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公开(公告)号：CN113257371B
公开(公告)日：2022-02-15
申请号：CN202110618186.7
申请日：2021-06-03
Applicant: 中南大学
Abstract: 本发明公开了一种基于医学知识图谱的临床检验结果分析方法，包括以下步骤：S1、汇聚临床检验相关的信息资源，结合医学客观的事实，构建以检验知识为核心的医学知识图谱；S2、获取患者信息得到患者模型，获取患者的至少一个临床检验项目及结果得到临床检验项目及结果模型；S3、将所述患者模型和临床检验项目及结果模型，与所述临床检验医学知识图谱相结合，通过推理分析得到临床检验判定结果和临床意义分析；S4、汇总所有检验项目及结果的异常标记及临床意义分析，输出检验报告；本发明考虑了患者的信息，提高对患者的诊断的准确性，提升了检验报告分析效率，有效降低了漏诊及误诊率。
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公开(公告)号：CN108509768B
公开(公告)日：2022-02-11
申请号：CN201810287578.8
申请日：2018-03-31
Applicant: 中南大学
IPC: G16B20/00
Abstract: 本发明公开了一种基于蛋白质时空子网络的关键蛋白质识别方法及识别系统，包括如下步骤：步骤1：获取原始蛋白质网络；步骤2：构建不同时刻的活性蛋白质集合；步骤3：构建不同亚细胞结构中的蛋白质集合；步骤4：依据蛋白质节点之间的连接关系、不同时刻的活性蛋白质集合、不同亚细胞结构中的蛋白质集合组建各类亚细胞结构在不同时刻的时空子网络；步骤5：获取每个蛋白质节点的最大度中心性值；步骤6：按照蛋白质节点的最大度中心性对所有蛋白质节点进行降序排列，再选定排前的M个蛋白质节点作为预测的关键蛋白质。通过上述方法能够提高关键蛋白质的识别准确率。
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公开(公告)号：CN108491687B
公开(公告)日：2021-07-13
申请号：CN201810242418.1
申请日：2018-03-22
Applicant: 中南大学
Abstract: 本发明公开了一种基于contig质量评估分类及图优化的scaffolding方法，采用序列比对信息以及contig的GC含量信息对contig集合进行质量评估并分类，再将每个contig作为一个节点，根据双端读数比对到contig上的数量期望值以及实际值之间的差异判断是否在两个节点之间构建边，并计算边的权值，构建加权的scaffold图。最后通过为节点分配方向以及剪切节点来消除scaffold图中的方向冲突，通过为节点分配顺序来消除scaffold图中的顺序冲突。本发明简单易用，在四组真实测序数据上表现出良好的拼接结果，较其他序列拼接方法具有更高的F‑score值。
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公开(公告)号：CN108804871B
公开(公告)日：2021-06-25
申请号：CN201710301362.8
申请日：2017-05-02
Applicant: 中南大学
IPC: G16B15/00
Abstract: 本发明公开了一种基于最大邻居子网的关键蛋白质识别方法，首先根据亚细胞定位信息对获得的蛋白质相互作用网络进行子网划分，位于相同亚细胞位置的蛋白质被划分到相同的子网，从而得到多个在同一亚细胞区间内具有相互作用关系的蛋白质子网络。然后对每个蛋白质对应的所在的最大子网进行拓扑特征分析,计算其基于共同邻居的关键性综合评分值，分值越高表示该蛋白质越趋向于是关键的，从而利用得分排序来预测潜在的关键蛋白质。本发明在简单实用的基础上，能够很好的提高关键蛋白质识别的准确率，为研究人员进行关键蛋白质的实验分析和更深层次的研究提供重要的参考价值和实用价值。
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公开(公告)号：CN112937652A
公开(公告)日：2021-06-11
申请号：CN202110350242.3
申请日：2021-03-31
Applicant: 中南大学湘雅医院
Abstract: 本发明公开一种设备转运车，包括控制器、架体和至少一连接盘，架体的底部设置万向轮；各连接盘间隔设置于架体内，各连接盘沿万向轮向架体的顶部方向间隔设置；各连接盘背离万向轮的一侧形成容纳区域，容纳区域内用于容纳医疗器械；各连接盘背离万向轮的一侧设置电控盖体，电控盖体用于开闭容纳区域，以使容纳区域与外部隔绝；架体靠近万向轮的位置设置第一控制按钮，控制器分别信号连接第一控制按钮和电控盖体，第一控制按钮用于向控制器发送第一控制信号，以使控制器控制电控盖体的开闭。本发明提出技术方案中以使整个电控盖体的开启或关闭过程无需人手直接接触，有效的杜绝了交叉感染的风险。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110066862B
