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公开(公告)号：CN117417995A
公开(公告)日：2024-01-19
申请号：CN202311401280.2
申请日：2023-10-26
申请人： 河南省华之源生物技术有限公司 , 郑州华之源医学检验实验室有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869
摘要： 本申请涉及一种基于荧光淬灭的固态纳米孔测序方法和应用。该方法包括：S1，将包含待测核酸片段的测序文库添加到纳米孔测序装置中电解池的正极腔室；S2，在电解池的正极和负极之间施加易位电压，使待测核酸片段穿过固态纳米孔薄膜上的固态纳米孔通道；其中固态纳米孔薄膜设置于电解池的正极和负极之间，以将电解池分隔成正极腔室和负极腔室，且固态纳米孔通道内修饰有荧光基团；S3，捕捉待测核酸通过固态纳米孔通道时发出的荧光信号和离子电流变化信号；S4，对捕捉的荧光信号和离子电流变化信号进行分析，进而确定待测核酸片段的碱基序列。该方法将光学检测和固态纳米孔检测相结合，能高通量、快速、准确、低成本对核酸进行大规模测序。
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公开(公告)号：CN118585761A
公开(公告)日：2024-09-03
申请号：CN202410718590.5
申请日：2024-06-05
申请人： 河南省华之源生物技术有限公司
IPC分类号： G06F18/15 , G06F18/213 , G16B50/10 , G16B40/00
摘要： 本发明提供一种使用自适应阈值和双边累积和算法对纳米孔电流数据进行清洗和拟合的方法，该方法使用自适应阈值检测固态或者生物纳米孔中的event，使用双边累积和算法，即双边CUSUM算法完成对上述event中的level的精确拟合，实现了与本研发的仪器配套的数据算法和处理、event的划分和level的识别，以及实现了level的拟合，操作步骤的简单化。本发明提供的使用自适应阈值和双边累积和算法对纳米孔电流数据进行清洗和拟合方法，是一种分析纳米孔传感实验中采集的信号的新方法，该方法能够快速且自动化，几乎不需要输入信号的先验知识，解决基线漂移带来的阈值检测误差问题，对于后期数据的分析提供了非常重要的预处理作用，解决了仪器采集的数据难以处理和分析的问题。
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公开(公告)号：CN117805373A
公开(公告)日：2024-04-02
申请号：CN202311822725.4
申请日：2023-12-27
申请人： 河南省华之源生物技术有限公司
IPC分类号： G01N33/569
摘要： 本发明公开了一种利用固态孔纳米技术检测细菌的方法，涉及食品检测控制的病原体微生物的细菌类检测领域，首先通过细菌富集得到呈黑色沉淀状的细菌样本；之后进行硅烷化的氮化硅固态孔的修饰，最后进行细菌检测，即将检测缓冲液加入上述硅烷化的氮化硅固态孔中，并加入富集后的细菌样本，在+150mV电压下检测细菌过孔信号即可。本发明提出一种新型的链霉亲和素Fe3O4磁珠法富集细菌，以及利用硅烷化修饰氮化硅固态孔的方法，利用修饰的磁珠在短时间内对样本快速富集，并利用设计修饰后的固态纳米孔实现对细菌实现快检，节约检测时间，减少人工操作。
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公开(公告)号：CN118275691A
公开(公告)日：2024-07-02
申请号：CN202410380070.8
申请日：2024-03-30
申请人： 河南省华之源生物技术有限公司
摘要： 本发明公开了一种基于固态纳米孔检测外泌体生物标志物表面蛋白的方法，涉及生物医学技术领域，首先对固态纳米孔进行活化处理，接着通过利用紫外线照射还原HAuCl4，用金膜沉积一个纳米孔表面，然后将硫代化的DNA适配体组装到纳米孔表面，该DNA适配体可以特异性地结合外泌体表面的蛋白，从而减少纳米孔的有效孔径。然后用mPEG‑SH 2000对纳米孔表面进行修饰，以减少非特异性吸附。制得复合固态纳米孔，使用所述复合纳米孔检测外泌体表面蛋白的过孔信号，实现了对单个细胞外泌体分泌的检测。本发明方法操作简便快速、具体高灵敏度、特异性、实时性、单分子检测能力，为外泌体的检测提供了新方向。
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公开(公告)号：CN117076929A
公开(公告)日：2023-11-17
申请号：CN202311099563.6
申请日：2023-08-29
申请人： 河南省华之源生物技术有限公司
IPC分类号： G06F18/214 , G06F18/15 , G06F18/2131 , G06F18/24 , G06N3/0464 , G06N3/08
摘要： 本申请涉及生物技术领域，尤其涉及一种生物纳米孔信号识别方法及存储介质。其方法包括，将具有分类为ATCG的标准信号数据作为训练集的执行数据输入预设训练模型中进行训练，并将数据归一化后的特征值转化为对应的特征矩阵；根据卷积层对特征矩阵进行处理，生成时域上的卷积矩阵；对卷积矩阵进行傅里叶变换，生成频域上的目标特征矩阵；根据预设激活函数对目标特征矩阵进行激活操作，生成对应的非线性特征矩阵；然后进行傅里叶逆变换，生成对应的时域特征；时域特征经过全连接层和输出层处理，输出对应的目标特征集；根据束搜索算法对目标特征集进行解码，生成对应的目标碱基序列信息。本申请技术方案可提升生物纳米孔信号的识别效果。
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公开(公告)号：CN117887826A
公开(公告)日：2024-04-16
申请号：CN202410085575.1
申请日：2024-01-22
申请人： 河南省华之源生物技术有限公司
IPC分类号： C12Q1/6869
摘要： 本发明公开了一种由脂质体囊泡介导的纳米孔测序方法，涉及基因组测序领域，首先在流体池内的两个半池中构成闭合回路，之后缓慢用注射器向有机相中吹打多个由脂质体形成的囊泡，注射器内孔蛋白与测序样品被包裹在一个个囊泡中，在电场驱动下使囊泡游离在通道孔附近后，将其刺破，则通道周围的单质分子层变成双脂质分子层，控制易位电压使孔蛋白插入双脂质分子层中在两半池中间形成纳米孔，在纳米孔附近加入控速蛋白，从而驱动纳米孔附近的测序样品核酸以设定的易位速度持续过孔测序。本发明方法能够通过调控蛋白的调速，实现较高的测序速度，且纳米孔测序过程稳定，操作简单，效率高，能够实现较高的捕获率。
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