用于膀胱癌诊断和复发监控的生物标志物及检测试剂盒

    公开(公告)号:CN109576370B

    公开(公告)日:2021-11-02

    申请号:CN201811581939.6

    申请日:2018-12-24

    IPC分类号: C12Q1/6886 C12N15/11

    摘要: 本发明提供用于膀胱癌诊断和复发监控的生物标志物及检测试剂盒。所述生物标志物为基因UBE2C,以及如下基因BIRC5、UBE2C、CDK1、MMP11、TPX2、CDC20、MYBL2、TK1、FOXM1、CCNB1和UCA1中的至少一种。本发明提供的生物标志物及其组合,能够准确地确诊个体是否患有膀胱癌以及是否有复发的可能,具有较高的灵敏性,其复发监控模型性能的AUC达0.955,灵敏度和NPV为100%时,特异可达80%以上;其诊断模型性能的AUC达0.99,灵敏度及NPV均为98%以上时,特异性达92%,本发明基于尿液检测提供了一种无创的检测方法,可有效避免患者频繁使用膀胱镜所遭受的痛苦。

    用于膀胱癌诊断或复发监控的生物标志物及试剂盒

    公开(公告)号:CN111154879A

    公开(公告)日:2020-05-15

    申请号:CN202010150403.X

    申请日:2020-03-06

    IPC分类号: C12Q1/6886 C12N15/11

    摘要: 本发明提供一种用于检测膀胱癌生物标志物的检测试剂盒,所述检测试剂盒包括用于检测膀胱癌生物标志物的引物和探针,所述膀胱癌生物标志物为选自基因CA9、IGF2、CDK1、UBE2C、CRH、RPS21和HOXA13中的至少一种。进一步地,所述检测试剂盒还包括用于检测内参基因的引物和探针,所述内参基因选自SLC25A6、ACTB或GAPDH。本发明还提供一种包括所述检测试剂盒的用于诊断膀胱癌的诊断试剂盒。本发明的诊断试剂盒能够准确地确诊个体是否患有膀胱癌以及是否有复发的可能,具有较高的灵敏性,而且实现了非侵入性膀胱癌辅助诊断和复发监控的功能。

    一种基于单细胞转录组数据和外泌体组学分析细胞外泌体通讯的方法

    公开(公告)号:CN116612822A

    公开(公告)日:2023-08-18

    申请号:CN202310898875.7

    申请日:2023-07-21

    IPC分类号: G16B40/00 G16B20/00 G16B25/10

    摘要: 本发明涉及生物信息技术领域,尤其涉及一种基于单细胞转录组数据和外泌体组学分析细胞外泌体通讯的方法。所述方法包括:获取待测样品的单细胞转录组数据和外泌体组学数据;根据单细胞转录组数据判断存在外泌体通讯的细胞亚群;进一步结合外泌体组学数据进行细胞外泌体通讯分析;外泌体组学数据包括如下中的至少一种:外泌体的miRNA组学数据、外泌体的mRNA组学数据、外泌体的lncRNA组学数据或外泌体的蛋白组学数据。本发明基于单细胞转录组数据和外泌体组学分析可能存在外泌体通讯的细胞亚群以及相应的通讯信息,可以准确、全面、多方位地推测组织内不同细胞亚群间的外泌体通讯情况,对于外泌体通讯的相关研究具有重要意义。

    用于膀胱癌诊断和复发监控的生物标志物及检测试剂盒

    公开(公告)号:CN109576370A

    公开(公告)日:2019-04-05

    申请号:CN201811581939.6

    申请日:2018-12-24

    IPC分类号: C12Q1/6886 C12N15/11

    摘要: 本发明提供用于膀胱癌诊断和复发监控的生物标志物及检测试剂盒。所述生物标志物为基因UBE2C,以及如下基因BIRC5、UBE2C、CDK1、MMP11、TPX2、CDC20、MYBL2、TK1、FOXM1、CCNB1和UCA1中的至少一种。本发明提供的生物标志物及其组合,能够准确地确诊个体是否患有膀胱癌以及是否有复发的可能,具有较高的灵敏性,其复发监控模型性能的AUC达0.955,灵敏度和NPV为100%时,特异可达80%以上;其诊断模型性能的AUC达0.99,灵敏度及NPV均为98%以上时,特异性达92%,本发明基于尿液检测提供了一种无创的检测方法,可有效避免患者频繁使用膀胱镜所遭受的痛苦。

    一种基于单细胞转录组数据和外泌体组学分析细胞外泌体通讯的方法

    公开(公告)号:CN116612822B

    公开(公告)日:2023-10-20

    申请号:CN202310898875.7

    申请日:2023-07-21

    IPC分类号: G16B40/00 G16B20/00 G16B25/10

    摘要: 本发明涉及生物信息技术领域,尤其涉及一种基于单细胞转录组数据和外泌体组学分析细胞外泌体通讯的方法。所述方法包括:获取待测样品的单细胞转录组数据和外泌体组学数据;根据单细胞转录组数据判断存在外泌体通讯的细胞亚群;进一步结合外泌体组学数据进行细胞外泌体通讯分析;外泌体组学数据包括如下中的至少一种:外泌体的miRNA组学数据、外泌体的mRNA组学数据、外泌体的lncRNA组学数据或外泌体的蛋白组学数据。本发明基于单细胞转录组数据和外泌体组学分析可能存在外泌体通讯的细胞亚群以及相应的通讯信息,可以准确、全面、多方位地推测组织内不同细胞亚群间的外泌体通讯情况,对于外泌体通讯的相关研究具有重要意义。