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公开(公告)号:CN109920485B
公开(公告)日:2023-10-31
申请号:CN201910202272.2
申请日:2019-03-18
申请人: 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号: G16B30/00
摘要: 本发明公开了对测序序列进行变异模拟的方法及其应用,其中,对测序序列进行变异模拟的方法包括:获取待模拟区域的碱基序列;将所述碱基序列进行变异状态标记,以便得到标记后的特征串;选取待添加的变异;将所述待添加的变异整合至所述标记后的特征串上,以便得到添加变异后的特征串;以及将所述添加变异后的特征串进行碱基还原,以便得到变异模拟后的序列。该方法通过对碱基序列的变异状态进行标记,设定碱基的变异类型,从而对各种变异进行模拟,变异模拟的方法简单,生成速度快,并能根据需要设计特殊的变异组合用于测试,变异模拟后的序列的仿真程度高。
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公开(公告)号:CN111073952B
公开(公告)日:2023-09-22
申请号:CN201910202577.3
申请日:2019-07-15
申请人: 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号: C12Q1/6806 , C40B50/06
摘要: 本发明公开了构建DNA文库的方法及其应用。其中,该方法包括将DNA样本进行末端修复后,利用耐高温聚合酶对DNA样本进行加腺苷酸尾处理,以便得到加尾后的DNA,其中,所述末端修复和所述加腺苷酸尾处理是连续进行的;以及将所述加尾后的DNA进行接头连接处理,以便得到连接产物,DNA文库其中,所述末端修复和加腺苷酸尾处理的条件是:27‑37摄氏度,5‑30分钟;70‑75摄氏度,10‑20分钟。该方法末端修复和加腺苷酸尾处理连续进行,中间无需纯化处理,稳定性好,同时还显著缩短了反应时间和反应流程。
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公开(公告)号:CN107794257B
公开(公告)日:2022-05-17
申请号:CN201611046398.8
申请日:2016-11-23
IPC分类号: C12N15/10 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06
摘要: 本发明涉及一种DNA大片段文库的构建方法及其应用。本发明提供的DNA大片段文库的构建方法用于DNA大片段文库的构建,通过采用FLP/FRT特异性重组系统优化建库流程,提高了大片段文库测序结果的有效数据率。
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公开(公告)号:CN108265048B
公开(公告)日:2021-07-09
申请号:CN201611264653.6
申请日:2016-12-30
IPC分类号: C12N15/10
摘要: 本发明涉及一种用于孕妇血浆游离DNA非特异性复制的试剂盒。本发明的试剂盒包括用于加接头的试剂、用于PCR扩增的试剂、用于切割的试剂。应用本发明的试剂盒进行孕妇血浆游离DNA复制具有以下优点:不引入外来序列,获得大量与孕妇血浆游离DNA基本相同的可利用DNA片段。
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公开(公告)号:CN110021357B
公开(公告)日:2021-06-04
申请号:CN201810256018.6
申请日:2018-03-27
申请人: 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号: G16B30/00
摘要: 本发明涉及一种模拟癌症基因组测序数据生成装置,其包括人参考基因组序列位置信息获取模块、捕获区域参考基因组序列获取模块、癌症基因组变异数据模拟模块、模拟癌症基因组测序数据生成模块以及模拟癌症基因组测序数据输出模块。根据本发明,提供了一种能够对各种类型的变异进行模拟、使得生成的模拟测序数据能够适用于评估各种检测软件的性能的算法及装置。
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公开(公告)号:CN111100905B
公开(公告)日:2021-04-06
申请号:CN201911354966.4
申请日:2019-12-25
申请人: 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
