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公开(公告)号:CN118773384A
公开(公告)日:2024-10-15
申请号:CN202411253979.3
申请日:2024-09-09
申请人: 广州凯普医学检验所有限公司 , 成都凯普医学检验所有限公司 , 广东凯普生物科技股份有限公司
IPC分类号: C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , G16B20/00 , G16B25/20 , G16B35/20 , G16B50/00 , C12R1/93
摘要: 本发明公开了一种靶向病原高通量测序的人乳头瘤病毒的分型引物组及其筛选方法。本发明的引物组具有特异性高、稳定性好、不存在引物二聚体和发卡结构、低成本等优势,可应用于病原感染样本的靶向扩增、建库、靶向病原高通量测序和后续的生物信息学分析等,能够高效、准确地检测并分出多种HPV型别。
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公开(公告)号:CN117953969A
公开(公告)日:2024-04-30
申请号:CN202311747751.5
申请日:2023-12-18
申请人: 广州凯普医学检验所有限公司 , 广州凯普医学检验发展有限公司 , 广东凯普生物科技股份有限公司
摘要: 本发明涉及遗传变异检测技术领域,提供了一种线粒体疾病预测方法及线粒体疾病预测系统。其中,线粒体疾病预测方法,包括:获取待检测的第一测序数据;对第一测序数据进行突变检测,得到第一测序数据中的变异位点;根据预构建的线粒体疾病整合数据库,对变异位点进行注释,得到变异位点的基因功能信息,线粒体疾病整合数据库是通过对多个线粒体疾病数据库进行位点校正得到的;根据变异位点及其基因功能信息,利用预构建的疾病预测模型,得到第一测序数据对应的致病性预测结果。通过本发明,提高线粒体疾病预测的效率和准确性。
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公开(公告)号:CN116884550B
公开(公告)日:2024-03-22
申请号:CN202310778215.5
申请日:2023-06-28
申请人: 广州凯普医学检验所有限公司 , 广州凯普医学检验发展有限公司 , 广东凯普生物科技股份有限公司
IPC分类号: G16H10/40
摘要: 本发明提供一种多平台HPV分型检测结果智能交互校验审核及处置指引系统,包括用于生成样本数据的数据接收判断模块、用于对样本数据进行初审,获取初审样本数据的样本初审模块、用于对初审样本数据进行审核并将其分为阳性、阴性和不确定样本的单平台HPV智能审核模块、用于对不同检测平台阳性和阴性样本进行交互校验智能审核的多平台交互校验智能模块、用于对不确定样本进行情况分析并生成对应的处置方案的处置指引模块和用于接收智能审核结果或处置指引模块的不确定样本及处置方案,并生成对应的报告的报告生成模块。上述系统能发现不同平台检测结果之间的矛盾,发现并纠正其潜在错误;减少低级错误发生,提升审核准确率;显著减少标本周转时间。
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公开(公告)号:CN117727368A
公开(公告)日:2024-03-19
申请号:CN202311720495.0
申请日:2023-12-13
申请人: 广州凯普医学检验所有限公司 , 广州凯普医学检验发展有限公司 , 广东凯普生物科技股份有限公司
摘要: 本发明公开了一种自动化新型冠状病毒基因组快速分型报告系统,涉及基因检测技术领域,所述系统包括:参考数据获取模块用于从开源基因数据库中获取参考基因组数据;模式选择模块用于选择单一病毒分析模式或选择混合病毒分析模式;比对序列模块用于获取对应分析模式所需的病毒测序数据并与对应的参考基因组数据进行比对,得到序列比对文件;数据分析模块用于测序深度计算、覆盖度计算、突变检测、基因组组装、溯源分析、丰度统计中至少任一项,得到分析数据;报告生成模块用于将数据分析模块所得的分析数据输出为报告文件。本发明针对缺少能够自动、快速生成新型冠状病毒基因组分型报告的系统的问题,提高了生成新型冠状病毒基因组分型报告的效率。
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公开(公告)号:CN111560478B
公开(公告)日:2020-11-13
申请号:CN202010460533.3
申请日:2020-05-27
IPC分类号: C12Q1/70 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种一步法反转录PCR结合Sanger测序检测新型冠状病毒的试剂盒。本发明提供了能够特异性扩增新型冠状病毒COVID‑19的ORF1a、ORF1ab和3种结构蛋白(S蛋白、E蛋白、N蛋白)基因的引物组合,利用该引物组合,结合一步法反转录PCR和Sanger测序构建得到了检测新型冠状病毒COVID‑19的试剂盒,该试剂盒实现了RNA反转录和PCR扩增一步完成,简化了操作步骤、缩短了检测时间;另外,该试剂盒的检测准确度、灵敏度和特异性均高达100%,最低检出量和检测重复性均验证通过;因此,将该试剂盒应用于新型冠状病毒COVID‑19的检测具有重要的临床意义。
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公开(公告)号:CN111560478A
公开(公告)日:2020-08-21
申请号:CN202010460533.3
