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公开(公告)号:CN104313155A
公开(公告)日:2015-01-28
申请号:CN201410581350.1
申请日:2014-10-27
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6827 , C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明属于生物技术领域,提供一种托桂型菊花花器特性QTL分子标记筛选方法,该种方法可用于托桂型菊花花器性状优良基因的定位和克隆及托桂型菊花新品种的培育。包括:1.试验材料及其表型数据的获得;2.菊花连锁图谱构建;3.结合表型数据和分子遗传图谱,进行托桂型菊花花器性状的QTL分析;4.托桂型菊花花器性状关联分子标记的确定。本发明以托桂型秋菊品种“QX-053”为母本和非托桂型秋菊品种“南农惊艳”为父本杂交获得的160株F1分离群体为试材,获得了多个与托桂型菊花花器性状显著关联的分子标记。托桂型菊花花器性状关联分子标记的获得,可用于托桂型菊花花器性状的优良基因的精细定位和克隆,大大提高选择效率,从而加快托桂型菊花育种进程。
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公开(公告)号:CN107815502B
公开(公告)日:2021-06-08
申请号:CN201711176758.0
申请日:2017-11-23
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种鉴定菊花耐涝性的dCAPS标记开发方法及应用,属于生物技术领域,该方法包括以下几个步骤:a、通过GWAS方法挖掘与菊花耐涝性显著关联的SNP位点;b、SNP突变位点特异性酶切位点分析及dCAPS引物设计;c、结合基因型与表型数据预期酶切扩增多态性;d、dCAPS标记在自然耐涝极端群体的验证;e、在F1后代耐涝极端群体中对WT‑dCAPS1标记进行进一步验证。本发明开发了一个与菊花耐涝性状共分离的dCAPS共显性标记,命名为WT‑dCAPS1,在两个群体的平均鉴定准确率为78.9%,初步认为可以应用于菊花耐涝性分子标记辅助育种,大大缩短育种周期,对于培育耐涝性菊花新品种具有重要的理论和实践意义。
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公开(公告)号:CN105112534B
公开(公告)日:2022-11-08
申请号:CN201510587171.3
申请日:2015-09-15
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6851 , C12N15/29 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种荧光定量PCR鉴定菊花内、外源基因拷贝数的引物对及方法。PGK基因作为内参基因在荧光定量PCR鉴定菊花内、外源基因拷贝数中的应用。一种应用于荧光定量PCR鉴定菊花内、外源基因拷贝数的内源基因扩增引物对,正向引物序列如SEQ ID NO.1所示,反向引物序列如SEQ ID NO.2所示。本发明可以快速、准确、高效的鉴定菊花内源基因拷贝数和转基因菊花转内源、转外源基因拷贝数。通过本发明提供的检测引物和方法,以菊花和转基因菊花为实验材料,根据待检测拷贝数的基因和内源参照基因PGK的CT值比较分析,即可得出菊花内源基因拷贝数和转基因菊花所转基因拷贝数。该检测方法为复杂基因组基因的拷贝数鉴定提供了新思路,大大提高了检测基因拷贝数的效率。
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公开(公告)号:CN105112534A
公开(公告)日:2015-12-02
申请号:CN201510587171.3
申请日:2015-09-15
Applicant: 南京农业大学
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q1/6851 , C12Q2600/166 , C12Q2563/107 , C12Q2545/113
Abstract: 本发明公开了一种荧光定量PCR鉴定菊花内、外源基因拷贝数的引物对及方法。PGK基因作为内参基因在荧光定量PCR鉴定菊花内、外源基因拷贝数中的应用。一种应用于荧光定量PCR鉴定菊花内、外源基因拷贝数的内源基因扩增引物对,正向引物序列如SEQ ID NO.1所示,反向引物序列如SEQ ID NO.2所示。本发明可以快速、准确、高效的鉴定菊花内源基因拷贝数和转基因菊花转内源、转外源基因拷贝数。通过本发明提供的检测引物和方法,以菊花和转基因菊花为实验材料,根据待检测拷贝数的基因和内源参照基因PGK的CT值比较分析,即可得出菊花内源基因拷贝数和转基因菊花所转基因拷贝数。该检测方法为复杂基因组基因的拷贝数鉴定提供了新思路,大大提高了检测基因拷贝数的效率。
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公开(公告)号:CN107815502A
公开(公告)日:2018-03-20
申请号:CN201711176758.0
申请日:2017-11-23
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156 , C12Q2600/172
Abstract: 本发明涉及一种鉴定菊花耐涝性的dCAPS标记开发方法及应用,属于生物技术领域,该方法包括以下几个步骤:a、通过GWAS方法挖掘与菊花耐涝性显著关联的SNP位点;b、SNP突变位点特异性酶切位点分析及dCAPS引物设计;c、结合基因型与表型数据预期酶切扩增多态性;d、dCAPS标记在自然耐涝极端群体的验证;e、在F1后代耐涝极端群体中对WT-dCAPS1标记进行进一步验证。本发明开发了一个与菊花耐涝性状共分离的dCAPS共显性标记,命名为WT-dCAPS1,在两个群体的平均鉴定准确率为78.9%,初步认为可以应用于菊花耐涝性分子标记辅助育种,大大缩短育种周期,对于培育耐涝性菊花新品种具有重要的理论和实践意义。
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公开(公告)号:CN104313155B
公开(公告)日:2017-09-26
申请号:CN201410581350.1
申请日:2014-10-27
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明属于生物技术领域,提供一种托桂型菊花花器特性QTL分子标记筛选方法,该种方法可用于托桂型菊花花器性状优良基因的定位和克隆及托桂型菊花新品种的培育。包括:1、试验材料及其表型数据的获得;2、菊花连锁图谱构建;3、结合表型数据和分子遗传图谱,进行托桂型菊花花器性状的QTL分析;4、托桂型菊花花器性状关联分子标记的确定。本发明以托桂型秋菊品种‘QX‑053’为母本和非托桂型秋菊品种‘南农惊艳’为父本杂交获得的160株F1分离群体为试材,获得了多个与托桂型菊花花器性状显著关联的分子标记。托桂型菊花花器性状关联分子标记的获得,可用于托桂型菊花花器性状的优良基因的精细定位和克隆,大大提高选择效率,从而加快托桂型菊花育种进程。
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