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公开(公告)号:CN106701750B
公开(公告)日:2019-07-26
申请号:CN201710117716.3
申请日:2017-03-01
申请人: 深圳华大基因股份有限公司 , 山东省农业科学院奶牛研究中心 , 东阿阿胶股份有限公司
IPC分类号: C12N15/11 , C12Q1/6888
摘要: 本发明公开了一种鉴定地方驴品种的方法及其专用试剂盒。本发明所提供的方法包括如下步骤:提取待测样本的总DNA并检测在SNP位点组合的基因型,根据检测结果判断待测样本是否来源于地方驴品种的后代;SNP位点组合由组合Ⅰ、组合Ⅱ、组合Ⅲ、组合Ⅳ、组合Ⅴ、组合Ⅵ、组合Ⅶ、组合Ⅷ和组合Ⅸ组成,依次含有2个、6个、3个、1个、7个、4个、4个、1个和2个特异性SNP位点。实验证明,本发明提供的方法鉴定待测样本是否来源于地方驴品种的后代具有较高的准确率,并可方便、快捷鉴定驴品种或纯度。本发明具有重要的应用价值。
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公开(公告)号:CN106701750A
公开(公告)日:2017-05-24
申请号:CN201710117716.3
申请日:2017-03-01
申请人: 深圳华大基因股份有限公司 , 山东省农业科学院奶牛研究中心 , 东阿阿胶股份有限公司
CPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q2600/156
摘要: 本发明公开了一种鉴定地方驴品种的方法及其专用试剂盒。本发明所提供的方法包括如下步骤:提取待测样本的总DNA并检测在SNP位点组合的基因型,根据检测结果判断待测样本是否来源于地方驴品种的后代;SNP位点组合由组合Ⅰ、组合Ⅱ、组合Ⅲ、组合Ⅳ、组合Ⅴ、组合Ⅵ、组合Ⅶ、组合Ⅷ和组合Ⅸ组成,依次含有2个、6个、3个、1个、7个、4个、4个、1个和2个特异性SNP位点。实验证明,本发明提供的方法鉴定待测样本是否来源于地方驴品种的后代具有较高的准确率,并可方便、快捷鉴定驴品种或纯度。本发明具有重要的应用价值。
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公开(公告)号:CN109994153B
公开(公告)日:2020-11-13
申请号:CN201910280882.4
申请日:2019-04-09
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号: G16B20/20 , C12Q1/6811 , C12Q1/6888
摘要: 本发明提供一种筛选牛高原低氧适应特异分子标记的方法,并通过这一特异标记筛选适合高原低氧生存的牛品种或者个体。本发明针对牛品种高原低氧适应的遗传特性,从基因组进化、选择和适应的角度,选择分布于高、地海拔的地方牛品种,整合多种基因组选择信号和全基因组关联分析方法和策略,高效准确筛选适应高原低氧的关键基因和分子标记,方法设计合理,依据关键基因和标记设计的检测方法,具有准确性高、应用操作简便的特点,本发明通过对不同海拔牛品种进行分析发现了与高原低氧适应有关的基因ACSS2及其单倍型,并定位了该基因上受到最强选择信号的特异SNP,对于牛分子育种工作具有重要意义和实用价值。
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公开(公告)号:CN110669838A
公开(公告)日:2020-01-10
申请号:CN201911006567.9
申请日:2019-10-22
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号: C12Q1/6883
摘要: 本公开属于奶牛乳腺炎标志物技术领域,具体涉及LGR4作为奶牛乳腺炎预防、诊断或治疗标志物的应用。本公开以半同胞健康和大肠杆菌乳腺炎奶牛为模型,对血液嗜中性粒细胞进行DNA甲基化和RNA-seq测序,整合分析转录组和甲基化数据,筛选出奶牛嗜中性粒细胞中的关键基因LGR4。通过亚硫酸盐测序法、克隆测序法和实时荧光定量PCR实验等方法检测关键基因LGR4在血液嗜中性粒细胞中外显子区域的甲基化水平、可变剪接体和基因的表达情况,鉴定出调控LGR4基因可变剪接模式的DNA甲基化分子标记,揭示了基因外显子区DNA甲基化在奶牛乳腺炎中发挥调控作用的分子机制,为奶牛乳腺炎的抗病分子育种提供新证据。
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公开(公告)号:CN102899395B
公开(公告)日:2014-12-10
申请号:CN201210203358.5
申请日:2012-06-20
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心
IPC分类号: C12Q1/68 , C12N15/11 , A01K67/027
摘要: 本发明提供一种改善奶牛的抗乳腺炎能力的选种方法及其应用,属于动物遗传育种技术领域,通过实时荧光定量RT-qPCR和同位素标记相对和绝对定量iTRAQ的方法提供一个奶牛乳腺炎易感/抗性A2M候选基因;通过反转录RT-PCR和克隆测序分析可变剪切,同时通过基因直接测序技术检测到该基因的单核苷酸多态性SNPs,利用软件分析可变剪切和SNPs的关系,同时对体细胞评分SCS和A2M基因型进行关联分析,判断SNPs位点为功能性位点,选择有利的等位基因型个体作为奶牛抗乳腺炎能力留种。本发明通过遗传育种手段,可使奶牛增强乳腺炎的抗性,减少药物的使用量,改善牛奶质量安全,减少经济损失。
