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公开(公告)号:CN107002150B
公开(公告)日:2020-09-01
申请号:CN201580068286.X
申请日:2015-01-09
Applicant: 深圳华大基因研究院
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6874
Abstract: 本发明公开了一种DNA合成产物的高通量检测方法,包括如下步骤:将多个DNA组件分别连入克隆载体并转入筛选菌株中,筛选出连接有DNA组件的克隆;分别对克隆进行编号,并培养出相应克隆菌液;选取编号相同的克隆菌液混合并提取质粒;连接测序标签,构建多个混合测序文库,其中不同混合测序文库的测序标签不同;进行混样高通量测序,得到DNA组件的序列;与参考序列进行比对,得到DNA合成产物中具有设定正确率的目标DNA组件。本发明的方法通过混合文库构建策略,将高通量测序技术运用于DNA芯片合成产物的检测,降低产物检测和正确产物筛选成本。
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公开(公告)号:CN105820965B
公开(公告)日:2019-08-13
申请号:CN201510008356.4
申请日:2015-01-08
Applicant: 深圳华大基因研究院
Abstract: 本发明提供了人工合成的酿酒酵母菌株及其用途。更具体而言,本发明提供了一株人工合成II号染色体的酿酒酵母菌株,该酿酒酵母菌株于2014年9月19日保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏号为CCTCC NO:M 2014434。所述酿酒酵母菌株可用于代谢产物的优化生产;通过诱导SCRaMbLE产生突变体库,用于筛选具有各种特性的菌株;作为筛选工具,对加入的代谢通路进行高通量筛选。
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公开(公告)号:CN107250446A
公开(公告)日:2017-10-13
申请号:CN201580075708.6
申请日:2015-06-11
Applicant: 深圳华大基因研究院
Abstract: 一种寡核苷酸及其应用。所述寡核苷酸包括:基因编码区域;形成于基因编码区5'端的第一侧翼序列,以及形成于基因编码区3'端的第二侧翼序列,其中,第一侧翼序列从5'端到3'端依次形成有板子库分选引物结合序列、组件子库分选引物结合序列以及酶切位点,第二侧翼序列从5'端到3'端依次形成有酶切位点、组件子库分选引物结合序列以及板子库分选引物结合序列。
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公开(公告)号:CN106318965A
公开(公告)日:2017-01-11
申请号:CN201510367496.0
申请日:2015-06-26
Applicant: 深圳华大基因研究院
Abstract: 本发明公开了人工半合成染色体整合方法及含有完整合成染色体的微生物,该方法包括:(1)分别提供第一人工半合成染色体和第二人工半合成染色体,其中,所述第一人工半合成染色体和所述第二人工半合成染色体均包括合成染色体部分和野生型部分,所述第一人工半合成染色体和所述第二人工半合成染色体之间具有整合同源区,所述第一人工半合成染色体和所述第二人工半合成染色体均携带预定酶切位点;(2)将所述第一人工半合成染色体和所述第二人工半合成染色体在表达预定酶的菌株中进行同源重组,以便获得完整合成染色体,其中,所述预定酶能够特异性识别所述预定酶切位点。该方法能够有效地用于两条人工半合成染色体的整合。
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公开(公告)号:CN106282224A
公开(公告)日:2017-01-04
申请号:CN201610474430.6
申请日:2016-06-24
Applicant: 深圳华大基因研究院
Abstract: 本发明提出了在靶细胞中构建人工染色体的方法及真核细胞,该方法包括:(1)提供多个一级核酸序列,并且沿着所述人工染色体的序列,相邻两个所述一级核酸序列之间存在一级核酸序列同源区;(2)利用组装体系,将所述多个一级核酸序列中的至少一部分进行组装,以便获得多个二级核酸序列;(3)将所述多个二级核酸序列的至少一部分引入靶细胞,使二级核酸序列与靶细胞的染色体发生同源重组,从而在所述靶细胞的染色体中形成三级核酸序列;(4)重复步骤(3)至少一次,以便在所述靶细胞中形成人工合成半染色体;(5)将位于不同靶细胞的两条所述人工合成半染色体通过同源重组整合形成人工染色体。利用该方法能够有效地在靶细胞中构建人工染色体。
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公开(公告)号:CN107002150A
公开(公告)日:2017-08-01
申请号:CN201580068286.X
申请日:2015-01-09
Applicant: 深圳华大基因研究院
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种DNA合成产物的高通量检测方法,包括如下步骤:将多个DNA组件分别连入克隆载体并转入筛选菌株中,筛选出连接有DNA组件的克隆;分别对克隆进行编号,并培养出相应克隆菌液;选取编号相同的克隆菌液混合并提取质粒;连接测序标签,构建多个混合测序文库,其中不同混合测序文库的测序标签不同;进行混样高通量测序,得到DNA组件的序列;与参考序列进行比对,得到DNA合成产物中具有设定正确率的目标DNA组件。本发明的方法通过混合文库构建策略,将高通量测序技术运用于DNA芯片合成产物的检测,降低产物检测和正确产物筛选成本。
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公开(公告)号:CN105821072A
公开(公告)日:2016-08-03
申请号:CN201610044240.0
申请日:2016-01-22
Applicant: 深圳华大基因研究院
CPC classification number: C12N15/81 , C12N15/102 , C12N15/11 , C12N2310/10 , C12N2800/102 , C12N2800/80 , C12N2810/10 , C12R1/865
Abstract: 本发明公开了一种用于DNA组装的CRISPR-Cas9系统及DNA组装方法,所述CRISPR-Cas9系统包括如下组成部分:用于表达Cas9基因的质粒;和第一向导RNA和/或用于表达所述第一向导RNA的质粒,其中所述第一向导RNA具有CRISPR位点,该CRISPR位点依据碱基互补配对原则结合用于组装的半合成染色体所携带的第一报告基因。本发明的CRISPR-Cas9系统具有同源重组替换成功率高、需要设计和使用的向导RNA种类少、基因组序列受到的有害影响少、脱靶率低的优势。
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公开(公告)号:CN105820965A
公开(公告)日:2016-08-03
申请号:CN201510008356.4
申请日:2015-01-08
Applicant: 深圳华大基因研究院
Abstract: 本发明提供了人工合成的酿酒酵母菌株及其用途。更具体而言,本发明提供了一株人工合成II号染色体的酿酒酵母菌株,该酿酒酵母菌株于2014年9月19日保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏号为CCTCC NO:M 2014434。所述酿酒酵母菌株可用于代谢产物的优化生产;通过诱导SCRaMbLE产生突变体库,用于筛选具有各种特性的菌株;作为筛选工具,对加入的代谢通路进行高通量筛选。
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公开(公告)号:CN119506360A
公开(公告)日:2025-02-25
申请号:CN202311002764.X
申请日:2023-08-10
Applicant: 深圳华大生命科学研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
IPC: C12N15/87
Abstract: 本发明提供了一种向植物中导入目标DNA片段的方法及其应用,所述方法包括:将细胞核基因组中包含所述目标DNA片段的小立碗藓原生质体与植物原生质体进行电融合,实现向植物中导入所述目标DNA片段。本发明通过前期的条件摸索,建立了小立碗藓和植物的细胞融合体系,能较好地实现细胞融合及后续融合培养物的稳定培养。本发明利用小立碗藓和拟南芥融合实现目标DNA片段的转移,有望在植物基因组合成和植物定制化改造研究等应用领域发挥关键性作用,具有较为重要的应用价值。
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