公开(公告)号：CN117248070A

公开(公告)日：2023-12-19

申请号：CN202311333774.1

申请日：2023-10-16

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 陈发棣 ,  苏江硕 ,  张洪铭 ,  张飞 ,  王思悦 ,  蒋甲福 ,  房伟民

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6858 ,  C12N15/11 ,  A01H1/04 ,  G16B20/20 ,  G16B30/10

Abstract: 本发明公开了一种菊花托桂花型KASP标记开发方法及其应用。本发明通过基于全基因组重测序的BSA‑seq快速鉴定菊花托桂花型关联位点，并将SNP和InDel关联位点转化成KASP标记，与传统基于PCR和电泳的分子标记相比，KASP标记具有转化成功率高、分型准确、开发费用低、灵活性强、易于自动化等明显优势。开发的KASP‑Chr6__179207697‑G/A鉴定准确率可达76～85％，可在较短时间内完成大批量材料的托桂花型筛选，避免了繁琐的田间花期表型观测，减少了环境因对表型鉴定的影响，从而大大缩短育种周期。本发明为实现菊花托桂花型的早期大规模、高通量、自动化检测筛选奠定了重要基础，对菊花花型MAS育种具有重要的理论和实践意义。

公开(公告)号：CN120070880A

公开(公告)日：2025-05-30

申请号：CN202411620428.6

申请日：2024-11-13

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 陈发棣 ,  王思悦 ,  苏江硕 ,  杨扬 ,  王海滨 ,  陈素梅 ,  房伟民 ,  张飞

IPC: G06V10/26 ,  G06V10/54 ,  G06V10/56 ,  G06V10/771 ,  G06V10/764 ,  G06N7/01

Abstract: 本发明公开了一种菊花耐涝性高效鉴定分级和生物量估测方法，包括以下步骤：(1)选取多份来源不同的代表性菊属及其近缘种属植物资源进行淹水处理，获得每份资源的耐涝性隶属函数值；(2)在中度和重度两个淹水时期植株采集RGB图像，利用相机采集植物四个侧视角度和一个俯视角度的图像数据，并进行图像颜色校准和批量命名；(3)利用图像分割算法对图像进行处理，获得植株部分二值图，计算植株高度、宽度、投影面积植株形态特征，基于图像灰度、颜色信息提取植株的纹理特征；(4)根据表型显著性t检验和遗传力大小，对所获得的特征参数进行筛选，获得响应涝胁迫的代表性图像特征参数；(5)将所获得的图像特征参数分为5类数据集，分别采用随机森林和梯度提升树两种机器学习算法，建立耐涝性隶属函数值和生物量的最优预测模型，并对菊花耐涝等级自动化划分。本发明可为植物耐涝性或其他非生物胁迫抗性鉴定评价和生物量预测提供参考。

公开(公告)号：CN118186137A

公开(公告)日：2024-06-14

申请号：CN202410489590.2

申请日：2024-04-23

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 苏江硕 ,  曾俊未 ,  蒋甲福 ,  张飞 ,  王思悦 ,  赵立民 ,  房伟民 ,  陈发棣

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种鉴定菊花光反应周期长短的KASP标记组合、其开发方法及应用。本发明通过基于全基因重测序的BSA‑seq技术快速定位到与光反应周期相关的变异位点，将筛选到的SNP关联位点转化成KASP标记；本发明开发的SNP位点Chr9_205233550和Chr10_20239079，可单独或组合使用，该标记组鉴定菊花品种光反应周期长短的准确率能达到82.67％。该KASP标记组可以实现菊花光反应周期的早期鉴定，无需通过漫长繁琐的田间表型调查，即避免了人工主观判断带来的误差及人力物力的浪费，又大大地提高了选择效率。本发明的鉴定方法，可在菊花生长早期快速、准确地对光反应周期进行判断，有利于亲本的选配及后代优异株系的筛选，为菊花光反应周期MAS育种体系的建立奠定基础，对菊花光反应周期研究及其周年生产具有重要意义。