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公开(公告)号：CN109920485B
公开(公告)日：2023-10-31
申请号：CN201910202272.2
申请日：2019-03-18
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： G16B30/00
摘要： 本发明公开了对测序序列进行变异模拟的方法及其应用，其中，对测序序列进行变异模拟的方法包括：获取待模拟区域的碱基序列；将所述碱基序列进行变异状态标记，以便得到标记后的特征串；选取待添加的变异；将所述待添加的变异整合至所述标记后的特征串上，以便得到添加变异后的特征串；以及将所述添加变异后的特征串进行碱基还原，以便得到变异模拟后的序列。该方法通过对碱基序列的变异状态进行标记，设定碱基的变异类型，从而对各种变异进行模拟，变异模拟的方法简单，生成速度快，并能根据需要设计特殊的变异组合用于测试，变异模拟后的序列的仿真程度高。
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公开(公告)号：CN111073952B
公开(公告)日：2023-09-22
申请号：CN201910202577.3
申请日：2019-07-15
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C40B50/06
摘要： 本发明公开了构建DNA文库的方法及其应用。其中，该方法包括将DNA样本进行末端修复后，利用耐高温聚合酶对DNA样本进行加腺苷酸尾处理，以便得到加尾后的DNA，其中，所述末端修复和所述加腺苷酸尾处理是连续进行的；以及将所述加尾后的DNA进行接头连接处理，以便得到连接产物，DNA文库其中，所述末端修复和加腺苷酸尾处理的条件是：27‑37摄氏度，5‑30分钟；70‑75摄氏度，10‑20分钟。该方法末端修复和加腺苷酸尾处理连续进行，中间无需纯化处理，稳定性好，同时还显著缩短了反应时间和反应流程。
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公开(公告)号：CN109801677A
公开(公告)日：2019-05-24
申请号：CN201811636702.3
申请日：2018-12-29
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达生命科学研究院 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
摘要： 公开了一种用于染色体异常检测的测序数据自动化分析方法、装置和电子设备。该方法包括：获取原始数据；从用户接收分析指令；基于所述分析指令从所述原始数据获取批次数据；将所述批次数据拆分为样本数据；将拆分后的样本数据进行数据质控；以及，对数据质控成功的每条所述样本数据进行染色体非整倍体及基因微缺失分析以获得分析结果。这样，能够基于用户指令直接从原始数据获得染色体非整倍体及基因微缺失分析结果，从而降低染色体分析的人力和时间成本并提高易用性。
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公开(公告)号：CN109801677B
公开(公告)日：2023-05-23
申请号：CN201811636702.3
申请日：2018-12-29
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达生命科学研究院 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
摘要： 公开了一种用于染色体异常检测的测序数据自动化分析方法、装置和电子设备。该方法包括：获取原始数据；从用户接收分析指令；基于所述分析指令从所述原始数据获取批次数据；将所述批次数据拆分为样本数据；将拆分后的样本数据进行数据质控；以及，对数据质控成功的每条所述样本数据进行染色体非整倍体及基因微缺失分析以获得分析结果。这样，能够基于用户指令直接从原始数据获得染色体非整倍体及基因微缺失分析结果，从而降低染色体分析的人力和时间成本并提高易用性。
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公开(公告)号：CN109754845B
公开(公告)日：2020-02-28
申请号：CN201910202594.7
申请日：2019-03-18
IPC分类号： G16B30/10
摘要： 本发明公开了模拟目标疾病仿真测序文库的方法及其应用，其中，该模拟目标疾病仿真测序文库的方法能根据需要得到不同体系和胚系变异特征、杂合/纯合比例和不同患病序列纯度，有针对性地模拟出了捕获测序条件下的下机数据。并且，该方法既能模拟全基因组下机数据，也能模拟捕获测序下机数据，适用范围广。同时，该方法运行速度快，能够在较短的时间内生成所需的模拟序列，并且模拟得到的序列的仿真程度高。
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公开(公告)号：CN109754845A