公开(公告)日：2021-02-12
申请号：CN201910428254.6
申请日：2019-05-22
Applicant: 中南大学
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于高通量测序读数的重复DNA序列识别方法，包括：由高通量测序的读数得到高频k‑mer集合，根据高频k‑mer集合对读数进行筛选，使得包含高频k‑mer较多的读数保留下来，成为高频读数；使用序列组装工具组装高频读数，得到contigs序列；对contigs序列进行筛选，保留下的所有contigs序列即为重复DNA序列。本发明可以从高通量测序读数中识别重复DNA序列，而无需物种参考序列，可以适用于参考序列未知的物种的重复DNA序列识别，并且本发明是通过组装高频读数得到重复DNA序列，相对于组装高频k‑mer得到重复DNA序列，提高了识别重复DNA序列的准确率。
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公开(公告)号：CN111223523A
公开(公告)日：2020-06-02
申请号：CN202010013036.9
申请日：2020-01-06
Applicant: 中南大学
Abstract: 本发明公开了一种基于多时滞因果熵的基因调控网络构建方法及系统，对输入的时间序列基因表达数据划分成不同时滞下的时间窗口；对t个时间片的基因表达数据，分别构建t-τ个时间窗口下的基因表达矩阵，对每一对基因，计算t时间窗口下的目标基因与之前t-τ个时间窗口下基因的多时滞转移熵，得到一个多时滞下的基因相关性矩阵，矩阵的元素代表基因之间存在边的概率，并对矩阵通过k-means将边聚类分成两类，过滤掉低概率的边簇，对剩下的每条边计算在条件基因下的多时滞条件转移熵，对最大因果熵小于阈值的间接调控的边过滤掉，获得最终的网络结构。本发明有效提高了推断的准确性。
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公开(公告)号：CN111161796A
公开(公告)日：2020-05-15
申请号：CN201911395614.3
申请日：2019-12-30
Applicant: 中南大学
Abstract: 本发明涉及一种预测PD潜在gene和miRNA的方法及系统，该方法先对不同的已知gene之间的边的权值和已知gene与候选gene之间的边的权值进行打分，然后计算得到不同的已知miRNA之间的边的权值和已知miRNA与候选miRNA之间的边的权值，再然后对gene和miRNA之间的边的权值赋值，接着构建邻接矩阵A，最后通过算法填充矩阵A得到矩阵X，矩阵X对角线上待填充元素的值的大小即为与PD关联程度的大小。本发明利用gene存在着相互关系越强的gene所调控的蛋白质功能越相近，功能越相近的蛋白质导致的疾病越相似的特性，构建出低秩矩阵A，在使用算法填充矩阵A，使得预测结果更准确。
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公开(公告)号：CN110544510A
公开(公告)日：2019-12-06
申请号：CN201910473254.8
申请日：2019-05-31
Applicant: 中南大学
IPC: G16B30/10
Abstract: 本发明公开了一种新的基于邻接代数模型及质量评估的contig集成方法，提出了一种新的全局打分函数，采用双端读数以及contig集合之间的比对质量，覆盖度信息contig集合进行整体打分及排序。在邻接代数模型的基础上构建邻接图，并通过提取共识序列形成节点与边。利用contig的覆盖度几GC含量信息对contig进行质量等级评估，并将评估信息用于邻接图的优化。本发明简单易用，在四组真实测序数据上表现出良好的拼接结果，较其他contig集成方法具有更高的NGA50值以及更低的错误率。
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公开(公告)号：CN110322927A
公开(公告)日：2019-10-11
申请号：CN201910712069.X
申请日：2019-08-02
Applicant: 中南大学
Abstract: 本发明公开了一种CRISPR诱导RNA文库设计方法，包括以下步骤：步骤一、根据参考基因组生成kmer集合；步骤二、将kmer切分成kmer1和kmer2两部分，将对应的kmer1相同的kmer2分成一个类别；再将同一类别的kmer2构建到同一个检索树中，各检索树的键序列为其中kmer2对应的kmer1；步骤三、并行获取诱导RNA及其脱靶序列，该步骤中，在比对一个kmer与检索树的键序列和其中的kme2连接成的kmer时，首先将该kmer的kmer1与检索树的键序列比对，看是否满足设定条件，满足则继续比对kmer的kmer2与检索树中的kmer2。本发明提高了计算效率。
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