4‑苯并二噁烷‑2‑甲酸甲酯合成手性药物中间体的应用及其条件优化。本发明还提供了体外动力学拆分反应的方法。本发明的酶和突变体可用于体外酶促合成(R)‑或(S)‑1,4‑苯并二噁烷类分子。
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公开(公告)号：CN113201578B
公开(公告)日：2023-06-23
申请号：CN202110474666.0
申请日：2021-04-29
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： C12Q1/6816 , C12Q1/6806 , C12N9/22 , C12N15/55
摘要： 本发明提供了一种新型高温Argonaute蛋白的表征及应用。具体地，本发明提供了一种核酸切割体系，其特征在于，所述核酸切割体系包括：(a)向导DNA(gDNA)；(b)可编程核酸内切酶Argonaute(Ago)；和(c)任选的报告核酸，其中若所述报告核酸被剪切，所述的剪切是可以被检测出的。并且，本发明还提供了基于本发明的可编程核酸内切酶TpsAgo的一种富集和检测低丰度目标核酸的体系和方法。本发明所提供的检测体系和方法能够特异性地针对低丰度的核酸进行有效富集和高效检测，并且本发明的可编程核酸内切酶TpsAgo具有强大的基因操作潜力。
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公开(公告)号：CN113046355B
公开(公告)日：2023-04-07
申请号：CN202110425454.3
申请日：2021-04-20
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： C12N15/113 , C12N9/22 , G01N21/64
摘要： 本发明提供了一种新型中温原核Argonaute蛋白PbAgo表征及应用。具体地，本发明提供了一种用于检测靶标分子的检测体系，包括：(a)向导DNA(gDNA)；(b)核酸酶Argonaute(Ago)；和(c)报告核酸，其中若所述报告核酸被剪切，所述的剪切是可以被检测出的；其中，所述的靶标核酸分子为靶标DNA。并且本发明还提供了相应的检测方法和检测试剂盒。本发明的检测体系可快速、廉价并且高效地检测小分子。
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公开(公告)号：CN109880891A
公开(公告)日：2019-06-14
申请号：CN201910324580.2
申请日：2019-04-22
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： C12Q1/6858
摘要： 本发明提供了一种基于核酸酶偶联PCR原理富集低丰度单核苷酸突变型基因的检测体系。具体地，本发明提供了一种提高目标核酸的相对丰度的方法，包括：(a)提供一核酸样本，含有目标核酸和非目标核酸，所述目标核酸在核酸样本中的丰度为F1a；(b)以核酸样本中的核酸为模板，在扩增-切割反应体系中进行PCR和核酸切割反应，从而获得扩增-切割反应产物；所述目标核酸在扩增-切割反应产物中的丰度为F1b，F1b/F1a的比值≥10。本发明具有非侵入性、易操作、快速等优势，灵敏度可以达到0.01％，样本的DNA量可以低至aM级。
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公开(公告)号：CN104313000B
公开(公告)日：2018-10-19
申请号：CN201410534600.6
申请日：2014-10-11
申请人： 上海交通大学
摘要： 本发明公开了一种基因工程木聚糖酶，其是木聚糖酶CbX的N末端截去了信号肽后的突变体，同时实现了木聚糖酶基因在异源宿主细胞内的高效表达。本发明进一步对该木聚糖酶进行改造，截去了C端的碳水化合物结合结构域，并在C末端引入二硫键，构建的木聚糖酶蛋白突变体的分子量更小，热稳定性提高，比活力也大大提高。通过以上方式，使该木聚糖酶及其突变体更有潜力应用于工业生产。
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公开(公告)号：CN108486024A
公开(公告)日：2018-09-04
申请号：CN201810232046.4
申请日：2018-03-20
申请人： 上海交通大学
发明人： 冯雁
IPC分类号： C12N1/21 , C12N15/70 , C12Q1/6897 , C12R1/19
摘要： 本发明提供了一种基于菌群的传感系统检测有机磷农药的方法，所述传感系统包括含OPH信号感应模块和含信号发生模块的基因工程菌群。其中一个用于将OPs水解成对硝基苯酚(PNP)，另一个将PNP信号转化成β-半乳糖苷酶产生用于比色检测。通过优化，该传感系统能够在28℃诱导3.5小时内以1×10-9M的浓度检测乙基对氧磷，其比单细胞全细胞传感器灵敏性高约200倍。另外，它能够检测农业中常用的多种类型的OP。此外，该传感系统可制备成检测有机磷农药用滤纸，展示了便携式现场检测的前景。本发明提供了一个敏感、快速和便携的污染物检测生物传感平台，也展示了工程微生物生态系统的实用新型环境应用。
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公开(公告)号：CN108251403A
公开(公告)日：2018-07-06
申请号：CN201611240468.3
申请日：2016-12-29
申请人： 上海交通大学 , 开平牵牛生化制药有限公司
CPC分类号： C12N9/2402 , C12P7/6436 , C12P19/44 , C12Y302/01123
摘要： 本发明涉及了一种可实现鞘糖脂内切糖苷酶EGCase I工程化表达的方法，可以有效地将EGCase I可溶性地表达，并保持有优秀的水解以及转糖苷活性；并在此基础上，进一步开发出了一种新型的EGCase I突变酶，既具有较宽的底物谱，又兼具糖苷合成酶活性；所获得的鞘糖脂内切糖苷酶非常适合应用于工业化鞘糖脂的分析与合成中。
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公开(公告)号：CN108103039A
公开(公告)日：2018-06-01
申请号：CN201611051529.1
申请日：2016-11-25
申请人： 上海交通大学
CPC分类号： C12N9/1051 , C12P19/18 , C12Y204/01065
摘要： 本发明涉及一组岩藻糖基转移酶突变体及其筛选方法和应用。本发明通过针对岩藻糖基转移酶的荧光底物设计，结合流式细胞荧光分选的高通量筛选方法，获得了一组催化活力明显提高的岩藻糖基转移酶突变体。本发明还涉及了岩藻糖基转移酶突变体在岩藻糖基化寡糖及其糖缀合物合成中的应用。
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公开(公告)号：CN104313000A
公开(公告)日：2015-01-28
申请号：CN201410534600.6
申请日：2014-10-11
申请人： 上海交通大学
CPC分类号： C12N9/2482 , C12Y302/01008
摘要： 本发明公开了一种基因工程木聚糖酶，其是木聚糖酶CbX的N末端截去了信号肽后的突变体，同时实现了木聚糖酶基因在异源宿主细胞内的高效表达。本发明进一步对该木聚糖酶进行改造，截去了C端的碳水化合物结合结构域，并在C末端引入二硫键，构建的木聚糖酶蛋白突变体的分子量更小，热稳定性提高，比活力也大大提高。通过以上方式，使该木聚糖酶及其突变体更有潜力应用于工业生产。
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