用于猪基因编辑sgRNA筛选的体外细胞平台

    公开(公告)号:CN113980905B

    公开(公告)日:2024-01-23

    申请号:CN202010735516.6

    申请日:2020-07-27

    发明人: 包骥 步宏 高孟雨

    摘要: 本发明公开了一种用于猪基因编辑sgRNA筛选的体外细胞平台,属于基因编辑领域。本发明的平台适用于CRISPR‑Cas9基因编辑技术中的sgRNA筛选,主要包括特定的猪细胞及其转录组、蛋白质组数据平台,以及基因编辑sgRNA筛选方法。所述细胞是稳定表达Cas9基因的猪髋动脉内皮细胞PIEC、猪肾上皮细胞PK15、猪肾传代细胞IBRS‑2或猪睾丸细胞ST。使用者可根据待编辑的基因在数据平台中的表达水平,选取特定细胞,进行基因编辑sgRNA的筛选。本发明的体外细胞平台提高了sgRNA筛选效率,具有良好的应用前(56)对比文件高孟雨等.靶向猪基因组单链向导RNA快速筛选以及利用图案微阵列收获单克隆细胞的研究.生物医学工程学杂志.2021,第38卷(第1期),第111-121页.刘海龙等.靶向miRNA前体不同类型sgRNA的丰度及特异性评估.遗传.2018,(第7期),第57-67页.覃鸿妮等.慢病毒载体介导稳定表达Cas9基因的293T细胞系构建及其基因编辑效率验证.扬州大学学报(农业与生命科学版).2020,(第4期),第32-38页.