-
公开(公告)号：CN108319816B
公开(公告)日：2021-04-23
申请号：CN201810162452.8
申请日：2018-02-27
Applicant: 广州大学
IPC: G16B25/00
Abstract: 本发明实施例公开了一种基于基因通路识别癌症相关小RNA(miRNA)的方法，包括确定基因表达谱数据和通路数据，并根据所述确定的基因表达谱数据和通路数据，通过最小生成树的方法找到功能异常的子通路；在基因表达谱数据中，筛选出所述功能异常的子通路所对应的差异表达基因；根据miRNA‑mRNA对应关系，确定潜在的疾病相关小RNA(miRNA)；在小RNA(miRNA)功能相似性网络中，利用已知癌症相关miRNA作为种子节点，为候选miRNA打分。实施本发明，能降低寻找过程复杂度，快速准确的找到疾病相关的小RNA(miRNA)。
-
公开(公告)号：CN107220526B
公开(公告)日：2020-08-25
申请号：CN201710300900.1
申请日：2017-05-02
Applicant: 广州大学
IPC: G16B20/00
Abstract: 本发明实施例公开了一种基于PADOG识别基因通路的方法，包括获取样本，并确定样本的信号通路及基因，且对所有信号通路中所含基因进行排序以及确定每一个基因的基因频度及基因出度；确定每一个基因的基因频度权重及矫正分数，计算出每一个信号通路的通路分数；确定排序后每一个基因的基因出度权重；筛选出同一信号通路中的基因出度权重，并根据同一信号通路的基因出度权重，对相应信号通路的通路分数进行修订，且将修订后的通路分数进行排序，确定排序后最大通路分数所对应的信号通路出现变化的概率最大。实施本发明，能考虑到通路中调控大量基因的基因比仅调控少量基因的重要性，从而提高通路的识别精度。
-
公开(公告)号：CN106372457B
公开(公告)日：2018-12-28
申请号：CN201610781378.9
申请日：2016-08-30
Applicant: 广州大学
IPC: G06F19/18
Abstract: 本发明实施例公开了一种基于布尔网络吸引域模拟干预肿瘤细胞状态的方法，该方法包括：利用基因芯片采集技术获取生物样本基因的连续表达谱数据，并根据所述获取到的连续表达谱数据，构建布尔网络模型的基因调控网络；确定基因调控网络干预前所有状态下的暂态数BOS及其包含的所有期望吸引子和不期望吸引子，并进一步筛选出满足预定条件的干预位及其干预后基因调控网络的暂态数BOS；根据所筛选干预位干预后基因调控网络的暂态数BOS，调整基因调控网络结构，并根据调整后的基因调控网络，模拟肿瘤细胞状态。实施本发明，能够模拟干预肿瘤细胞状态，为肿瘤治疗研究提供一个有力的理论框架。
-
公开(公告)号：CN107203704B
公开(公告)日：2020-08-25
申请号：CN201710300928.5
申请日：2017-05-02
Applicant: 广州大学
IPC: G16B25/00
Abstract: 本发明实施例公开了一种基于GSA识别基因通路的方法，包括获取样本，并确定样本的信号通路及基因，且对所有信号通路中所含基因进行排序；确定每一个信号通路中基因总数量及每一个基因的正负得分平均值，计算出每一个信号通路的通路分数；获取每一个基因的基因出度并统计出最大和最小基因出度，并计算出每一个基因的基因出度权重；筛选出同一信号通路中的基因出度权重，并根据同一信号通路的基因出度权重，对相应信号通路的通路分数进行修订，且将修订后的通路分数进行排序，确定排序后最大通路分数所对应的信号通路出现变化的概率最大。实施本发明，能考虑到通路中调控大量基因的基因比仅调控少量基因的重要性，从而提高通路的识别精度。
-
-
-
Search Results
4
records
(took 0.016 seconds)
