工程化的Cas12i核酸酶、效应蛋白及其用途

    公开(公告)号:CN117337326A

    公开(公告)日:2024-01-02

    申请号:CN202280035920.X

    申请日:2022-05-25

    IPC分类号: C12N9/22

    摘要: 本申请提供了一种工程化的Cas12i核酸酶;其包含一种或多种以下基于参比Cas12i核酸酶的突变:(1)将参比Cas12i核酸酶中与PAM相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;和/或(2)将参比Cas12i核酸酶中参与打开DNA双链的一个或多个氨基酸替换为带芳香环的氨基酸;和/或(3)将参比Cas12i核酸酶中位于RuvC结构域并与单链DNA底物相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;和/或(4)将参比Cas12i核酸酶中与DNA‑RNA双螺旋相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;和/或(5)将参比Cas12i核酸酶中与DNA‑RNA双螺旋相互作用的一个或多个极性或带正电荷的氨基酸替换为疏水氨基酸。该工程化的Cas12i核酸酶较参比Cas12i核酸酶具有显著提高的基因编辑效率和/或显著降低的脱靶现象。

    一种在基因组插入大片段DNA的系统

    公开(公告)号:CN118222533A

    公开(公告)日:2024-06-21

    申请号:CN202311754994.1

    申请日:2023-12-19

    摘要: 本申请提供了一种逆转座酶,其包括含有锌指结合基序的靶DNA结合结构域、逆转录酶结构域、以及核酸内切酶结构域,能够将RNA逆转录成DNA。本申请的逆转座酶的氨基酸序列如SEQ ID No.1~6或SEQ ID No.32~43或SEQ ID No.68~71中的任一项所示或与SEQ ID No.1~6或SEQ ID No.32~43或SEQ ID No.68~71中任一项所述的氨基酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%同一性。本申请还涉及一种用于对DNA进行修饰的系统,所述系统包括:本申请的逆转座酶或编码本申请的逆转座酶的核酸;和供体RNA或编码所述供体RNA的核酸,所述供体RNA包含:与所述逆转座酶结合的序列和异源序列。

    工程化的Cas12i核酸酶及其效应蛋白以及用途

    公开(公告)号:CN113151215B

    公开(公告)日:2022-11-18

    申请号:CN202110581290.3

    申请日:2021-05-27

    摘要: 本申请提供了一种工程化的Cas12i核酸酶;其包含一种、两种、三种或四种以下基于参比Cas12i核酸酶的突变:(1)将参比Cas12i核酸酶中与PAM相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;和/或(2)将参比Cas12i核酸酶中参与打开DNA双链的一个或多个氨基酸替换为带芳香环的氨基酸;和/或(3)将参比Cas12i核酸酶中位于RuvC结构域并与单链DNA底物相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;和/或(4)将参比Cas12i核酸酶中与DNA‑RNA双螺旋相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;尤其所述参比Cas12i核酸酶为天然Cas12i核酸酶,例如天然Cas12i2核酸酶,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所定义。

    工程化的Cas12i核酸酶及其效应蛋白以及用途

    公开(公告)号:CN113151215A

    公开(公告)日:2021-07-23

    申请号:CN202110581290.3

    申请日:2021-05-27

    摘要: 本申请提供了一种工程化的Cas12i核酸酶;其包含一种、两种、三种或四种以下基于参比Cas12i核酸酶的突变:(1)将参比Cas12i核酸酶中与PAM相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;和/或(2)将参比Cas12i核酸酶中参与打开DNA双链的一个或多个氨基酸替换为带芳香环的氨基酸;和/或(3)将参比Cas12i核酸酶中位于RuvC结构域并与单链DNA底物相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;和/或(4)将参比Cas12i核酸酶中与DNA‑RNA双螺旋相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;尤其所述参比Cas12i核酸酶为天然Cas12i核酸酶,例如天然Cas12i2核酸酶,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所定义。