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公开(公告)号:CN117337326A
公开(公告)日:2024-01-02
申请号:CN202280035920.X
申请日:2022-05-25
申请人: 中国科学院动物研究所 , 北京干细胞与再生医学研究院
IPC分类号: C12N9/22
摘要: 本申请提供了一种工程化的Cas12i核酸酶;其包含一种或多种以下基于参比Cas12i核酸酶的突变:(1)将参比Cas12i核酸酶中与PAM相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;和/或(2)将参比Cas12i核酸酶中参与打开DNA双链的一个或多个氨基酸替换为带芳香环的氨基酸;和/或(3)将参比Cas12i核酸酶中位于RuvC结构域并与单链DNA底物相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;和/或(4)将参比Cas12i核酸酶中与DNA‑RNA双螺旋相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;和/或(5)将参比Cas12i核酸酶中与DNA‑RNA双螺旋相互作用的一个或多个极性或带正电荷的氨基酸替换为疏水氨基酸。该工程化的Cas12i核酸酶较参比Cas12i核酸酶具有显著提高的基因编辑效率和/或显著降低的脱靶现象。
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公开(公告)号:CN112195164B
公开(公告)日:2021-04-23
申请号:CN202011414384.3
申请日:2020-12-07
申请人: 中国科学院动物研究所 , 北京干细胞与再生医学研究院
IPC分类号: C12N9/22 , C12N15/113 , C12N5/10 , C12Q1/6816 , A61K48/00
摘要: 本文提供了用于工程化改造酶诸如Cas核酸酶以增加其酶活性的方法。还提供了工程化的Cas效应蛋白,包括工程化的Cas12b、Cas12i和Cas9核酸酶及其衍生物,以及其使用方法。
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公开(公告)号:CN118222533A
公开(公告)日:2024-06-21
申请号:CN202311754994.1
申请日:2023-12-19
申请人: 北京干细胞与再生医学研究院 , 中国科学院动物研究所
摘要: 本申请提供了一种逆转座酶,其包括含有锌指结合基序的靶DNA结合结构域、逆转录酶结构域、以及核酸内切酶结构域,能够将RNA逆转录成DNA。本申请的逆转座酶的氨基酸序列如SEQ ID No.1~6或SEQ ID No.32~43或SEQ ID No.68~71中的任一项所示或与SEQ ID No.1~6或SEQ ID No.32~43或SEQ ID No.68~71中任一项所述的氨基酸序列具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%同一性。本申请还涉及一种用于对DNA进行修饰的系统,所述系统包括:本申请的逆转座酶或编码本申请的逆转座酶的核酸;和供体RNA或编码所述供体RNA的核酸,所述供体RNA包含:与所述逆转座酶结合的序列和异源序列。
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公开(公告)号:CN112195164A
公开(公告)日:2021-01-08
申请号:CN202011414384.3
申请日:2020-12-07
申请人: 中国科学院动物研究所 , 北京干细胞与再生医学研究院
IPC分类号: C12N9/22 , C12N15/113 , C12N5/10 , C12Q1/6816 , A61K48/00
摘要: 本文提供了用于工程化改造酶诸如Cas核酸酶以增加其酶活性的方法。还提供了工程化的Cas效应蛋白,包括工程化的Cas12b、Cas12i和Cas9核酸酶及其衍生物,以及其使用方法。
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公开(公告)号:CN113151215B
公开(公告)日:2022-11-18
申请号:CN202110581290.3
申请日:2021-05-27
申请人: 中国科学院动物研究所 , 北京干细胞与再生医学研究院
IPC分类号: C12N9/22 , C12N15/113 , C12Q1/6869
