公开(公告)号：CN116445584B

公开(公告)日：2023-09-08

申请号：CN202310707878.8

申请日：2023-06-15

申请人： 中国农业大学

发明人： 丁向东 ,  刘华涛 ,  李淑娟 ,  张梓鹏 ,  都鹤鹤 ,  邵玉如 ,  王楚端

IPC分类号： C12Q1/6809 ,  C12N15/11 ,  C12Q1/6888 ,  C12Q1/6874 ,  G16B20/20 ,  G16B30/10 ,  C40B40/06

摘要： 本发明涉及基因分子育种领域，具体涉及基于多聚单核苷酸多态性的猪10K液相芯片及其应用。本发明在保持液相芯片设计基本原则下，对已有芯片增加新标记，并利用多聚单核苷酸多态性技术对探针进行优化，产生更多分型质量高、在探针区域内与靶位点SNP连锁不平衡中等的SNP标记，提高芯片的有效标记数量。本发明的mSNP液相芯片使可检测的SNP数目增加到靶位点SNP标记数的1.5‑2倍，解决了已有芯片仅含靶位点SNP，无法提供mSNP标记的问题，且成本没有增加。通过基因型填充技术，将本发明的芯片基因型数据填充至主流的50K芯片，用于基因组选择，获得与50K芯片相同或相近的分子选种准确性，降低了猪分子育种成本。

公开(公告)号：CN116445584A

公开(公告)日：2023-07-18

申请号：CN202310707878.8

申请日：2023-06-15

申请人： 中国农业大学

发明人： 丁向东 ,  刘华涛 ,  李淑娟 ,  张梓鹏 ,  都鹤鹤 ,  邵玉如 ,  王楚端

IPC分类号： C12Q1/6809 ,  C12N15/11 ,  C12Q1/6888 ,  C12Q1/6874 ,  G16B20/20 ,  G16B30/10 ,  C40B40/06

摘要： 本发明涉及基因分子育种领域，具体涉及基于多聚单核苷酸多态性的猪10K液相芯片及其应用。本发明在保持液相芯片设计基本原则下，对已有芯片增加新标记，并利用多聚单核苷酸多态性技术对探针进行优化，产生更多分型质量高、在探针区域内与靶位点SNP连锁不平衡中等的SNP标记，提高芯片的有效标记数量。本发明的mSNP液相芯片使可检测的SNP数目增加到靶位点SNP标记数的1.5‑2倍，解决了已有芯片仅含靶位点SNP，无法提供mSNP标记的问题，且成本没有增加。通过基因型填充技术，将本发明的芯片基因型数据填充至主流的50K芯片，用于基因组选择，获得与50K芯片相同或相近的分子选种准确性，降低了猪分子育种成本。

公开(公告)号：CN118813604A

公开(公告)日：2024-10-22

申请号：CN202411034611.8

申请日：2024-07-30

申请人： 中国农业大学

发明人： 丁向东 ,  邹全 ,  李淑娟 ,  刘燕玲 ,  邵玉如 ,  李谦君

IPC分类号： C12N15/10 ,  C12Q1/6806

摘要： 本发明涉及一种高效提取猪毛DNA的方法，包括以下步骤：毛囊采集、毛囊消化、DNA的抽提、沉淀和洗涤，DNA的抽提为两次，第一次是以Tris饱和酚抽提，第二次是以饱和酚：氯仿：异戊醇＝25:24:1混合液抽提；然后在二次抽提液中加入异丙醇和10M的乙酸铵对DNA进行第一次沉淀，在沉淀物中加入冰乙醇对DNA进行第二次沉淀，之后再进行后续的洗涤等处理。使用本发明的方法能快速有效地提取杜洛克、大白猪和长白猪的猪毛DNA，且提取质量满足基因芯片测序对DNA的要求。