一种水痘-带状疱疹病毒的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN114790494B

    公开(公告)日:2024-03-22

    申请号:CN202111301065.6

    申请日:2021-11-04

    申请人: 江汉大学

    IPC分类号: C12Q1/70 C12Q1/6858 C12N15/11

    摘要: 本发明公开了一种水痘‑带状疱疹病毒的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在水痘‑带状疱疹病毒基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑15的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.30所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定水痘‑带状疱疹病毒并监测变异;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏、高精准和免培养的检测优势,可应用于大规模样本的水痘‑带状疱疹病毒的鉴定和遗传变异检测,对水痘‑带状疱疹病毒的科研和防疫监测均具有重要意义。

    一种金黄色葡萄球菌的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN114790488B

    公开(公告)日:2023-12-22

    申请号:CN202111301125.4

    申请日:2021-11-04

    申请人: 江汉大学

    摘要: 本发明公开了一种金黄色葡萄球菌的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在金黄色葡萄球菌基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑15的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.30所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定金黄色葡萄球菌并精细的区分不同的小种;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏、高精准和免培养的检测优势,可应用于大规模样本的金黄色葡萄球菌的鉴定和遗传变异检测,对金黄色葡萄球菌的科研和卫生监测均具有重要意义。

    一种检测玉米转基因品系的引物组、试剂盒及检测方法

    公开(公告)号:CN114507750B

    公开(公告)日:2023-06-20

    申请号:CN202210195225.1

    申请日:2022-02-28

    申请人: 江汉大学

    摘要: 本申请涉及生物技术领域,尤其涉及一种检测玉米转基因品系的引物组、试剂盒及检测方法;所述引物组包括29对检测引物对,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.58所示;引物对中引物的长度为18bp~30bp;所述试剂盒包括引物组;所述方法包括:分别得到玉米转基因品系和玉米内参基因的核苷酸序列;根据核苷酸序列,分别设计出引物组;提取待检样品的基因组DNA,得到待测玉米品系的基因组DNA;以基因组DNA为模板,以引物组为扩增引物进行PCR扩增,得到扩增产物;将扩增产物进行高通量测序,得到高通量测序数据;对高通量测序数据进行分析,确定待测玉米样品中是否含有转基因品系;通过设计出引物长度为18bp~30bp的29对检测引物,在同一PCR反应中实现多个靶标分子的同时检测。

    一种去除扩增子测序中扩增产物残余污染的方法及其应用

    公开(公告)号:CN116162684A

    公开(公告)日:2023-05-26

    申请号:CN202310128111.X

    申请日:2023-02-17

    申请人: 江汉大学

    摘要: 本申请涉及基因测序技术领域,尤其涉及一种去除扩增子测序中扩增产物残余污染的方法及其应用,所述方法包括:在构建待测样本的测序文库的第一步PCR反应体系中加入DNA Spike‑ins,后以第一多重扩增引物进行第一步PCR扩增,得到第一扩增产物;向所述第一扩增产物中加入第二步PCR反应体系和第二PCR扩增引物,并进行第二步PCR扩增,得到测序文库;DNA Spike‑ins依据待测样本中目标生物的基因组标记位点的序列设计并合成;第一步PCR反应体系包括dUTP和UDG;第二步PCR反应体系包括dUTP;通过在第一步PCR反应体系中加入DNA Spike‑ins,减少扩增产物残余污染的扩增,再在每步PCR反应体系中加入dUTP,并在第一步PCR反应体系中加入UDG,能降解含尿嘧啶的PCR产物,去除扩增产物残余污染。