公开(公告)日：2019-05-14
申请号：CN201910202594.7
申请日：2019-03-18
IPC分类号： G16B30/10
摘要： 本发明公开了模拟目标疾病仿真测序文库的方法及其应用，其中，该模拟目标疾病仿真测序文库的方法能根据需要得到不同体系和胚系变异特征、杂合/纯合比例和不同患病序列纯度，有针对性地模拟出了捕获测序条件下的下机数据。并且，该方法既能模拟全基因组下机数据，也能模拟捕获测序下机数据，适用范围广。同时，该方法运行速度快，能够在较短的时间内生成所需的模拟序列，并且模拟得到的序列的仿真程度高。
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公开(公告)号：CN111378720A
公开(公告)日：2020-07-07
申请号：CN201910211343.5
申请日：2019-03-20
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06
摘要： 本发明公开了长链非编码RNA的测序文库构建方法及其应用。其中，该长链非编码RNA的测序文库构建方法包括：对所述待测样本进行去除rRNA处理，以便得到去除rRNA的产物；基于所述去除rRNA的产物进行逆转录处理，以便得到单链DNA，其中，所述逆转录处理的引物具有SEQ ID NO：1所示的序列；将所述单链DNA进行第一扩增处理，以便得到双链DNA；将所述双链DNA进行片段化处理，以便得到DNA片段；以及将所述DNA片段进行第二扩增处理，所述第二扩增的产物构成所述测序文库。该方法先通过rRNA去除探针去除rRNA，再进行逆转录，避免了大量的rRNA对mRNA和lncRNA逆转录的影响，并且，利用rRNA去除探针去除rRNA，rRNA的去除率高，方法的稳定性好。
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公开(公告)号：CN111073952A
公开(公告)日：2020-04-28
申请号：CN201910202577.3
申请日：2019-07-15
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C40B50/06
摘要： 本发明公开了构建DNA文库的方法及其应用。其中，该方法包括将DNA样本进行末端修复后，利用耐高温聚合酶对DNA样本进行加腺苷酸尾处理，以便得到加尾后的DNA，其中，所述末端修复和所述加腺苷酸尾处理是连续进行的；以及将所述加尾后的DNA进行接头连接处理，以便得到连接产物，DNA文库其中，所述末端修复和加腺苷酸尾处理的条件是：27-37摄氏度，5-30分钟；70-75摄氏度，10-20分钟。该方法末端修复和加腺苷酸尾处理连续进行，中间无需纯化处理，稳定性好，同时还显著缩短了反应时间和反应流程。
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公开(公告)号：CN109949865A
公开(公告)日：2019-06-28
申请号：CN201910202273.7
申请日：2019-03-18
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 安诺优达生命科学研究院
IPC分类号： G16B30/00
摘要： 公开了一种序列截取方法、装置和电子设备。该方法包括：获取参考序列，所述参考序列以遍历方式读取且包括多个段落；获取多个待截取序列的段落信息和位点信息；按照所述参考序列的遍历顺序，基于所述段落信息和所述位点信息对所述多个待截取序列进行排序；以及，在遍历所述参考序列的同时，基于所述段落信息和所述位点信息从所述参考序列中依顺序截取所述多个待截取序列。这样，即使针对无索引的参考序列和存在重叠和嵌套的多个待截取序列，也可以通过遍历该参考序列一次性截取该多个待截取序列，从而显著地提高了截取效率。
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公开(公告)号：CN109949865B
公开(公告)日：2020-03-31
申请号：CN201910202273.7
申请日：2019-03-18
申请人： 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司 , 安诺优达生命科学研究院
IPC分类号： G16B30/00
摘要： 公开了一种序列截取方法、装置和电子设备。该方法包括：获取参考序列，所述参考序列以遍历方式读取且包括多个段落；获取多个待截取序列的段落信息和位点信息；按照所述参考序列的遍历顺序，基于所述段落信息和所述位点信息对所述多个待截取序列进行排序；以及，在遍历所述参考序列的同时，基于所述段落信息和所述位点信息从所述参考序列中依顺序截取所述多个待截取序列。这样，即使针对无索引的参考序列和存在重叠和嵌套的多个待截取序列，也可以通过遍历该参考序列一次性截取该多个待截取序列，从而显著地提高了截取效率。
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