一种单链DNA数据存储信息的随机访问方法

    公开(公告)号:CN113981053A

    公开(公告)日:2022-01-28

    申请号:CN202111114042.4

    申请日:2021-09-23

    申请人: 天津大学

    IPC分类号: C12Q1/6869 C12Q1/6806

    摘要: 本发明涉及生物信息学技术领域,尤其涉及一种单链DNA数据存储信息的随机访问方法。该方法基于茎环引物的DNA链置换反应和特异性聚合酶链式反应,实现了目标DNA的高选择性扩增,对单链DNA数据存储信息的随机访问精度明显提高。结果表明,在双碱基差异的条件下,本发明基于DNA链置换的发夹引物的访问方法对提高DNA数据存储中随机访问精度的效果明显,证明本发明基于DNA链置换反应和特异性聚合酶链式反应的两步选择法可以有效提高低正交性引物的随机访问精度。

    一种基于线性质粒载体从基因组文库中靶向克隆目标片段的方法

    公开(公告)号:CN113355338A

    公开(公告)日:2021-09-07

    申请号:CN202110620674.1

    申请日:2021-06-03

    申请人: 天津大学

    IPC分类号: C12N15/63 C12N15/10

    摘要: 本发明涉及靶向克隆技术领域,特别涉及一种基于线性质粒载体从基因组文库中靶向克隆目标片段的方法。包括:带有tos的环形质粒通过PCR扩增方式,在体外扩增并使用TelN原端粒酶酶切获得线性化的克隆载体同时,在载体两端引入与目标基因组片段侧翼相同的序列,得到高浓度线性化载体;将线性化载体与基因组文库进行体外组装,得到组装产物;在宿主基因中整合入TelN蛋白表达基因,得到整合有TelN蛋白的宿主;将组装产物转入整合有TelN蛋白的宿主中,筛选目标片段。本发明技术具有高效、靶向性强、低成本、大容量、易操作等特点。基于该发明能实现对基因组大片段的高效率一步克隆,实现最大156kb长度基因组序列的克隆。

    酿酒酵母工程菌及其在制备香草醛中的应用

    公开(公告)号:CN113201465A

    公开(公告)日:2021-08-03

    申请号:CN202110494860.5

    申请日:2021-05-07

    申请人: 天津大学

    摘要: 本发明涉及基因工程技术领域,尤其涉及酿酒酵母工程菌及其在制备香草醛中的应用。本发明在酿酒酵母BY4742的基础上,敲除ADH6、ADH7、BDH1、BDH2,并整合外源基因4CL、ECH中的至少一种;和/或敲除内源基因Ari1、GRE2、HFD1中的至少一种。本发明通过精准控制以上关键基因的转入和敲除,在酵母体内构建了一种全新的利用木质素合成香草醛生物转化路径,使代谢路径减少了香草醛合成香草、香草醇和香草酸,实现了香草醛的积累。实验表明,本发明基因工程菌可以充分利用木质素及其衍生的芳香族化合物大量生产香草醛,不仅可以解决木质素的利用问题,而且可以实现香草醛的工业化生产。

    一种酿酒酵母模块共转化组合筛选方法

    公开(公告)号:CN104419718B

    公开(公告)日:2017-07-07

    申请号:CN201310386388.9

    申请日:2013-08-29

    申请人: 天津大学

    IPC分类号: C12N15/81 C12N1/19

    摘要: 本发明公开了一种酿酒酵母模块共转化组合筛选方法,步骤为:(1)每次从待筛选的启动子元件库、基因元件库和终止子元件库中各选一个元件组装到带有不同筛选标记的质粒上得到模块,不同的模块中,相同基因元件所选筛选标记相同,由模块组成模块库;(2)对模块库中的模块进行排列组合设计;(3)利用酿酒酵母质粒共转化技术,将与设计对应的模块转入酿酒酵母底盘菌中;(4)将转化后的菌在选择缺陷型培养基上培养,得到排列组合的正确酿酒酵母转化子;(5)结合目标性状的具体特征筛选得到高效模块组合的酿酒酵母转化子。本发明的方法极大的降低了工作量、提高了所构建系统的灵活性。得到的组合不用测序,降低了成本。

    启动子文库及其构建方法
    78.
    发明公开

    公开(公告)号:CN106754866A

    公开(公告)日:2017-05-31

    申请号:CN201611061295.9

    申请日:2016-11-24

    申请人: 天津大学

    摘要: 本发明涉及生物技术领域,特别涉及一种启动子文库及其构建方法。本发明以酿酒酵母V号染色体为参考序列,批量设计引物PCR扩增启动子片段,基于IIS型限制性核酸内切酶及环形聚合酶延伸法进行连接组装,构建表征载体,转化酿酒酵母形成基本包含全染色体启动子的启动子文库,培养重组菌株以绿色荧光强度表征启动子调控状态。本发明通过联合多种组装策略实现重组表征载体的无痕构建,并对染色体尺度上启动子整体表征,可以快速系统地筛选得到实验条件下各种不同强度的启动子,此方法有利于启动子的研究、挖掘及应用。

    酿酒酵母基因组定点突变的方法

    公开(公告)号:CN105624187A

    公开(公告)日:2016-06-01

    申请号:CN201610088284.3

    申请日:2016-02-17

    申请人: 天津大学

    IPC分类号: C12N15/81 C12N1/19 C12R1/865

    CPC分类号: C12R1/865

    摘要: 本发明涉及微生物领域,特别涉及酿酒酵母基因组定点突变的方法。本发明利用CRISPR/Cas9技术修复酿酒酵母基因组上待修复的单碱基突变位点。如果该突变位点位于PAM序列(NGG)中或者PAM序列前11bp内,则可利用guide RNA引导Cas9蛋白在待修复位点附近发挥作用,将酿酒酵母基因组进行切割处双链切口,从而实现供体DNA的高效重组。本发明对比已有成果具有以下有益效果:高效、快速实现酿酒酵母基因组位点的突变;无需向酿酒酵母基因组整合筛选标记。

    酿酒酵母环形染色体的构建方法

    公开(公告)号:CN105624144A

    公开(公告)日:2016-06-01

    申请号:CN201610088968.3

    申请日:2016-02-17

    申请人: 天津大学

    CPC分类号: C12N15/1027 C12R1/865

    摘要: 本发明涉及合成生物学领域,特别涉及酿酒酵母环形染色体的构建方法。本发明利用酿酒酵母同源重组的特性,通过删除酿酒酵母染色体的端粒区来实现染色体的环化,从而获得环形染色体ringV_s和ringV_b。本发明对比已有成果具有以下有益效果:利用同源重组的方法实现对酿酒酵母染色体的人工环化;环化位点可自由选择;为环形染色体疾病的研究提供了一种新的模型。