一种测定杂交水稻新品种的特异性、一致性与稳定性的方法

    公开(公告)号:CN104805182A

    公开(公告)日:2015-07-29

    申请号:CN201510148540.9

    申请日:2015-03-31

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: 本发明公开了一种测定杂交水稻新品种的特异性、一致性与稳定性的方法。所述方法包括:获得变异位点;确定待测水稻品种的测试区域;构建数据库;确定抽样量后,随机抽样混合并提取混合样本的DNA;制备引物;利用引物对混合样本的DNA进行扩增,扩增产物用于构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;分析测序片段组,获得待测水稻品种基因型和杂株基因型;比较获得近似品种、变异位点和变异位点率;获得杂株品种后,计算杂株率;利用变异位点、变异位点率和杂株率,判断待测水稻品种特异性、一致性和稳定性。所述方法能够准确、完整地判断待测水稻品种的特异性、稳定性与一致性,且测试速度更快。

    一种测定杂交水稻新品种的特异性、一致性与稳定性的方法

    公开(公告)号:CN104805182B

    公开(公告)日:2017-09-01

    申请号:CN201510148540.9

    申请日:2015-03-31

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: 本发明公开了一种测定杂交水稻新品种的特异性、一致性与稳定性的方法。所述方法包括:获得变异位点;确定待测水稻品种的测试区域;构建数据库;确定抽样量后,随机抽样混合并提取混合样本的DNA;制备引物;利用引物对混合样本的DNA进行扩增,扩增产物用于构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;分析测序片段组,获得待测水稻品种基因型和杂株基因型;比较获得近似品种、变异位点和变异位点率;获得杂株品种后,计算杂株率;利用变异位点、变异位点率和杂株率,判断待测水稻品种特异性、一致性和稳定性。所述方法能够准确、完整地判断待测水稻品种的特异性、稳定性与一致性,且测试速度更快。

    一种棉花转基因成分的检测方法

    公开(公告)号:CN105567835A

    公开(公告)日:2016-05-11

    申请号:CN201610066274.X

    申请日:2016-01-29

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: 本发明公开了一种棉花转基因成分的检测方法,属于生物技术领域。所述方法包括:确定转基因成分、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;进行抽样并混合,得到混合样品;提取混合样品的基因组并加入外源标准基因,得到混合核酸;构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;获得待测样品中转基因成分的测序片段的数量、内源标准基因的测序片段的数量和外源标准基因的测序片段的数量;根据外源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功并计算待测样品种中转基因成分的含量;根据转基因成分的含量判断待测样品中是否含有转基因成分。该方法能够同时定量检测待测样品中的任意多种转基因成分。

    一种水痘-带状疱疹病毒的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN114790494B

    公开(公告)日:2024-03-22

    申请号:CN202111301065.6

    申请日:2021-11-04

    申请人: 江汉大学

    IPC分类号: C12Q1/70 C12Q1/6858 C12N15/11

    摘要: 本发明公开了一种水痘‑带状疱疹病毒的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在水痘‑带状疱疹病毒基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑15的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.30所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定水痘‑带状疱疹病毒并监测变异;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏、高精准和免培养的检测优势,可应用于大规模样本的水痘‑带状疱疹病毒的鉴定和遗传变异检测,对水痘‑带状疱疹病毒的科研和防疫监测均具有重要意义。

    一种金黄色葡萄球菌的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN114790488B

    公开(公告)日:2023-12-22

    申请号:CN202111301125.4

    申请日:2021-11-04

    申请人: 江汉大学

    摘要: 本发明公开了一种金黄色葡萄球菌的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在金黄色葡萄球菌基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑15的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.30所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定金黄色葡萄球菌并精细的区分不同的小种;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏、高精准和免培养的检测优势,可应用于大规模样本的金黄色葡萄球菌的鉴定和遗传变异检测,对金黄色葡萄球菌的科研和卫生监测均具有重要意义。

    水稻黄单胞菌的MNP标记位点、引物组合物和试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN114790484B

    公开(公告)日:2023-12-22

    申请号:CN202111296513.8

    申请日:2021-11-03

    申请人: 江汉大学

    摘要: 本发明公开了一种水稻黄单胞菌的MNP标记位点、引物组合物和试剂盒及其应用,所述MNP标记位点包括水稻黄单胞菌多个基因组上的MNP‑1~MNP‑212的标记位点。所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.424所示。所述MNP标记位点数目多、多态性高、物种区分能力强,满足水稻黄单胞菌准确、灵敏和免培养的检测、病理型和小种区分、杂合性检测、遗传变异检测、认证和构建DNA指纹数据库的需求;所述引物互不干扰,检测效率高,鉴定结果准确度高、结果重现性强,满足保证科研结果重现性的需求和大规模水稻黄单胞菌田间样本检测的需求,在水稻黄单胞菌的流行病学检测和鉴定等方面具有极大的应用价值。

    一种呼吸道合胞病毒的MNP标记组合、引物对组合、试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN114277187B

    公开(公告)日:2023-07-07

    申请号:CN202111309414.9

    申请日:2021-11-06

    申请人: 江汉大学

    IPC分类号: C12Q1/70 C12N15/11 C12R1/93

    摘要: 本发明属于分子生物学技术领域,本发明公开了一种呼吸道合胞病毒的MNP标记组合、引物对组合、试剂盒及其应用,所述MNP标记组合包括15个标记,具体的核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.15所示;所述引物对组合包括15对引物,具体的引物序列如SEQ ID NO.16‑SEQ ID NO.45所示。所述MNP标记组合能特异的鉴定呼吸道合胞病毒并精细的检测变异;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏、高精准和免培养的检测优势,可应用于大规模样本的呼吸道合胞病毒的鉴定和遗传变异检测,对呼吸道合胞病毒的研究和防疫监测均具有重要意义。