公开(公告)号：CN114023391A

公开(公告)日：2022-02-08

申请号：CN202111264361.3

申请日：2021-10-28

申请人： 中国科学院西北高原生物研究所

发明人： 李雪 ,  刘思嘉 ,  田得红 ,  韩步鹰 ,  刘德会 ,  丁宁 ,  付德军 ,  宋晓亮 ,  田菲 ,  赵凯

IPC分类号： G16B50/30 ,  G16B50/10 ,  G16B20/20 ,  G16B20/50 ,  G16B30/00 ,  G16B25/20

摘要： 本发明属于基因技术领域，具体涉及一种呼伦贝尔羊SNP数据库的构建方法。本发明的构建方法包括以下步骤：步骤1，获取呼伦贝尔羊测序数据；步骤2，对测序数据进行质量控制，得到质控后数据；步骤3，将质控后数据中的reads分别映射到参考基因组中；步骤4，从Mapped Reads中去除PCR副本；步骤5，检测得到SNP位点；步骤6，对SNP位点进行注释；步骤7，整理SNP位点及其注释信息，得到呼伦贝尔羊SNP数据库。通过上述方法得到的呼伦贝尔羊SNP数据库为呼伦贝尔羊的性状和疾病的研究提供了方便，有利于呼伦贝尔羊物种的保护和发展，具有很好的应用前景。