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公开(公告)号:CN117701725A
公开(公告)日:2024-03-15
申请号:CN202311622301.3
申请日:2023-11-30
申请人: 中国水产科学研究院黄海水产研究所 , 海南中正水产科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6888
摘要: 本发明公开了一种凡纳滨对虾快速生长分子标记LvKDZ‑S1及其应用。所述分子标记LvKDZ‑S1的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,其位于凡纳滨对虾基因组17号连锁群的2,344,760物理位置,多态位点为A/T。在凡纳滨对虾亲本促熟阶段或更早期可通过对虾须、游泳足等活体取样的方式提取基因组DNA,然后利用55K“黄海芯1号”凡纳滨对虾液相芯片检测LvKDZ‑S1位点的基因型;再根据分型结果制定亲虾留种、交配策略。所述分子标记LvKDZ‑S1可以从分子水平上对生长快速个体进行选择,不受生长阶段和个体大小的限制,且能够在早期进行选择,提高选择的准确率和效率,加快生长速度的选育进程。
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公开(公告)号:CN118895350A
公开(公告)日:2024-11-05
申请号:CN202411404254.X
申请日:2024-10-10
申请人: 中国水产科学研究院黄海水产研究所
IPC分类号: C12Q1/6879 , G16B40/20 , C12Q1/6888 , C12Q1/6813 , C12Q1/6869 , C12N15/11
摘要: 本发明提出了一种用于凡纳滨对虾性别鉴定的SNP标记组合及分子探针、试剂盒和应用,属于SNP分子标记的技术领域。本发明的SNP标记组合包括10个SNP标记,SNP标记的物理位置是基于凡纳滨对虾参考基因组序列比对确定的。本发明还给出了用于捕获上述SNP标记组合的分子探针、包括该分子探针的试剂盒以及这种试剂盒在凡纳滨对虾基因型信息测定、性别预测模型建立和性别鉴定中的应用。本发明的SNP标记数量适宜,SNP标记之间的距离合适,分布在多个Scaffold上,具有广泛的代表性,这些SNP标记的基因型信息与性别之间具有很好的关联性,由其开发的试剂盒在进行凡纳滨对虾性别鉴定时操作简单,准确率高,结果可靠。
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公开(公告)号:CN117448463A
公开(公告)日:2024-01-26
申请号:CN202311622294.7
申请日:2023-11-30
申请人: 中国水产科学研究院黄海水产研究所
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q1/6874 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种分子标记LvKDZ‑S4及其在凡纳滨对虾快速生长新品系选育中的应用。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,其位于凡纳滨对虾基因组28号连锁群上的33,937,835物理位置,多态位点为C/A。在凡纳滨对虾亲本促熟阶段或更早期可通过对虾须、游泳足等活体取样的方式提取基因组DNA,然后利用55K“黄海芯1号”凡纳滨对虾液相芯片检测LvKDZ‑S4位点的基因型;再根据分型结果制定亲虾留种、交配策略。所述分子标记LvKDZ‑S4可以从分子水平上对生长快速个体进行选择,不受生长阶段和个体大小的限制,且能够在早期进行选择,提高选择的准确率和效率,加快生长速度的选育进程。
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公开(公告)号:CN118028492B
公开(公告)日:2024-08-09
申请号:CN202410431050.9
申请日:2024-04-11
申请人: 中国水产科学研究院黄海水产研究所
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , C12N15/11
摘要: 本发明提出了一种凡纳滨对虾的SNP位点组合在其家系混合养殖性状评估中的应用及探针和试剂盒,属于对虾育种的技术领域。本发明中凡纳滨对虾的SNP位点组合包括1125个SNP位点,物理位置是基于凡纳滨对虾参考基因组序列比对确定的。本发明还给出了一种用于捕获上述SNP位点组合的分子探针以及包括该分子探针的试剂盒。本发明利用SNP位点组合进行亲子鉴定,实现了早期不同家系间个体的混合养殖,有效地降低了早期由家系单独养殖所造成的共同环境效应,提高了混合养殖性状评估结果的准确性,并且可以准确地计算个体之间的亲缘关系,与物理标记相比,不会出现个体标记脱落、错位以及人为识别错误的现象,能够获得准确无误的系谱。
