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公开(公告)号：CN111784637B
公开(公告)日：2024-06-14
申请号：CN202010498137.X
申请日：2020-06-04
申请人： 复旦大学附属中山医院
摘要： 本发明提供一种预后特征可视化方法，系统、设备和存储介质，提供了分辨率高、细粒度特征多的预后特征可视化图像，用热图显示的方式直观的显示了病人生存风险相关的特征，增强了预后分析的可解释性，本方法包括以下步骤：获取患者病理图像，所述病理图像包括在不同组织区域随机采样的局部切片图像；将随机采样的病理图像输入经过训练的预后风险分析模型，获取与病理图像对应的具有预后风险特征的热图；将所述热图叠加到病理图像上生成具有可视化预后风险特征的图像。
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公开(公告)号：CN118072821A
公开(公告)日：2024-05-24
申请号：CN202311824698.4
申请日：2023-12-28
申请人： 复旦大学附属中山医院
摘要： 本发明涉及一种用于神经内分泌肿瘤检测的基因组合及其获得方法与应用。本发明通过结合神经内分泌肿瘤分子分型的临床指南以及真实世界神经内分泌肿瘤分子特征的研究，聚焦神经内分泌肿瘤的遗传致病基因、驱动基因以及热点突变，针对不同原发部位的神经内分泌肿瘤的特征突变都有涵盖，提供了用于神经内分泌肿瘤检测的基因组合及其获得方法与应用。保证了检测结果的准确性和全面性；高深度测序，保证了低频基因突变的检出，提高突变检测的精准度。可以用于从神经内分泌肿瘤风险评估到辅助诊断、治疗、预后等肿瘤发生发展的各个阶段，基因检测和分析的成本更低。为神经内分泌肿瘤的全面、系统化的检测和研究奠定了基础。
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公开(公告)号：CN117512116A
公开(公告)日：2024-02-06
申请号：CN202311675544.3
申请日：2023-12-07
申请人： 复旦大学附属中山医院 , 上海普恩海汇医学检验所有限公司
摘要： 本发明公开了一种用于胆管癌检测的生物标志物及其应用。本发明用于胆管癌检测的生物标志物组合，包含了DNA+RNA双水平检测肿瘤组织样本，检测广泛的遗传变异，包括单核苷酸变异(SNVs)、插入缺失(indels)、拷贝数变异(CNV)、基因融合(Fusion)以及微卫星不稳定(MSI)，检测更全面；同时，生物标志物组合还包含了识别潜在样品混杂或污染的位点组合，可实现匹配和校对DNA+RNA样本，使得检测更准确；本发明的生物标志物组合可以用于胆管癌的诊断、治疗、预后等发生发展的各个阶段，为胆管癌的全面、系统化的检测和研究奠定了基础。
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公开(公告)号：CN117660655A
公开(公告)日：2024-03-08
申请号：CN202410064439.4
申请日：2024-01-16
申请人： 复旦大学附属中山医院 , 上海普恩海汇医学检验所有限公司
IPC分类号： C12Q1/6886 , C12Q1/686 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种一种检测微卫星不稳定性的生物标志物组合、试剂盒及应用，属于生物技术领域。通过本发明提供一种检测微卫星不稳定性的诊断试剂，所述的诊断试剂包括核苷酸序列如SEQ ID No.1至SEQ ID No.224所示的探针，通过本发明提供一种检测微卫星不稳定性的试剂盒，以及上述探针在在检测微卫星不稳定性的分析方法中的应用。本发明用于检测微卫星不稳定性的生物标志物组合覆盖位点广，检测更准确，检测方法灵敏度和特异性高。
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公开(公告)号：CN114606302A
公开(公告)日：2022-06-10
申请号：CN202210363358.5
申请日：2022-04-08
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q1/6806
