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公开(公告)号：CN118434839A
公开(公告)日：2024-08-02
申请号：CN202180105233.6
申请日：2021-12-24
申请人： 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号： C12M1/34 , C12Q1/6806 , C12Q1/6837 , C12Q1/6869 , C40B20/02
摘要： 一种提升芯片探针数量的DNA文库序列及其应用。所述DNA文库序列包含两个以上位置信息标记序列和三个以上固定序列，其中所述位置信息标记序列和固定序列间隔设置。利用所述的DNA文库序列能够提升时空组学所用芯片的探针数量，进而提高转录本基因捕获数；具有很高的应用前景。
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公开(公告)号：CN114829627B
公开(公告)日：2024-04-30
申请号：CN202080088509.X
申请日：2020-05-18
申请人： 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号： C12Q1/6851 , C12M1/38
摘要： 本发明提供了一种基于数字微流控平台富集核酸的方法及构建测序文库的方法。数字微流控平台包括微流控芯片和微流控装置，二者可拆卸地连接，基于该平台富集核酸的方法包括：在微流控芯片上制备微流滴，微流滴中含有表面活性剂、硅油和核酸；基于特异性探针对微流滴中所述核酸的目标区域进行特异性扩增，以便扩增产物，所述目标产物构成富集核酸。可以利用该富集产物进行文库的构建和测序。
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公开(公告)号：CN114829627A
公开(公告)日：2022-07-29
申请号：CN202080088509.X
申请日：2020-05-18
申请人： 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号： C12Q1/6851 , C12M1/38
摘要： 本发明提供了一种基于数字微流控平台富集核酸的方法及构建测序文库的方法。数字微流控平台包括微流控芯片和微流控装置，二者可拆卸地连接，基于该平台富集核酸的方法包括：在微流控芯片上制备微流滴，微流滴中含有表面活性剂、硅油和核酸；基于特异性探针对微流滴中所述核酸的目标区域进行特异性扩增，以便扩增产物，所述目标产物构成富集核酸。可以利用该富集产物进行文库的构建和测序。
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公开(公告)号：CN109207571B
公开(公告)日：2022-01-04
申请号：CN201710522336.8
申请日：2017-06-30
申请人： 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号： C12Q1/6869
摘要： 本发明公开了一种检测核酸内切酶酶切位点的方法。本发明利用芯片上数以十亿计的核酸序列来高通量系统性的检测核酸内切酶对DNA的识别切割位点及核心序列特征，采用两次测序分别获取碱基序列及正常的双链DNA，同时根据酶切前后荧光信号的改变，运用生物信息分析方法得到内切酶的识别切割位点。通过对内切酶识别切割位点的研究，可检测内切酶的识别切割位点的倾向性，并且可以提前预测内切酶的星号活性及基因组编辑技术中内切酶的脱靶效应，同时，也可用于大规模筛选新型基因组编辑系统中使用的内切酶所需要识别的PAM序列。与现有技术中的测序方法相比，本发明的检测方法具有速度快且通量高的优势。
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公开(公告)号：CN113039283A
公开(公告)日：2021-06-25
申请号：CN201880099543.X
申请日：2018-12-12
申请人： 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6813 , G01N33/487
摘要： 一种分离和/或富集宿主源核酸和病原核酸的方法和试剂及其制备方法。所述方法包括选自如下（a）或（b）的步骤：（a）将固定在固相载体上的宿主源探针与含有宿主源核酸和病原核酸的液体样品混合孵育，使宿主源探针与宿主源核酸杂交；进行固液分离得到结合在固相载体上的宿主源核酸和保留在液体样品中的病原核酸；（b）将宿主源探针、固定在固相载体上的病原探针与含有宿主源核酸和病原核酸的液体样品混合孵育，使宿主源探针与宿主源核酸杂交、病原探针与病原核酸杂交；进行固液分离得到结合在固相载体上的病原核酸和保留在液体样品中的宿主源核酸。该方法使用宿主源探针特异性捕获宿主源核酸，通过分离宿主源核酸来实现病原核酸的富集。
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公开(公告)号：CN111349690A
公开(公告)日：2020-06-30
申请号：CN201811584980.9
申请日：2018-12-24
申请人： 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号： C12Q1/6816
摘要： 本发明提出了检测蛋白质DNA结合位点的方法。包括：将DNA片段库进行测序；去除测序后的DNA片段库中的新生链；以DNA片段库的DNA片段为模板，将不带有荧光标记的dNTP依次聚合在测序接头的3’端，将带有荧光标记的dNTP聚合在聚合产物3’端的最后一位；记录聚合反应后的DNA片段库中的荧光点位置和所述荧光点的荧光强度；将目标蛋白与所述聚合反应后的DNA片段库进行杂交，所述目标蛋白具有荧光修饰；记录杂交后的DNA片段库中的荧光点位置和所述荧光点的荧光强度；基于杂交后的DNA片段库中的荧光点与聚合反应后的DNA片段库中荧光点的荧光强度或荧光种类的差异，确定目标蛋白质DNA结合位点。
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公开(公告)号：CN111041077A
公开(公告)日：2020-04-21
申请号：CN201811198184.1
申请日：2018-10-15
申请人： 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号： C12Q1/6869 , C12Q1/6837
摘要： 一种用于高通量测序中的样品加载方法、测序方法和测序系统，该样品加载方法包括：将需要加载的样品制备成雾滴，然后将雾滴喷洒在用于高通量测序的芯片表面使雾滴与芯片结合，获得加载有样品的芯片。该样品加载方法是一种非管道式流体加载方案，避免样品加载不均匀问题，提高数据产出量，对样品需求量少并且可避免外源杂质问题。
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公开(公告)号：CN118974800A
公开(公告)日：2024-11-15
申请号：CN202280094201.5
申请日：2022-09-28
申请人： 深圳华大生命科学研究院
摘要： 本公开提供了样品处理系统和方法。样品处理系统包括用于处理样品的样品处理仪器和成像系统，成像系统包括：支架，其能够相对于所述样品处理仪器固定地定位；和成像模组，其可移动地安装至所述支架，并被配置成实时地拍摄由所述样品处理仪器保持的样品或样品的被处理部分的图像。
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公开(公告)号：CN111349690B
公开(公告)日：2024-05-10
申请号：CN201811584980.9
申请日：2018-12-24
申请人： 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号： C12Q1/6816
摘要： 本发明提出了检测蛋白质DNA结合位点的方法。包括：将DNA片段库进行测序；去除测序后的DNA片段库中的新生链；以DNA片段库的DNA片段为模板，将不带有荧光标记的dNTP依次聚合在测序接头的3’端，将带有荧光标记的dNTP聚合在聚合产物3’端的最后一位；记录聚合反应后的DNA片段库中的荧光点位置和所述荧光点的荧光强度；将目标蛋白与所述聚合反应后的DNA片段库进行杂交，所述目标蛋白具有荧光修饰；记录杂交后的DNA片段库中的荧光点位置和所述荧光点的荧光强度；基于杂交后的DNA片段库中的荧光点与聚合反应后的DNA片段库中荧光点的荧光强度或荧光种类的差异，确定目标蛋白质DNA结合位点。
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