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公开(公告)号:CN117344033B
公开(公告)日:2024-03-19
申请号:CN202311657079.0
申请日:2023-12-06
申请人: 中国水产科学研究院黄海水产研究所
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种凡纳滨对虾生长相关的分子标记及其应用。所述分子标记LvKDZ‑S3的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,其位于凡纳滨对虾基因组39号连锁群的164,995物理位置,多态位点为A/G。在凡纳滨对虾亲本促熟阶段或更早期可通过对虾须、游泳足等活体取样的方式提取基因组DNA,然后利用55K“黄海芯1号”凡纳滨对虾液相芯片检测LvKDZ‑S3位点的基因型;再根据分型结果制定亲虾留种、交配策略。所述分子标记LvKDZ‑S3可以从分子水平上对生长快速个体进行选择,不受生长阶段和个体大小的限制,且能够在早期进行选择,提高选择的准确率和效率,加快生长速度的选育进程。
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公开(公告)号:CN117344033A
公开(公告)日:2024-01-05
申请号:CN202311657079.0
申请日:2023-12-06
申请人: 中国水产科学研究院黄海水产研究所
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种凡纳滨对虾生长相关的分子标记及其应用。所述分子标记LvKDZ‑S3的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,其位于凡纳滨对虾基因组39号连锁群的164,995物理位置,多态位点为A/G。在凡纳滨对虾亲本促熟阶段或更早期可通过对虾须、游泳足等活体取样的方式提取基因组DNA,然后利用55K“黄海芯1号”凡纳滨对虾液相芯片检测LvKDZ‑S3位点的基因型;再根据分型结果制定亲虾留种、交配策略。所述分子标记LvKDZ‑S3可以从分子水平上对生长快速个体进行选择,不受生长阶段和个体大小的限制,且能够在早期进行选择,提高选择的准确率和效率,加快生长速度的选育进程。
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公开(公告)号:CN118028492A
公开(公告)日:2024-05-14
申请号:CN202410431050.9
申请日:2024-04-11
申请人: 中国水产科学研究院黄海水产研究所
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , C12N15/11
摘要: 本发明提出了一种凡纳滨对虾的SNP位点组合在其家系混合养殖性状评估中的应用及探针和试剂盒,属于对虾育种的技术领域。本发明中凡纳滨对虾的SNP位点组合包括1125个SNP位点,物理位置是基于凡纳滨对虾参考基因组序列比对确定的。本发明还给出了一种用于捕获上述SNP位点组合的分子探针以及包括该分子探针的试剂盒。本发明利用SNP位点组合进行亲子鉴定,实现了早期不同家系间个体的混合养殖,有效地降低了早期由家系单独养殖所造成的共同环境效应,提高了混合养殖性状评估结果的准确性,并且可以准确地计算个体之间的亲缘关系,与物理标记相比,不会出现个体标记脱落、错位以及人为识别错误的现象,能够获得准确无误的系谱。
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公开(公告)号:CN117512132A
公开(公告)日:2024-02-06
申请号:CN202311622296.6
申请日:2023-11-30
申请人: 中国水产科学研究院黄海水产研究所 , 广东恒兴饲料实业股份有限公司
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q1/6874 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种筛选对虾快速生长性状的分子标记及其应用。所述分子标记命名为LvKDZ‑S2,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,其位于凡纳滨对虾基因组28号连锁群的3,861,471物理位置,多态位点为C/G。在凡纳滨对虾亲本促熟阶段或更早期可通过对虾须、游泳足等活体取样的方式提取基因组DNA,然后利用55K“黄海芯1号”凡纳滨对虾液相芯片检测LvKDZ‑S2位点的基因型;再根据分型结果制定亲虾留种、交配策略。所述分子标记LvKDZ‑S2可以从分子水平上对生长快速个体进行选择,不受生长阶段和个体大小的限制,且能够在早期进行选择,提高选择的准确率和效率,加快生长速度的选育进程。
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