公开(公告)号：CN113528619B

公开(公告)日：2023-03-17

申请号：CN202110918528.7

申请日：2021-08-11

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 江峥增 ,  纪元 ,  张新 ,  胡沁 ,  李晓静 ,  李春 ,  张新宇 ,  宿杰阿克苏 ,  张小垒 ,  高峰 ,  倪筝 ,  彭睿 ,  洪杨 ,  蔡儒婧

IPC: C12Q1/6806

Abstract: 本发明涉及一种提取肺泡灌洗液全核酸的方法，包括以下步骤：1)肺泡灌洗液中加入Buffer CDL，以及蛋白酶K，消化处理；2)将消化处理后液体冷却至室温，加入Tracer，再加入预冷的异丙酮，混匀，离心处理，弃上清，留沉淀；3)往沉淀中加入Buffer CDB，在液面下加入BufferCDD，混匀；4)加入无水乙醇，涡旋振荡混匀；5)液体移入微量核酸吸附柱中，离心，倒掉收集管中的液体；6)往微量核酸吸附柱中加入Buffer CW1，离心，倒掉收集管中的液体；7)往微量核酸吸附柱中加入Buffer CW2，离心，倒掉收集管中的液体；8)换用新的收集管容纳微量核酸吸附柱，再离心；9)将微量核酸吸附柱套在离心管中，开盖孵育；10)往微量核酸吸附柱滴加Buffer CDE，闭盖孵育，离心，收集样品全核酸。

公开(公告)号：CN118995871A

公开(公告)日：2024-11-22

申请号：CN202411087314.X

申请日：2024-08-09

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 张欣 ,  柏乾明 ,  纪元 ,  侯英勇 ,  栾丽娟 ,  韩晶 ,  江峥增 ,  王语林 ,  张荔莉 ,  黄玉凤 ,  顾文怡 ,  郭欣欣 ,  张小垒

IPC: C12Q1/02 ,  G01N33/52

Abstract: 本发明公开了一种携带FGFR2融合或重排的肝内胆管癌的识别标志，其为肝内胆管癌的肿瘤组织和周围肝组织切片HE染色图像，基于HE染色图像形态学，胆管板畸形型FGFR2融合或重排阳性ICC的HE染色图像(i)与普通型小胆管型ICC的FGFR2融合或重排阳性ICC的HE染色图像(ii)各有不同的形态学特点。该识别标志能够用于制备FGFR2融合/重排阳性ICC检测试剂。

公开(公告)号：CN114606302A

公开(公告)日：2022-06-10

申请号：CN202210363358.5

申请日：2022-04-08

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 江峥增 ,  纪元 ,  岳蕾 ,  张苗苗 ,  郝洁 ,  韩晶 ,  鲁姗姗 ,  章琼燕 ,  彭睿 ,  蔡儒婧 ,  张小垒 ,  李思彤

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6806

Abstract: 本发明公开了一种提取口腔黏膜核酸进行全基因组高通量测序的方法。本发明的方法包括：在采集的口腔黏膜样本中加入GT Buffer和蛋白酶K依次进行提取、裂解、离心后，采用仪器自动抽提口腔黏膜样本gDNA；将样本gDNA进行PCR片段化、末端修复加A，获得加A后的gDNA；将加A后的gDNA与接头连接，获得连接产物；将上述连接产物进行纯化后，上机测序。本发明还提供了一种提取口腔黏膜核酸进行全基因组高通量测序的试剂盒。本发明通过对口腔黏膜样本核酸抽提后进行全基因组高通量测序，具有采集方便、可以实现全自动化抽提核酸的优点，且无需抽取血液，属于无创检测，为临床病理研究提供了新的高效测序方法。

公开(公告)号：CN113832146A

公开(公告)日：2021-12-24

申请号：CN202111347672.6

申请日：2021-11-15

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 江峥增 ,  缪青 ,  岳蕾 ,  张苗苗 ,  纪元 ,  程韵枫 ,  尚果果 ,  王玲燕 ,  沈琦 ,  宿杰阿克苏 ,  张小垒 ,  徐磊 ,  沈立承 ,  洪杨 ,  彭睿

