一种利用简化基因组测序数据鉴定蚕豆SNP的方法

    公开(公告)号:CN112553361A

    公开(公告)日:2021-03-26

    申请号:CN202011310367.5

    申请日:2020-11-20

    摘要: 本发明公开了一种利用简化基因组测序数据鉴定蚕豆SNP的方法,包括:步骤一、提取样品基因组DNA;步骤二、构建RAD文库,基因组DNA使用EcoRI酶切,利用PCR扩增法富集文库,采用琼脂糖凝胶回收目的条带,单末端进行测序;步骤三、生成原始序列并进行序列质控分析,根据序列相似性将高质量序列聚类生成RAD‑tags,将RAD‑tags聚类分群进行SNP calling,矫正SNP基因型;步骤四、KASP标记开发与SNP基因分型。本发明方法利用基因组测序数据挖掘SNP,不仅可以鉴定出基因表达区域的SNP突变,还可以鉴定出基因内部和基因间等非编码区域的SNP突变,SNP来源更丰富。

    快速检测瓠瓜品种种子纯度方法及其试剂盒

    公开(公告)号:CN102251042A

    公开(公告)日:2011-11-23

    申请号:CN201110207456.1

    申请日:2011-07-22

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: 本发明公开了快速检测瓠瓜品种种子纯度方法及其试剂盒,属于作物生物技术领域。方法包括:(一)瓠瓜基因组DNA的部分测序和SSR引物开发设计;(二)SSR引物多态性信息含量PIC计算和诊断性SSR引物组合筛选;(三)瓠瓜5个主栽品种标准DNA指纹图谱的制备;(四)待测瓠瓜样品的检测等步骤工艺。该方法应用自主设计的8对诊断性SSR引物,增强了鉴别近似品种的能力,提高了检测的效率,由传统田间表现型鉴定的50-60天缩短为4-5小时,降低了检测费用,约为传统方法的六分之一,并提高了鉴定的准确性。本发明可在育种和种子企业中推广应用。

    一种用于精准、快速鉴定瓠瓜品种‘浙蒲903’的SNP标记及KASP引物组

    公开(公告)号:CN118813846A

    公开(公告)日:2024-10-22

    申请号:CN202410886655.7

    申请日:2024-07-03

    摘要: 本发明涉及一种精准、快速鉴定瓠瓜新品种‘浙蒲903’的SNP标记位点及KASP引物对,结合KSAP技术,可实现瓠瓜新品种‘浙蒲903’F1杂交种准确、简便、快速地鉴定,优势明显。操作简单便捷、不受人为和环境因素的影响且大大缩短了鉴定周期,只需要3个SNP位点就可以把瓠瓜新品种‘浙蒲903’在不同瓠瓜品种中鉴别出来。应用这种分子标记鉴定瓠瓜品种,操作相对简单,克服了表型鉴定的缺陷,大大提高瓠瓜优良新品种鉴定的准确性,避免种植户等消费者受到假冒品种带来的损失,有效降低了成本。