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公开(公告)号：CN117144002A
公开(公告)日：2023-12-01
申请号：CN202310890251.0
申请日：2023-07-19
申请人： 苏州吉因加生物医学工程有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司 , 深圳吉因加医学检验实验室
IPC分类号： C12Q1/6886 , G16B20/50 , G16B25/20
摘要： 本发明的目的在于提供一种用于MRD检测的个性化探针组的设计方法及其应用。应用本发明的设计方法获得的个性化探针组在MRD检测中根据受试者的肿瘤组织样本中检出的突变进行定制，能够全面反应每位受试者个体的突变图谱，具有更高的检测灵敏度；除此之外，本发明的个性化探针组的设计方法所定制的个性化探针组的定制成功率为100％，探针捕获效率和均一性优异。
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公开(公告)号：CN116497088A
公开(公告)日：2023-07-28
申请号：CN202310465445.6
申请日：2023-04-26
申请人： 苏州吉因加生物医学工程有限公司 , 深圳吉因加医学检验实验室 , 长沙吉因加生物科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12N15/11 , C12P19/34 , C40B50/06 , C40B40/06 , C12Q1/6869
摘要： 一种夹板核酸分子及其试剂盒，夹板核酸分子的长度≥27nt。所述夹板核酸分子包括5’端片段以及3’端片段，所述5’端片段用于与变性后的单链文库5’末端序列形成第一互补区，所述3’端片段用于与变性后的单链文库3’末端序列形成第二互补区，且第一互补区的长度与第二互补区长度相同。本发明可以显著提高环化效率，并提高数据产出量。
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公开(公告)号：CN111321140B
公开(公告)日：2021-08-06
申请号：CN202010140009.8
申请日：2020-03-03
申请人： 苏州吉因加生物医学工程有限公司 , 深圳吉因加医学检验实验室
IPC分类号： C12N15/11 , C12Q1/6858 , G16B20/20 , G16B20/50 , G16B30/10
摘要： 本发明涉及生物医学领域的一种基于单样本的肿瘤突变负荷检测方法和装置。本发明提供的探针组合物，包括捕获表1所示基因的外显子区域，表2所示基因的内含子、启动子、融合断点区域的探针以及表3所示基因的编码区区域的探针。人肿瘤多基因检测试剂盒包括所述探针组合物。基于单样本的TMB检测方法包括：获取待测肿瘤样本的目标区域测序数据，与参考基因组比对，基于所得比对结果，进行变异位点检测，过滤所得原始变异结果与正常样本正常基线数据库重合的位点，过滤所得第一体细胞突变数据集的高频率生殖突变位点，筛选出所得第二体细胞突变数据集中克隆类型体细胞突变位点；计算TMB。该方法无需配对样本，能准确检测肿瘤样本TMB。
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公开(公告)号：CN111321140A
公开(公告)日：2020-06-23
申请号：CN202010140009.8
申请日：2020-03-03
申请人： 苏州吉因加生物医学工程有限公司 , 深圳吉因加医学检验实验室
IPC分类号： C12N15/11 , C12Q1/6858 , G16B20/20 , G16B20/50 , G16B30/10
摘要： 本发明涉及生物医学领域的一种基于单样本的肿瘤突变负荷检测方法和装置。本发明提供的探针组合物，包括捕获表1所示基因的外显子区域，表2所示基因的内含子、启动子、融合断点区域的探针以及表3所示基因的编码区区域的探针。人肿瘤多基因检测试剂盒包括所述探针组合物。基于单样本的TMB检测方法包括：获取待测肿瘤样本的目标区域测序数据，与参考基因组比对，基于所得比对结果，进行变异位点检测，过滤所得原始变异结果与正常样本正常基线数据库重合的位点，过滤所得第一体细胞突变数据集的高频率生殖突变位点，筛选出所得第二体细胞突变数据集中克隆类型体细胞突变位点；计算TMB。该方法无需配对样本，能准确检测肿瘤样本TMB。
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公开(公告)号：CN117144002B
公开(公告)日：2024-06-25
申请号：CN202310890251.0
