一种基于正则化模型的数据整合方法及系统

    公开(公告)号:CN117727372A

    公开(公告)日:2024-03-19

    申请号:CN202311789980.3

    申请日:2023-12-25

    申请人: 韶关学院

    发明人: 黄海辉

    摘要: 本发明提供了一种基于正则化模型的数据整合方法及系统,其方法包括:在预设的预测模型中设置拉普拉斯正则化项和Lq范数罚项,得到DSNet模型;对DSNet模型进行转换得到转换后的DSNet模型,获得第一特征算子和第二特征算子,并将网络知识数据集和基因数据集输入至转换后的DSNet模型中,输出第一特征算子所有特征维度的最优解和第二特征算子所有特征维度的最优解;根据第一特征算子所有特征维度的最优解和第二特征算子所有特征维度的最优解,在各个特征维度上整合网络知识数据集和基因数据集,获得所述网络知识数据集和所述基因数据集的整合结果;使用正则化模型对生物学数据和网络知识数据进行整合分析,提高了高维数据整合分析的准确性和效率。

    一种单细胞转录组预测胚胎着床的方法及应用

    公开(公告)号:CN117721222A

    公开(公告)日:2024-03-19

    申请号:CN202410172651.2

    申请日:2024-02-07

    摘要: 本发明涉及医药检测领域,具体涉及一种单细胞转录组预测胚胎着床的方法及应用。所述单细胞转录组预测胚胎着床的方法,主要通过两步实现对胚胎着床潜能的预测:第一是发育潜能初步评估,即确定着床成功与着床失败的胚胎在转录组整体水平上的差异的规律,然后根据这个规律,将临床上的胚胎分为“高发育潜能组”和“低发育潜能组”;第二是发育异常的胚胎的排查,即根据染色体表达量的分布划分阈值,将染色体分为“正常表达”与“异常表达”染色体,含有“异常表达”染色体的胚胎被认为是发育异常的胚胎;可见,“高发育潜能组”中不含有“异常表达”染色体的胚胎被认为是能成功着床的胚胎。

    线粒体差异化表达特征基因在制备重度抑郁症诊断剂中的应用

    公开(公告)号:CN116904578B

    公开(公告)日:2024-03-15

    申请号:CN202310899445.7

    申请日:2023-07-21

    摘要: 本发明涉及线粒体差异化表达特征基因的表达量检测剂在制备重度抑郁症诊断剂中的应用。所述线粒体差异化表达特征基因选自PMPCB、MRPS28、LYRM2、MGST1、COX20、PTPMT1和STX17中的一种或多种组合。本发明研究了一些线粒体相关基因与重度抑郁症之间的关联,并从中挑选了7个线粒体差异化表达特征基因作为重度抑郁症的生物标志物,在此基础上,本发明进一步对这7个特征基因的表达量进行了相应地赋分,并基于上述赋分构建了重度抑郁症诊断模型,用于预测受试者患有重度抑郁症的风险。该诊断模型具有相对较好的诊断性能和临床应用价值。

    使用对基于细胞的数据的团分析将化合物与性质相关联的系统和方法

    公开(公告)号:CN117678024A

    公开(公告)日:2024-03-08

    申请号:CN202280050867.0

    申请日:2022-06-15

    摘要: 本公开涉及将测试化合物与化合物性质相关联的方法。获得一个或多个数据集,其包括:对于多个细胞系中的每一个和多种化合物中的每一种:对于每个相应的暴露条件:在所述相应的暴露条件下相应的细胞系中针对相应的化合物的对应的响应特征。对于针对相应的化合物对的暴露条件的每个独特组合,基于所述对应的响应特征来确定相关。对于每个相应的化合物对,基于经确定的相关来确定权重。形成多个化合物聚类,其中每个聚类表示满足关于特定化合物的一个或多个权重标准的化合物。根据含有所述测试化合物的一个或多个化合物聚类中的一种或多种化合物的性质来确定所述测试化合物的化合物性质。

    一种激光剥蚀等离子体质谱的纳米粒子区分数据处理方法

    公开(公告)号:CN117637024A

    公开(公告)日:2024-03-01

    申请号:CN202311593704.X

    申请日:2023-11-24

    申请人: 武汉大学

    IPC分类号: G16B25/10 G16B40/00 G01N27/62

    摘要: 本发明公开一种激光剥蚀等离子体质谱的纳米粒子区分数据处理方法。该方法包括一套由原始数据极小值点之间线性插值组成的动态基线以分离每个NPs的信号,进一步根据是否存在极大值来区分高浓度离子和NPs信号的数据处理流程,通过对所设置的条件对比后确定最佳方案,以实现LA‑sp‑ICP‑MS的实际植物原始信号中纳米粒子区分的数据处理。该方法能够对原始数据中的几乎所有纳米粒子信息进行峰面积和个数统计,主要针对于存在NPs局部集中位置或者高浓度的离子与NPs同时存在的实际生物样品,未来可以为动植物,细胞等生物样品中的NPs吸收,运输过程和离子与NPs的转化信息提供更全面,更深层次的结果。

