一种测试植物品种实质性派生关系的方法

    公开(公告)号:CN104805185A

    公开(公告)日:2015-07-29

    申请号:CN201510148657.7

    申请日:2015-03-31

    Abstract: 本发明公开了一种测试植物品种实质性派生关系的方法。该方法包括:获得变异位点;确定测试区域;抽样提取并获得抽样样本的DNA;制备引物;利用所述引物分别对两个抽样样本的DNA进行扩增,分别得到两个待测品种在测试区域的扩增产物用于构建两个待测品种的高通量测序文库;对两个高通量测序文库分别进行高通量测序,分别得到两个所述待测品种的测序片段组;分析两个测序片段组,分别获得两个待测品种基因型;比较两个待测品种基因型,获得待测品种间差异基因型的比例;根据待测品种间差异基因型的比例,判断两个待测品种的实质性派生关系。该方法能够准确、快速且简单地判断待测品种间的实质性派生关系。

    一种测试纯系水稻新品种的特异性、一致性与稳定性的方法

    公开(公告)号:CN104805184A

    公开(公告)日:2015-07-29

    申请号:CN201510148635.0

    申请日:2015-03-31

    CPC classification number: C12Q1/6869 C12Q2537/143 C12Q2535/122

    Abstract: 本发明公开了一种测试纯系水稻新品种的特异性、一致性与稳定性的方法,具体包括:获得变异位点;确定待测水稻品种的测试区域;构建数据库;确定抽样量后,随机抽样混合并提取混合样本的DNA;制备引物;利用引物对混合样本的DNA进行扩增,扩增产物用于构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;分析测序片段组,获得待测水稻品种基因型和杂株基因型;比较获得近似品种、变异位点和变异位点率;将杂株基因型与数据库中的基因型比较,获得杂株品种后,计算杂株率;利用变异位点、变异位点率和杂株率,判断待测水稻品种特异性、一致性和稳定性。该方法能够准确、完整地判断待测水稻品种的特异性、稳定性与一致性。

    一种测试纯系植物新品种的特异性、一致性与稳定性的方法

    公开(公告)号:CN104805183A

    公开(公告)日:2015-07-29

    申请号:CN201510148634.6

    申请日:2015-03-31

    Abstract: 本发明公开了一种测试纯系植物新品种的特异性、一致性与稳定性的方法,具体包括:获得变异位点;确定待测品种的测试区域;构建数据库;确定抽样量后,随机抽样混合并提取混合样本的DNA;制备引物;利用引物对混合样本的DNA进行扩增,扩增产物用于构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;分析测序片段组,获得待测品种基因型和杂株基因型;比较获得近似品种、变异位点和变异位点率;将杂株基因型与数据库中的基因型比较,获得杂株品种后,计算杂株率;利用变异位点、变异位点率和杂株率,判断待测品种特异性、一致性和稳定性。该方法能够准确、完整地判断待测品种的特异性、稳定性与一致性。

    水稻的白叶枯病抗性的鉴定方法

    公开(公告)号:CN103184286B

    公开(公告)日:2014-08-06

    申请号:CN201310091652.6

    申请日:2013-03-21

    Applicant: 江汉大学

    Abstract: 本发明公开了一种水稻的白叶枯病抗性的鉴定方法,属于生物技术领域。所述方法包括:接种待测水稻和感病水稻;分离待测水稻和感病水稻中miRNA基因;检测miRNA397a基因位点的表达;判定待测植株是否抗白叶枯病。所述的miRNA397a基因位点在鉴定水稻的白叶枯病抗性中的应用。本发明首次利用miRNA397a基因位点的转录鉴定水稻是否具有白叶枯病抗性,并获得了成功,本发明提供的miRNA397a基因位点的转录是建立在表达水平上的检测,避免了由白叶枯病的抗性基因沉默而造成的误判,本发明的鉴定方法未利用常规的DNA连锁标记法,避免了由于DNA连锁不紧密造成的误判,提高检测的准确性,避免了不必要的生产损失。

    一种快速、准确的检测杂交水稻种子纯度的方法

    公开(公告)号:CN102912010B

    公开(公告)日:2014-07-23

    申请号:CN201210210815.3

    申请日:2012-06-25

    Inventor: 彭海 张静 周俊飞

    Abstract: 本发明公开了一种快速、准确的检测杂交水稻种子纯度的方法,包括以下步骤:根据种子纯度要求,计算抽样样本量。等量抽样并混合提取DNA或分别提取DNA后再等量混合。按检测位点的碱基序列,设计PCR引物扩增检测位点。回收并纯化PCR扩增产物。利用扩增产物建库并进行高通量测序。根据检测位点序列比例,计算种子纯度。本发明的突出特点是:很好地满足了商品杂交种子纯度检测中对检测速度与准确性的要求。