IPC: C12N15/10 ,  C12Q1/6806

Abstract: 本发明提供了一种福尔马林固定石蜡包埋样本提取病原微生物核酸的方法，该方法包括如下步骤：向装有福尔马林固定石蜡包埋样本的离心管中加入二甲苯，离心；弃去离心管中的二甲苯，加入无水乙醇进行离心；弃去离心管中的无水乙醇，孵育直至无水乙醇全部蒸发；向离心管中加入超纯水，并吹打混匀至匀质；将匀质液澄清，再涡旋，加入洗脱缓冲液离心，纯化得到病原微生物核酸；本发明的病原微生物核酸宏基因的结果显示都在10％以下，经过宏基因高通量检测证实确实有效的方法，且去人源性的核酸能力极强，故本发明的福尔马林固定石蜡包埋样本提取病原微生物核酸的方法可以最大程度地去除人源背景，做到仅抽提病原微生物核酸的目的。

公开(公告)号：CN113528619A

公开(公告)日：2021-10-22

申请号：CN202110918528.7

申请日：2021-08-11

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 江峥增 ,  纪元 ,  张新 ,  胡沁 ,  李晓静 ,  李春 ,  张新宇 ,  宿杰阿克苏 ,  张小垒 ,  高峰 ,  倪筝 ,  彭睿 ,  洪杨 ,  蔡儒婧

IPC: C12Q1/6806

Abstract: 本发明涉及一种提取肺泡灌洗液全核酸的方法，包括以下步骤：1)肺泡灌洗液中加入Buffer CDL，以及蛋白酶K，消化处理；2)将消化处理后液体冷却至室温，加入Tracer，再加入预冷的异丙酮，混匀，离心处理，弃上清，留沉淀；3)往沉淀中加入Buffer CDB，在液面下加入BufferCDD，混匀；4)加入无水乙醇，涡旋振荡混匀；5)液体移入微量核酸吸附柱中，离心，倒掉收集管中的液体；6)往微量核酸吸附柱中加入Buffer CW1，离心，倒掉收集管中的液体；7)往微量核酸吸附柱中加入Buffer CW2，离心，倒掉收集管中的液体；8)换用新的收集管容纳微量核酸吸附柱，再离心；9)将微量核酸吸附柱套在离心管中，开盖孵育；10)往微量核酸吸附柱滴加Buffer CDE，闭盖孵育，离心，收集样品全核酸。

公开(公告)号：CN214794110U

公开(公告)日：2021-11-19

申请号：CN202120432561.4

申请日：2021-02-26

Applicant: 复旦大学附属中山医院

Inventor： 侯英勇 ,  徐晨 ,  蒋冬先 ,  宋琦 ,  王海星 ,  刘亚岚 ,  黄洁 ,  陈伶俐 ,  罗荣奎 ,  袁伟 ,  任磊 ,  黄雯 ,  王慧美 ,  卢韶华 ,  纪元 ,  侯君 ,  张小垒 ,  宿杰阿克苏

IPC: G01N1/36 ,  G01N1/28

Abstract: 本实用新型涉及一种用于组织收集、转运和包埋的组合式工具，属于病理检验技术领域。包括支撑盒、组织存储小盒、盖子、带凹槽的模具和托盘；托盘上设有带凹槽的模具，带凹槽的模具中设有组织存储小盒，组织存储小盒外套设有支撑盒，组织存储小盒上设有盖子。本实用新型提供的组合工具，简化了组织收集和转运各环节的步骤，将组织放入组织存储小盒后，就是该组织最终形成石蜡块上的位置，整个收集和转运过程中不再移动位置，从而达到减少操作环节，提高工作效率，避免污染的目的。同时，转运工具的各部分最终都成为石蜡组织块的支撑物和保护膜，有效减少了医疗废弃物。