摘要: 本申请提供了一种工程化的Cas12i核酸酶;其包含一种、两种、三种或四种以下基于参比Cas12i核酸酶的突变:(1)将参比Cas12i核酸酶中与PAM相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;和/或(2)将参比Cas12i核酸酶中参与打开DNA双链的一个或多个氨基酸替换为带芳香环的氨基酸;和/或(3)将参比Cas12i核酸酶中位于RuvC结构域并与单链DNA底物相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;和/或(4)将参比Cas12i核酸酶中与DNA‑RNA双螺旋相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;尤其所述参比Cas12i核酸酶为天然Cas12i核酸酶,例如天然Cas12i2核酸酶,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所定义。
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公开(公告)号:CN114592040A
公开(公告)日:2022-06-07
申请号:CN202111488524.6
申请日:2021-12-07
申请人: 北京干细胞与再生医学研究院 , 中国科学院动物研究所
IPC分类号: C12Q1/6844 , C12Q1/6851
摘要: 基于Cas12i的核酸检测方法。本发明涉及基因工程和基因检测领域,是基于新的CRISPR系统开发的核酸检测方法,涉及在RNA的介导下由Cas12i蛋白以及其变体进行的靶向DNA、RNA检测方法的建立以及相关检测装置的开发,可应用于遗传诊断、检验检疫等方向。
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公开(公告)号:CN116601293A
公开(公告)日:2023-08-15
申请号:CN202080107728.8
申请日:2020-12-07
申请人: 中国科学院动物研究所 , 北京干细胞与再生医学研究院
IPC分类号: C12N15/113
摘要: 本文提供了用于工程化改造酶诸如Cas核酸酶以增加其酶活性的方法。还提供了工程化的Cas效应蛋白,包括工程化的Cas12b、Cas12i和Cas9核酸酶及其衍生物,以及其使用方法。
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公开(公告)号:CN113308451B
公开(公告)日:2023-07-25
申请号:CN202110591698.9
申请日:2020-12-07
申请人: 中国科学院动物研究所 , 北京干细胞与再生医学研究院
IPC分类号: C12N9/22 , C12N15/113 , C12N5/10 , C12Q1/6816 , A61K48/00
摘要: 本文提供了用于工程化改造酶诸如Cas核酸酶以增加其酶活性的方法。还提供了工程化的Cas效应蛋白,包括工程化的Cas12b、Cas12i和Cas9核酸酶及其衍生物,以及其使用方法。
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公开(公告)号:CN113151215A
公开(公告)日:2021-07-23
申请号:CN202110581290.3
申请日:2021-05-27
申请人: 中国科学院动物研究所 , 北京干细胞与再生医学研究院
IPC分类号: C12N9/22 , C12N15/113 , C12Q1/6869
摘要: 本申请提供了一种工程化的Cas12i核酸酶;其包含一种、两种、三种或四种以下基于参比Cas12i核酸酶的突变:(1)将参比Cas12i核酸酶中与PAM相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;和/或(2)将参比Cas12i核酸酶中参与打开DNA双链的一个或多个氨基酸替换为带芳香环的氨基酸;和/或(3)将参比Cas12i核酸酶中位于RuvC结构域并与单链DNA底物相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;和/或(4)将参比Cas12i核酸酶中与DNA‑RNA双螺旋相互作用的一个或多个氨基酸替换为带正电的氨基酸;尤其所述参比Cas12i核酸酶为天然Cas12i核酸酶,例如天然Cas12i2核酸酶,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所定义。
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公开(公告)号:CN116949011A
公开(公告)日:2023-10-27
申请号:CN202310447170.3
申请日:2023-04-24
申请人: 中国科学院动物研究所 , 北京干细胞与再生医学研究院
IPC分类号: C12N9/22 , C12N15/55 , C12N15/113 , C12N15/85
摘要: 本申请涉及经分离的新型CRISPR/Cas13蛋白,基于它的基因编辑系统以及使用它们进行RNA水平基因编辑的方法。本申请提供了非天然存在或经工程化改造的RNA靶向系统,这些系统含有一个靶向RNA的新型Cas13效应蛋白,以及至少一种向导分子。
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