公开(公告)号：CN116601306A

公开(公告)日：2023-08-15

申请号：CN202180075073.5

申请日：2021-01-13

申请人： 深圳华大生命科学研究院 ,  深圳市华大农业应用研究院

发明人： 杨漫漫 ,  李勇 ,  魏强 ,  苗泽圃 ,  王然

IPC分类号： C12Q1/68

摘要： 提出了一种山羊角型相关的核酸分子，与山羊基因组1号染色体相比，所述核酸分子在g.129424780bp位点存在插入突变，插入突变的核酸片段为山羊基因组1号染色体g.150334286‑150818095bp区域至少一部分的反向片段。还提供了所述核酸分子，及其引物组、探针组和试剂盒在选育山羊无角品种中的应用。

公开(公告)号：CN112712852A

公开(公告)日：2021-04-27

申请号：CN202110037193.8

申请日：2021-01-12

申请人： 深圳市华大农业应用研究院

发明人： 苗泽圃 ,  李勇 ,  杨漫漫 ,  沈俊燃 ,  王然 ,  韩虎

IPC分类号： G16B25/00 ,  G16B40/30

摘要： 本申请涉及一种估计基因组育种值的方法、装置及系统，估计基因组育种值的方法包括：获取高密度的全基因组分子标记；对全基因组分子标记进行修剪，得到第一基因组分子标记；利用第一基因组分子标记构建亲缘关系矩阵；利用亲缘关系矩阵对全基因组分子标记进行全基因组关联分析，筛选出性状相关标记；针对中遗传力和低遗传力性状，将第一基因组分子标记和性状相关标记进行合并，并基于第一混合模型方程组得到育种值；针对高遗传力的性状，将第一基因组分子标记与性状相关标记作为具有不同遗传方差的两个组分，并基于第二混合模型方程组得到育种值。如此，提高了计算效率，减少了计算资源的消耗，提高了基因组选择准确性，能够加快动植物遗传改良。

公开(公告)号：CN112837750A

公开(公告)日：2021-05-25

申请号：CN202110169023.5

申请日：2021-02-07

申请人： 深圳市华大农业应用研究院

发明人： 苗泽圃 ,  陈涛 ,  杨漫漫 ,  李斌 ,  李勇 ,  魏强

IPC分类号： G16B25/00 ,  G16B40/00

摘要： 本发明公开了一种动植物育种值预测方法及装置，属于育种值预测领域，在获取到基因组后，对基因组进行单核苷酸多态性标记，然后获取每个染色体的标记，对每个染色体的标记构建中间矩阵，合并所有中间矩阵得到基因组的亲缘矩阵，然后由亲缘矩阵计算得到第一育种值，之后根据第一育种值为每个染色体的标记构建权重中间矩阵，由权重中间矩阵得到基因组的加权亲缘矩阵，最后根据加权亲缘矩阵计算得到最终的育种值。本申请方案提供的预测方法，在计算得到第一育种值之后，根据第一育种值对每个染色体的标记进行加权，无需假定所有标记都存在效应，有效利用高密度标记信息，提高了最终育种值的准确率，计算过程简单，降低了预测时间和计算成本。

公开(公告)号：CN104774860B

公开(公告)日：2018-07-17

申请号：CN201410017168.3

申请日：2014-01-14

申请人： 深圳华大生命科学研究院 ,  深圳华大三生园科技有限公司

发明人： 李勇 ,  田凯 ,  张欢欢 ,  刘楚新 ,  李飞达 ,  苗泽圃 ,  刘欢 ,  张耕耘

IPC分类号： C12N15/63 ,  C12N15/85 ,  C12N5/10

摘要： 提供了适于转化细胞的构建体、系统及其应用，其中一种适于转化细胞的构建体包含编码CaS9的核酸序列，且不包含筛选标记基因。将该适于转化细胞的构建体与本发明的包含附着子序列、tracrRNA序列和crRNA序列，其中tracrRNA序列与crRNA序列可操作地连接构成gRNAs表达框的另一种适于转化细胞的构建体配合使用，即利用这两种构建体共转染细胞，能够有效实现对哺乳动物细胞的多种基因的剪切修饰，并获得无标记细胞株，且切割效率高、安全高效、重复性好。

公开(公告)号：CN107365842B

公开(公告)日：2021-01-26

申请号：CN201710630909.9

申请日：2017-07-28

申请人： 深圳华大生命科学研究院 ,  深圳市农牧实业有限公司

发明人： 苗泽圃 ,  郑华 ,  杨漫漫 ,  陈茜 ,  李勇 ,  魏强 ,  蒙小云 ,  方铭 ,  陈涛

IPC分类号： C12Q1/6888 ,  C12N15/11 ,  G16B20/00

摘要： 本发明公开了一种预测待测猪的窝产总仔数遗传性能的SNP位点组合及方法。本发明所提供的SNP位点组合，由猪基因组中序列表中序列1自5’末端起第501位核苷酸、序列表中序列2自5’末端起第501位核苷酸、序列表中序列3自5’末端起第501位核苷酸、序列表中序列4自5’末端起第501位核苷酸和序列表中序列5自5’末端起第501位核苷酸组成。实验证明，采用本发明筛选的5个SNP位点预测可靠性值为0.112，相比BLUP方法提高了26.5％。因此，利用5个SNP位点来预测待测大白猪的窝产总仔数的遗传值，可以加快遗传进展，为育种者带来经济效益，具有重要的应用价值。

公开(公告)号：CN107287329B

公开(公告)日：2021-02-09

申请号：CN201710629681.1

申请日：2017-07-28

申请人： 深圳华大生命科学研究院 ,  深圳市农牧实业有限公司

发明人： 苗泽圃 ,  郑华 ,  魏强 ,  李勇 ,  杨漫漫 ,  陈茜 ,  蒙小云 ,  方铭 ,  陈涛

IPC分类号： C12Q1/6888 ,  G16B20/30 ,  G16B25/00

摘要： 本发明公开了一种预测待测猪的窝产活仔数遗传性能的SNP位点组合及方法。本发明所提供的SNP位点组合，由猪基因组中序列表中序列1自5’末端起第501位核苷酸、序列表中序列2自5’末端起第501位核苷酸、序列表中序列3自5’末端起第501位核苷酸、序列表中序列4自5’末端起第501位核苷酸和序列表中序列5自5’末端起第501位核苷酸组成。实验证明，采用本发明筛选的5个SNP位点预测可靠性值为0.081，相比BLUP方法提高了13.8％。因此，利用5个SNP位点来预测待测大白猪的窝产活仔数遗传值，可以加快遗传进展，为育种者带来经济效益，具有重要的应用价值。