    一种治疗钩虫的药物及其制备方法

    公开(公告)号:CN103908546A

    公开(公告)日:2014-07-09

    申请号:CN201410074069.9

    申请日:2014-03-03

    Applicant: 江汉大学

    Inventor: 张静

    Abstract: 本发明公开了一种治疗钩虫的药物及其制备方法,属于驱虫药物领域。所述药物包括:重量份为5-30的槟榔、重量份为5-30的恰玛古、重量份为2-10的苍术、重量份为5-15的白芍、重量份为5-15的大枣和重量份为5-15的黄芪。所述治疗钩虫的药物的制备方法,其特征在于,所述方法包括:将原料粉碎,所述原料包括:重量份为5-30的槟榔、重量份为5-30的恰玛古、重量份为2-10的苍术、重量份为5-15的白芍、重量份为5-15的大枣和重量份为5-15的黄芪;将粉碎后的原料加水煎煮三次,每次一个小时,将所得产物过滤,收集滤液;将所述滤液浓缩成所述治疗钩虫的药物。本发明的药物能够有效驱除钩虫。本发明提供的制备方法,其煎煮温度及浓缩温度均较低不易破坏恰玛古中的有效成分。

    一种快速、准确的检测杂交水稻种子纯度的方法

    公开(公告)号:CN102912010A

    公开(公告)日:2013-02-06

    申请号:CN201210210815.3

    申请日:2012-06-25

    Inventor: 彭海 张静 周俊飞

    Abstract: 本发明公开了一种快速、准确的检测杂交水稻种子纯度的方法,包括以下步骤:根据种子纯度要求,计算抽样样本量。等量抽样并混合提取DNA或分别提取DNA后再等量混合。按检测位点的碱基序列,设计PCR引物扩增检测位点。回收并纯化PCR扩增产物。利用扩增产物建库并进行高通量测序。根据检测位点序列比例,计算种子纯度。本发明的突出特点是:很好地满足了商品杂交种子纯度检测中对检测速度与准确性的要求。

    一种批量基因克隆的方法
    78.
    发明公开

    公开(公告)号:CN102899314A

    公开(公告)日:2013-01-30

    申请号:CN201110216435.6

    申请日:2011-07-29

    Applicant: 江汉大学

    Inventor: 彭海 张静 章伟雄

    CPC classification number: C12Q1/6869 C12Q2537/165 C12Q2539/107

    Abstract: 本发明公开了一种批量基因克隆的方法。此方法包括以下步骤:将具有多个目标性状差异的两个亲本杂交构建分离群体;分离群体中随机选择的基因克隆群体与2个亲本一起基因组高通量测序,比对2个亲本基因组,获得亲本间差异等位位点。按不同目标性状,将克隆群体的测序数据归入不同的显性池与对应的隐性池,按完全匹配的方式,比对亲本间差异等位位点序列在显性池与隐性池间的匹配情况,并计算分离比。通过统计检验,获得目标性状的候选位点。然后确定目标基因座位。通过PCR扩增克隆全长目标基因,通过遗传互补实验验证目标基因功能。本发明对同一次实验获得的测序数据进行不同的分组,即可实现克隆多个基因的目的,实现了数据的充分发掘与利用。

    一种亲本特异位点测序克隆基因的方法

    公开(公告)号:CN102899312A

    公开(公告)日:2013-01-30

    申请号:CN201110215778.0

    申请日:2011-07-29

    Applicant: 江汉大学

    Inventor: 彭海 张静 章伟雄

    Abstract: 本发明公开了一种亲本特异位点测序克隆基因的方法。其包括以下步骤:选用目标性状有差异的材料做亲本,通过两亲本杂交构建分离群体,从分离群体中选择具有隐性性状的个体构建隐性基因池;对两个亲本进行基因组高通量测序,通过初步直接组装并比对,获得显性与隐性亲本特异位点,该特异位点为目标基因的候选位点;通过富集隐性池候选位点并重测序或PCR方式逐个检查隐性池每个个体的每个候选位点的方式,确定目标基因位点;通过PCR扩增克隆全长目标基因,通过遗传互补实验验证目标基因。本发明以测序为基础,可用于任何物种,直接克隆基因本身。采用本发明的方法,工作量大为减少,速度大为加快,而且降低了风险。

    基于ISSR分子标记构建中国长豇豆遗传资源数据库的方法及其应用

    公开(公告)号:CN101436229A

    公开(公告)日:2009-05-20

    申请号:CN200810197366.7

    申请日:2008-10-23

    Applicant: 江汉大学

    Inventor: 彭海 陈禅友 张静

    Abstract: 本发明公开了一种基于ISSR分子标记构建中国长豇豆遗传资源数据库的方法及其应用,并利用数据库进行品种真假鉴定,它通过田间形态鉴定品种种内单株间的一致性与典型性,放弃分离与不典型的材料,对一致性与典型性品种的单株提取DNA;再利用高多态性的3个ISSR标记鉴定初选单株间DNA水平的一致性,最终决选构建指纹图谱的品种与单株;利用决选品种及单株对中国长豇豆品种进行ISSR分析,建立指纹图谱数据库。克服了以往在遗传标记数据库构建中的不足,如品种内不同单株间形态上分离,DNA水平上不纯合等利用本方法所构建的中国长豇豆ISSR指纹图谱数据库可靠性和准确性都大为提高,可有效方便地鉴定和区分中国长豇豆栽培品种。

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