IPC分类号: C12Q1/6806
摘要: 本发明公开了缓冲液及其应用,其中,该缓冲液包括:33‑66mM Tris缓冲液,1.6‑5mM二价阳离子、25‑75mM一价阳离子、0.5‑10mM二硫苏糖醇(DTT)、5‑15%PEG4000‑8000和0.5‑2mM ATP,pH值为7‑9。该缓冲液能提高连接反应效率,增加底物的转化率,降低连接反应的错配率,并且兼容性好,对连接酶的抑制作用小,同时,显著降低体系用酶量,从而降低了实验的成本。
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公开(公告)号:CN106929504B
公开(公告)日:2020-01-10
申请号:CN201511020840.5
申请日:2015-12-30
IPC分类号: C12N15/10 , C12Q1/6806 , C40B50/06
摘要: 本发明涉及检测急性早幼粒细胞白血病相关融合基因的试剂盒。具体而言,提供一种基于二代测序技术的、可同时检测急性早幼粒细胞白血病(APL)相关的多种RARα融合基因的检测试剂盒、基因检测方法,以及用于上述检测方法的二代测序DNA文库的构建方法、建库试剂盒。本发明的检测试剂盒包含用于构建二代测序DNA文库的试剂,以及用于对二代测序DNA文库进行上机测序的试剂。
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公开(公告)号:CN109801677A
公开(公告)日:2019-05-24
申请号:CN201811636702.3
申请日:2018-12-29
申请人: 浙江安诺优达生物科技有限公司 , 安诺优达生命科学研究院 , 安诺优达基因科技(北京)有限公司
摘要: 公开了一种用于染色体异常检测的测序数据自动化分析方法、装置和电子设备。该方法包括:获取原始数据;从用户接收分析指令;基于所述分析指令从所述原始数据获取批次数据;将所述批次数据拆分为样本数据;将拆分后的样本数据进行数据质控;以及,对数据质控成功的每条所述样本数据进行染色体非整倍体及基因微缺失分析以获得分析结果。这样,能够基于用户指令直接从原始数据获得染色体非整倍体及基因微缺失分析结果,从而降低染色体分析的人力和时间成本并提高易用性。
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公开(公告)号:CN109321984A
公开(公告)日:2019-02-12
申请号:CN201710647896.6
申请日:2017-08-01
CPC分类号: C40B40/06 , C12N15/1093 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06 , C12Q2531/113 , C12Q2535/122
摘要: 本发明涉及一种测序用DNA文库。本发明的测序用DNA文库包括第一双链DNA分子,所述第一双链DNA分子包括第一DNA链,该第一DNA链从5'端起依次包括位于5'端的桥式引物DNA序列1、目的片段特异性扩增引物DNA序列1、待读取DNA序列S、目的片段特异性扩增引物DNA序列2的反向互补序列以及位于3'端的桥式引物DNA序列2的反向互补序列,所述桥式引物DNA序列1和所述桥式引物DNA序列2是测序芯片上的DNA序列,所述目的片段特异性扩增引物DNA序列1和所述目的片段特异性扩增引物DNA序列2用于对包含待读取DNA序列S的目的DNA片段进行特异性扩增的引物DNA序列。本发明的测序用DNA文库能够增加单轮测序反应中碱基读取复杂度,从而提高测序质量。
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公开(公告)号:CN104789686B
公开(公告)日:2018-09-07
申请号:CN201510226909.3
申请日:2015-05-06
IPC分类号: C12Q1/6883
摘要: 本发明公开了一种检测染色体非整倍性的试剂盒和装置。该装置包括以下模块:检测模块用于对待测样本进行高通量测序得到测序数据;第一判断模块用于对染色体以切分成窗口的形式进行计算得到各染色体的Z值,并根据各染色体的Z值初步判断各染色体是否存在非整倍性;第一计算模块用于计算得到待测样本中胎儿DNA的第一浓度值;第二计算模块,用于根据X染色体或甲基化的方法计算得到待测样本中胎儿DNA的第二浓度值;第二判断模块:用于判断待测样本中胎儿DNA的第一浓度值与第二浓度值是否被曲线y=x所拟合;第一确定模块,用于确定染色体的拷贝数存在非整倍性。该检测装置检测染色体非整倍性的准确度更高。
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