申请日:2020-05-27
IPC分类号: C12Q1/70 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种一步法反转录PCR结合Sanger测序检测新型冠状病毒的试剂盒。本发明提供了能够特异性扩增新型冠状病毒COVID-19的ORF1a、ORF1ab和3种结构蛋白(S蛋白、E蛋白、N蛋白)基因的引物组合,利用该引物组合,结合一步法反转录PCR和Sanger测序构建得到了检测新型冠状病毒COVID-19的试剂盒,该试剂盒实现了RNA反转录和PCR扩增一步完成,简化了操作步骤、缩短了检测时间;另外,该试剂盒的检测准确度、灵敏度和特异性均高达100%,最低检出量和检测重复性均验证通过;因此,将该试剂盒应用于新型冠状病毒COVID-19的检测具有重要的临床意义。
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公开(公告)号:CN109811042B
公开(公告)日:2020-02-07
申请号:CN201811642916.1
申请日:2018-12-29
申请人: 广州凯普医药科技有限公司 , 广州凯普医学检验所有限公司 , 广州凯普生物科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种重叠延伸PCR结合Sanger测序检测叶酸代谢相关基因突变的方法,一个用于检测叶酸代谢相关基因突变的引物组合,其核苷酸序列如SEQ ID No.1~8所示,利用本引物组合建立了本发明建立的检测方法,本发明利用重叠延伸PCR结合Sanger测序检测叶酸代谢相关基因位点单核苷酸多态性,整个过程仅需要一次PCR反应和一个测序反应,大幅度减少PCR反应数和测序反应数,就可以达到检测MTHFR和MTRR基因的与叶酸代谢相关的6个突变位点,并可以利用该方法发现扩增片段中新的变异位点。以此检测技术应用于叶酸代谢相关基因位点单核苷酸多态性检测具有重要的临床意义,不仅简化操作步骤,降低检测成本,而且提高检测效率,值得大力推广。
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公开(公告)号:CN110157781B
公开(公告)日:2020-08-21
申请号:CN201811642890.0
申请日:2018-12-29
申请人: 广州凯普医药科技有限公司 , 广州凯普医学检验所有限公司 , 广州凯普生物科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种重叠延伸PCR结合Sanger测序检测不连续多DNA位点的方法,本方法一对用于重叠延伸PCR的全长扩增的引物,其核苷酸序列如SEQ ID No.1~2所示。本发明通过一次PCR将不连续的位点连接成一条DNA片段,对这条包含多个检测位点所在片段,可以一次性进行Sanger测序分析,利用本发明可以将任意的2~4个包含各自检测位点的片段拼接连接形成融合片段,快速、简单,不需要限制性内切酶,中间无任何非目的基因的DNA序列,进而检测的检测突破了Sanger测序读长的限制,可以通过一个Sanger测序反应同时检测多个不连续的DNA位点。
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公开(公告)号:CN110157781A
公开(公告)日:2019-08-23
申请号:CN201811642890.0
申请日:2018-12-29
申请人: 广州凯普医药科技有限公司 , 广州凯普医学检验所有限公司 , 广州凯普生物科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种重叠延伸PCR结合Sanger测序检测不连续多DNA位点的方法,本方法一对用于重叠延伸PCR的全长扩增的引物,其核苷酸序列如SEQ ID No.1~2所示。本发明通过一次PCR将不连续的位点连接成一条DNA片段,对这条包含多个检测位点所在片段,可以一次性进行Sanger测序分析,利用本发明可以将任意的2~4个包含各自检测位点的片段拼接连接形成融合片段,快速、简单,不需要限制性内切酶,中间无任何非目的基因的DNA序列,进而检测的检测突破了Sanger测序读长的限制,可以通过一个Sanger测序反应同时检测多个不连续的DNA位点。
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公开(公告)号:CN109811042A
公开(公告)日:2019-05-28
申请号:CN201811642916.1
申请日:2018-12-29
申请人: 广州凯普医药科技有限公司 , 广州凯普医学检验所有限公司 , 广州凯普生物科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种重叠延伸PCR结合Sanger测序检测叶酸代谢相关基因突变的方法,一个用于检测叶酸代谢相关基因突变的引物组合,其核苷酸序列如SEQ ID No.1~8所示,利用本引物组合建立了本发明建立的检测方法,本发明利用重叠延伸PCR结合Sanger测序检测叶酸代谢相关基因位点单核苷酸多态性,整个过程仅需要一次PCR反应和一个测序反应,大幅度减少PCR反应数和测序反应数,就可以达到检测MTHFR和MTRR基因的与叶酸代谢相关的6个突变位点,并可以利用该方法发现扩增片段中新的变异位点。以此检测技术应用于叶酸代谢相关基因位点单核苷酸多态性检测具有重要的临床意义,不仅简化操作步骤,降低检测成本,而且提高检测效率,值得大力推广。
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