一种基于图卷积神经网络的病毒-宿主相互作用预测方法

    公开(公告)号:CN112331257A

    公开(公告)日:2021-02-05

    申请号:CN202011154766.7

    申请日:2020-10-26

    摘要: 一种基于图卷积神经网络的病毒‑宿主相互作用预测方法,数据获取:从数据库中获取HCV和人类蛋白质相互作用的数据;数据表示:为每个蛋白序列创建PSSMs,得到蛋白质PSSM为L*20的PSSM打分矩阵,并得到20*20的矩阵,将其作为特征提取的输入;特征提取:对蛋白质的PSSM矩阵进行特征提取;模型搭建:采用2层GCN模型进行模型搭建;模型训练:利用五折交叉验证进行模型训练,随机初始化权重;模型预测:利用训练后得到的模型对测试数据集进行预测,检验算法的泛化能力。该方法不需要构造负数据集,避免假阴性数据的出现,同时考虑HCV‑宿主蛋白质相互作用的网络结构信息,提升预测效果。

    一种大数据可视化展示装置
    4.
    发明公开

    公开(公告)号:CN115547208A

    公开(公告)日:2022-12-30

    申请号:CN202211157444.7

    申请日:2022-09-22

    发明人: 刘莘 王飞 朴雪

    摘要: 本发明属于生物信息展示技术领域,具体为一种大数据可视化展示装置,包括底座,所述底座的顶部中间设置有电动转盘,所述电动转盘的顶部设置有电动伸缩杆,所述电动伸缩杆的顶部设置有限位挡块;滑套,所述滑套设置在电动伸缩杆的表面,所述滑套的表面设置有安装架,所述安装架的一侧设置有安装板,所述安装板的一侧设置有展示板,所述展示板上设置有限位卡块,所述安装板上设置有相配合的限位卡槽,且所述展示板通过限位卡块与限位卡槽与安装板连接,其结构合理,在使用的过程中,方便安装拆卸,且便于调节高度角度,提高展示效率,同时便于远程展示和在线展示。