    一种可视化癌症基因关系显示方法和系统

    公开(公告)号:CN117373547B

    公开(公告)日:2024-02-27

    申请号:CN202311676540.7

    申请日:2023-12-08

    摘要: 观向用户显示各种病源因子数据以指导相关用本申请涉及生物医学信息化技术领域,涉及 户进行癌症基因诊断。一种可视化癌症基因关系显示方法和系统,肿瘤实体节点决策肿瘤实体节点至病毒实体节点的传染轨迹信息,其中,肿瘤实体节点与病毒实体节点为一对具有关联关系的病源实体节点;当肿瘤实体节点在接收到发往表达基因实体节点的因子受体时,如果肿瘤实体节点至表达基因实体节点的已存在关系冲突,则肿瘤实体节点根据传染轨迹信息,将因子受体传递至病毒实体节点,经病毒实体节点将因子受体传递至表达基因实体节点;依据肿瘤实体节点、病毒实体节点和表(56)对比文件Delecluse H J等.Epstein-Barr virus-associated tumours: an update for theattention of the working pathologist.《Journal of clinical pathology》.2007,1358–1364.

    通路相关性的确定方法及装置、存储介质及电子设备

    公开(公告)号:CN117238381B

    公开(公告)日:2024-02-20

    申请号:CN202311522745.X

    申请日:2023-11-15

    发明人: 童浩南 张闯

    IPC分类号: G16B40/00 G16B25/10 G06F17/16

    摘要: 本申请实施例提供了一种通路相关性的确定方法及装置、存储介质及电子设备,其中,该方法包括:确定第一基因通路和第二基因通路,其中,第一基因通路中包括第一基因,第二基因通路中包括第二基因;确定用于表示第一基因的第一目标向量,并确定用于表示第二基因的第二目标向量;根据第一目标向量和第二目标向量,确定第一基因通路和第二基因通路是否相关。通过本申请,解决了通路相关性的确定效率较低的问题,进而达到了提升通路相关性的确定效率的效果。

    一种微生物鉴定方法、装置、设备及存储介质

    公开(公告)号:CN112614542B

    公开(公告)日:2024-02-20

    申请号:CN202011587660.6

    申请日:2020-12-29

    IPC分类号: G16B25/10 G16B40/10

    摘要: 本申请提供了一种微生物鉴定方法、装置、设备及存储介质,其中,该方法包括:在获取待鉴定微生物的质谱图后,确定质谱图中各谱峰在质谱图中的区域;针对每一个基准质谱图,计算该基准质谱图中各基准谱峰的质量值与质谱图中每一个谱峰的质量值的差值;针对每一个谱峰,在该谱峰对应的差值中确定在第一预设范围内的差值的数量,以将数量作为该谱峰的匹配数;计算该基准质谱图的得分;计算各得分中的最高得分在所有得分中出现的第一概率;判断第一概率是否小于预设阈值;若小于,将最高得分对应的基准质谱图显示在显示屏上;通过上述方法,有利于提高微生物鉴定的准确率。

    基于多生物标志物的土壤重金属污染风险评估方法及装置

    公开(公告)号:CN117542408A

    公开(公告)日:2024-02-09

    申请号:CN202311695771.2

    申请日:2023-12-11

    摘要: 本公开提供了一种基于多生物标志物的土壤重金属污染风险评估方法及装置。该方法包括:获取土壤中重金属元素的浓度数据;对暴露于重金属污染土壤中的生物受体进行多组学分析,得到与生物受体对应的多组学数据集;对多组学数据集进行筛选处理,得到多生物标志物数据集;根据生物受体的毒性效应特征和重金属元素的浓度数据,对多生物标志物数据集中的生物标志物进行风险等级划分,得到不同风险等级的多生物标志物数据集;根据不同风险等级的多生物标志物数据集中的生物标志物和生物标志物的权重系数,确定目标多生物标志物数据集;根据目标生物标志物对应的权重系数和目标生物标志物,对土壤重金属污染风险进行评估。