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公开(公告)号:CN103103190A
公开(公告)日:2013-05-15
申请号:CN201210540797.5
申请日:2012-12-14
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心
IPC分类号: C12N15/113 , C12N15/11 , C12Q1/68
摘要: 本发明公开了一种突变的A2M基因5端侧翼区,序列如SEQ ID NO.8所示。一种突变的A2M基因3端非翻译区,序列如SEQ ID NO.7所示。经实验证明,上述突变的A2M基因5端侧翼区作为启动子具有更强的启动活性,突变的A2M基因3端非翻译区能够影响miR-2898的结合能力,突变后3端非翻译区靶序列和miR-2898的结合能力比突变前减弱,因此,这两种突变可以在奶牛育种改良过程中作为候选基因的功能性分子标记,用于辅助选择具有更高乳腺炎抗性的个体,通过分子标记辅助选育乳腺炎抗性个体,从而培育出抗乳腺炎的优良种牛新品系。本发明还提供了检测该突变的引物、试剂盒和检测方法。
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公开(公告)号:CN102424847A
公开(公告)日:2012-04-25
申请号:CN201110440150.0
申请日:2011-12-26
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心
摘要: 本发明提供一种筛查牛退化性轴突病携带者的方法及其试剂盒,属于畜牧业技术领域,该方法以待测牛的基因组DNA为模板,设计上游引物和下游引物对其进行PCR扩增反应,然后回收PCR扩增片段,用FastDigest限制酶TspRI进行酶切,在酶切反应体系酶切后进行凝胶检测,酶切后凝胶检测酶切DNA片段为307bp的待测牛为正常牛;酶切后DNA片段为307bp、225bp和82bp的检测测牛为退化性轴突病携带者;酶切后DNA片段为225bp和82bp的检测牛为患退化性轴突病牛。该筛查方法操作简单、快捷、费用低廉、可靠性高,这一发明可以早期淘汰退化性轴突病携带牛,可以大大减少养牛业的损失。
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公开(公告)号:CN109283239B
公开(公告)日:2022-01-04
申请号:CN201811231048.8
申请日:2018-10-22
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
摘要: 本发明提供一种检测牛乳中不同β‑酪蛋白变体型的方法,所述方法包括:S1.对待测样品进行蛋白质提取;S2.采用胰蛋白酶和V8蛋白酶对提取的蛋白质进行酶解消化;S3.对蛋白质酶解的肽段进行质谱检测,鉴定β‑酪蛋白的变体型。本发明检测方法设计合理,可以有效检测乳品中的不同β‑酪蛋白变体型(A1,A2,A3,B,C,E,F,H1,I),并且检测准确性高、操作简便。本发明可以对奶牛的终端乳制品进行A2型β‑酪蛋白变体型判定,可规范A2奶乳制品市场。本发明是蛋白检测技术在生产实践上的一次很好应用,能够产生巨大的经济和社会效益。
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公开(公告)号:CN110144407A
公开(公告)日:2019-08-20
申请号:CN201910399769.8
申请日:2019-05-14
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号: C12Q1/6888 , G01N33/573 , A01K67/02
摘要: 本公开属于家畜分子遗传生物技术领域,具体涉及一种基于FBXW11甲基化评价公牛精子活力的方法及应用。通过对公牛精液转录组进行高通量测序,本公开提供了FBXW11基因及11个影响公牛精子活力的甲基化位点,通过功能注释和数据整合分析开发出可用于评价公牛精子活力高低甲基化位点标记,建立几个关键甲基化位点的Bisulfite sequencing PCR检测方法,可用于评价种公牛精子活力。采用本公开技术方案,通过对基因DNA甲基化差异情况进行分析,筛选携带理想性状的个体或者是精液样本,选育出高繁殖力的公牛和具有高精子活力的精液,以提高种公牛和母牛的繁殖效率,达到增加经济效益的目的。
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公开(公告)号:CN105925717A
公开(公告)日:2016-09-07
申请号:CN201610522855.X
申请日:2016-07-04
申请人: 山东省农业科学院奶牛研究中心
CPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q2600/156
摘要: 本发明公开了一种检测A1和A2型荷斯坦牛的方法及其试剂盒,属于分子生物学检测技术领域,该方法以待测牛的DNA为模板设计专用引物,进行PCR扩增反应,扩增片段经EcoT22I酶切后进行琼脂糖凝胶电泳检测,凝胶检测DNA片段长度为434bp的牛为A1型牛;酶切后DNA片段为434bp、385bp和49bp为A1和A2杂合型牛;酶切后DNA片段为385bp和49bp为A2型牛。该检测方法操作便捷、成本低、准确性高,可以早期筛选A2型奶牛,减少养牛业的经济损失。
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