摘要： 本发明公开了一种提取口腔黏膜核酸进行全基因组高通量测序的方法。本发明的方法包括：在采集的口腔黏膜样本中加入GT Buffer和蛋白酶K依次进行提取、裂解、离心后，采用仪器自动抽提口腔黏膜样本gDNA；将样本gDNA进行PCR片段化、末端修复加A，获得加A后的gDNA；将加A后的gDNA与接头连接，获得连接产物；将上述连接产物进行纯化后，上机测序。本发明还提供了一种提取口腔黏膜核酸进行全基因组高通量测序的试剂盒。本发明通过对口腔黏膜样本核酸抽提后进行全基因组高通量测序，具有采集方便、可以实现全自动化抽提核酸的优点，且无需抽取血液，属于无创检测，为临床病理研究提供了新的高效测序方法。
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公开(公告)号：CN110964821A
公开(公告)日：2020-04-07
申请号：CN201911302145.6
申请日：2019-12-17
申请人： 复旦大学附属中山医院
IPC分类号： C12Q1/6886
摘要： 本发明公开了一种预测肝癌转移模式及风险的检测panel，其包括基因TP53、NOTCH2、FANCD2、TSC1、PBRM1，本发明还公开了含有检测panel的检测试剂盒。同时，本发明还公开利用该检测试剂盒对肝癌患者的肝癌转移模式及风险的判断方法。基于本发明的检测panel，可以实现对肝癌患者肝癌转移模式及风险的精准预测，不仅能够判断其是否具有肝癌转移的风险，且能够准确的预测出其转移模式为腹腔内转移还是腹腔外转移，为临床诊断提供可靠的依据。
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公开(公告)号：CN111784637A
公开(公告)日：2020-10-16
申请号：CN202010498137.X
申请日：2020-06-04
申请人： 复旦大学附属中山医院
摘要： 本发明提供一种预后特征可视化方法，系统、设备和存储介质，提供了分辨率高、细粒度特征多的预后特征可视化图像，用热图显示的方式直观的显示了病人生存风险相关的特征，增强了预后分析的可解释性，本方法包括以下步骤：获取患者病理图像，所述病理图像包括在不同组织区域随机采样的局部切片图像；将随机采样的病理图像输入经过训练的预后风险分析模型，获取与病理图像对应的具有预后风险特征的热图；将所述热图叠加到病理图像上生成具有可视化预后风险特征的图像。
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公开(公告)号：CN219278164U
公开(公告)日：2023-06-30
申请号：CN202320006937.4
申请日：2023-01-03
申请人： 复旦大学附属中山医院
摘要： 本实用新型公开了一种方便移液的PCR八联管储存盒。本实用新型的PCR八联管储存盒包括通过铰链活动连接的盒盖和盒体，所述盒体包括并排设置的储存槽和加样槽，所述储存槽内设有储存架，所述储存架上设有8×12或8×24个PCR管插孔，所述储存槽的底部设有保温层。本实用新型将PCR八联管储存盒集方便移液和方便储存功能于一体，设置的加样槽可降低人工移液过程中的失误风险，便于实现不仅人工或全自动移液工作站分装等量试剂至PCR八连管内；整体结构的设计方便PCR八连管的冻存，此外，保温层的设计可以实现从冰箱取出后，常温下持续保温1～2h或更长时间，可以确保后续实验步骤的顺畅进行。
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公开(公告)号：CN208989058U
公开(公告)日：2019-06-18
申请号：CN201820332079.1
申请日：2018-03-12
申请人： 复旦大学附属中山医院
摘要： 本实用新型公开一种用于细针穿刺或活检所得少量细胞及组织的收集装置，包括盒体及与盒体连接的盒盖，所述盒体设有凹槽，在盒体的底面及盒盖上设有均匀分布的通孔；所述凹槽底面设有粘贴板及细纹折叠布，粘贴板与细纹折叠布为可拆卸式连接，在细纹折叠布内设有凝胶块。本实用新型的收集装置的使用，可最大程度的减少中间操作，减轻细胞损失，保存原有细胞形态，经脱水、石蜡包埋后可制成HE切片，或行免疫组化或基因检测，便于医生给予准确的诊断，为患者的治疗赢得宝贵时间。
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