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    一种适用于小鼠心脏组织单细胞测序的组织冷冻及解冻方法
    2.
    发明授权
    一种适用于小鼠心脏组织单细胞测序的组织冷冻及解冻方法 有权 质押

    公开(公告)号：CN112438252B

    公开(公告)日：2021-06-08

    申请号：CN202011313130.2

    申请日：2020-11-20

    申请人： 上海欧易生物医学科技有限公司

    发明人： 殷昊 ,  肖云平 ,  王树伟 ,  洪强 ,  赵仕兰

    IPC分类号： A01N1/02

    摘要： 本发明公开了一种适用于小鼠心脏组织单细胞测序的组织冷冻及解冻方法。本发明所述的方法可以解决目前缺少适用于小鼠心脏组织单细胞测序的组织冻存方法这一问题，填补目前的技术空白，将有力地促进单细胞测序技术在模式动物中的广泛应用；本发明所述方法采用瞬时速冻技术，在极短的瞬间将组织样本冷冻，避免梯度降温过程中因为细胞仍然具有一定活性而造成冻存过程中转录组发生改变，结果更加准确可靠；本发明所述的方法避免进行解离、梯度冻存的复杂操作，在40分钟内即可完成组织样本的冻存，时间大大缩短，提高效率，便于开展大量样本的冻存。

    一种基于Pacbio数据的MSI微卫星不稳定性检测方法和系统
    3.
    发明公开
    一种基于Pacbio数据的MSI微卫星不稳定性检测方法和系统 有权 质押

    公开(公告)号：CN111370063A

    公开(公告)日：2020-07-03

    申请号：CN202010207692.2

    申请日：2020-03-23

    申请人： 上海欧易生物医学科技有限公司

    发明人： 王树伟 ,  肖云平 ,  史贤俊 ,  林博 ,  顾胤聪

    IPC分类号： G16B30/00

    摘要： 本发明提出了一种基于Pacbio数据的MSI微卫星不稳定性检测方法，包括以下步骤：步骤一：测序错误的校正，利用ccs软件将Pacbio测序结果的subreads校正为CCS序列，min-passes>＝10；步骤二，检测MSI-PCR上下游引物的位置，并提取产物序列；步骤三，根据MSI核心区域旁邻20bp的特异性序列，进一步提取产物序列中的核心序列；步骤四，旁邻特异性序列是反向比对的，需要对核心序列进行反向互补转化；步骤五，根据给定的microsatellite motif，检测产物序列或核心序列中motif的重复次数以及motif之间的嵌合序列；步骤六，筛选重复次数>＝3的motif，保留它们之间的嵌合序列，作为MSI序列；步骤七，统计全部MSI序列的频次和频率，过滤频率小于5％的MSI序列；考虑到肿瘤的异质性，肿瘤组织样本可以放宽过滤阈值。

    一种乳腺癌临床穿刺样本的解离方法
    4.
    发明公开
    一种乳腺癌临床穿刺样本的解离方法 有权

    公开(公告)号：CN111349603A

    公开(公告)日：2020-06-30

    申请号：CN201911281650.7

    申请日：2019-12-13

    申请人： 上海欧易生物医学科技有限公司

    发明人： 王树伟 ,  肖云平 ,  史贤俊 ,  赵仕兰

    IPC分类号： C12N5/09

    摘要： 本发明公开了一种乳腺癌临床穿刺样本解离的方法，包括样本处理、自然沉降弃上清、离心洗涤、酶解、过筛、裂红洗涤、PBS+10％FBS重悬等步骤。本发明使用自主研发的酶解方案提升了乳腺癌临床穿刺样本的细胞得率，缩短了酶解的时间，提高了细胞的得率。本发明还公开了一种用于乳腺癌临床穿刺样本解离的组织解离液。

    一种基于长片段测序检测HIV耐药位点突变序列多样性的方法
    5.
    发明公开
    一种基于长片段测序检测HIV耐药位点突变序列多样性的方法 审中-公开

    公开(公告)号：CN110714095A

    公开(公告)日：2020-01-21

    申请号：CN201810767900.7

    申请日：2018-07-12

    申请人： 上海欧易生物医学科技有限公司

    发明人： 王树伟 ,  赵仕兰 ,  肖云平

    IPC分类号： C12Q1/70 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  C12R1/93

    摘要： 本发明公开了一种基于长片段测序检测HIV耐药位点突变序列多样性的方法，涉及核酸检测领域，方法包括HIV病毒RNA抽提，利用随机引物进行反转录形成cDNA，以cDNA为模板，根据HIV的耐药位点序列所设计的引物进行第一轮PCR扩增目的片段；以第一轮PCR产物为模板，用第二轮扩增引物进行第二轮扩增得到第二轮扩增产物；以第二轮的扩增产物为模板进行第三轮扩增获得扩增产物；对第三轮扩增产物进行纯化定量，等摩尔量混合后进行三代测序文库构建并上机测序；对所得数据进行分析得到每个样本中所包含的序列信息。本发明可以高通量长读长完成多样本中混合的多分子的序列检测，提高了HIV的耐药位点的检测效果、效率及准确性。