公开(公告)号：CN111223521B

公开(公告)日：2023-04-25

申请号：CN202010008463.8

申请日：2020-01-06

Applicant: 广州大学

Inventor： 刘文斌

IPC: G16B20/00

Abstract: 本发明公开了一种基于可变剪接差异的基因分析方法、系统、装置及介质。该方法通过从样本集中获取基因数据，基于所述基因数据，分别获取单个基因各个异构体在癌症和正常状态下的表达量，然后通过散度对基因每个异构体在癌症和正常状态下的表达差异进行分析，得到基因的散度值，最后对各个基因的散度值进行排序，并输出散度值大于预设散度阈值的基因数据。该系统包括获取模块、处理模块、分析模块和排序模块。通过使用本发明中的方法，能够方便高效地分析在可变剪接整体上发生显著变化的紊乱基因，更快速地定位出潜在的癌症相关基因，整个过程简单，计算复杂度低。本发明可广泛应用于生物基因技术领域内。

公开(公告)号：CN109033750B

公开(公告)日：2021-11-16

申请号：CN201810787841.X

申请日：2018-07-18

Applicant: 广州大学

Inventor： 刘文斌 ,  许鹏 ,  吴倩 ,  昝乡镇

IPC: G16B50/00 ,  G16B25/10

Abstract: 本发明公开了一种量化miRNA对相关疾病基因影响程度的方法，包括如下步骤：①确定miRNA‑mRNA调控关系表；②基因差异表达分析，确定显著差异变化的基因；③计算miRNA表达变化矩阵(ΔEmiR)和mRNA表达变化矩阵(ΔEGene)；④根据miRNA表达变化矩阵及miRNA‑mRNA调控关系表，计算所有miRNAs对靶基因mRNA的协同效应(ΔR)；⑤计算mRNA表达变化与ΔR之间的皮尔森相关系数，获得显著负相关的基因；⑥计算单个miRNA对相应靶基因mRNA的影响。本发明考虑多个miRNAs对靶基因mRNA的协同作用效果，并提出了量化miRNA对其影响的方法。该方法对于筛选在疾病发生发展中起到关键作用的miRNA具有重要的意义。

公开(公告)号：CN108399191B

公开(公告)日：2021-06-15

申请号：CN201810074423.6

申请日：2018-01-25

Applicant: 广州大学

Inventor： 刘文斌 ,  叶晓峰 ,  成鹏

IPC: G06F16/9535 ,  G06Q50/26 ,  G06Q30/02

Abstract: 本发明实施例公开了一种招标信息的个性化推荐方法，包括当新标A产生时，借助标的资质信息、金额信息及区域信息，计算标A与其他标的相似度，找出与标A相似度最高的k个标作为种子节点；从种子节点出发使用基于频度的推荐算法或基于随机游走的PersonalRank算法寻找可能参标的企业,生成参标企推荐业列表。实施本发明，能降低算法复杂程度，避免招标信息的盲目推送，减轻了招标人员的工作量。