申请日：2023-07-19
申请人： 苏州吉因加生物医学工程有限公司 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司 , 深圳吉因加医学检验实验室
IPC分类号： C12Q1/6886 , G16B20/50 , G16B25/20
摘要： 本发明的目的在于提供一种用于MRD检测的个性化探针组的设计方法及其应用。应用本发明的设计方法获得的个性化探针组在MRD检测中根据受试者的肿瘤组织样本中检出的突变进行定制，能够全面反应每位受试者个体的突变图谱，具有更高的检测灵敏度；除此之外，本发明的个性化探针组的设计方法所定制的个性化探针组的定制成功率为100％，探针捕获效率和均一性优异。
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公开(公告)号：CN117925782A
公开(公告)日：2024-04-26
申请号：CN202410064779.7
申请日：2024-01-16
申请人： 深圳吉因加医学检验实验室
IPC分类号： C12Q1/6813
摘要： 本公开涉及一种用于核酸杂交的组合物，属于分子生物学领域，所述组合物包含三价阳离子盐，应用本公开所述杂交捕获体系，能够加快杂交反应进程，缩短杂交时间，并获得良好的杂交捕获效果。
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公开(公告)号：CN117737272A
公开(公告)日：2024-03-22
申请号：CN202311866082.3
申请日：2023-12-29
申请人： 深圳吉因加医学检验实验室 , 长沙吉因加生物科技有限公司
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6874 , C12N15/11 , C12R1/32
摘要： 本发明的一种用于筛选目标微生物的标记物的方法，筛选得到的标记物及其检测探针组能够快速、准确、高灵敏度、高特异性地靶向检测目标微生物。相比于现有技术，该发明方法对病原检测目标性更强，受人源核酸影响更小，可以有效降低宿主背景噪音，对于低载量核酸检测具有更优的信噪比，有利于提高检测阳性率。而且有效降低了测序所需数据量，大大降低了测序成本。
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公开(公告)号：CN115346608B
公开(公告)日：2023-05-09
申请号：CN202210743555.X
申请日：2022-06-27
申请人： 北京吉因加科技有限公司 , 深圳吉因加医学检验实验室
摘要： 一种构建病原生物基因组数据库的方法及装置，该方法包括：获取基因组数据步骤，包括从数据库获取选定的病原生物的基因组数据；同源区域屏蔽步骤，包括对基因组数据进行质粒同源区域屏蔽、宿主源同源区域屏蔽，获得屏蔽同源区域后的基因组数据；融合基因组构建步骤，包括对屏蔽同源区域序列后的基因组数据中的各个基因组构建融合基因组；组库步骤，包括重复所述获取基因组数据步骤、同源区域屏蔽步骤、融合基因组构建步骤，遍历所选定的所有病原生物的基因组数据，汇总所有融合基因组，得到病原生物基因组数据库。该方法构建的数据库具有准确度高，分析时间短的优点。
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公开(公告)号：CN115572756A
公开(公告)日：2023-01-06
申请号：CN202211214953.9
申请日：2022-09-30
申请人： 深圳吉因加医学检验实验室 , 北京吉因加医学检验实验室有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C40B50/06 , C40B40/06
摘要： 一种同时检测甲基化、超低频突变和片段信息的文库构建方法，该方法包括：氧化步骤，对核酸样本中5‑甲基胞嘧啶残基进行一次氧化，得到含有氧化的5‑甲基胞嘧啶残基的核酸分子；还原步骤，对氧化后的核酸不进行纯化，直接向氧化反应结束后的体系中加入还原试剂，反应得到还原产物；纯化步骤，包括使用纯化试剂纯化还原产物，得到纯化后的核酸分子，纯化试剂中含有载体试剂，载体试剂中的载体用于吸附核酸分子；杂交步骤，包括使纯化后的核酸分子与探针杂交反应，获得杂交产物。本发明的检测方法能够检测到超低频突变。
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公开(公告)号：CN113881739B
公开(公告)日：2022-09-13
申请号：CN202111143042.7
申请日：2021-09-28
申请人： 深圳吉因加医学检验实验室
IPC分类号： C12P19/34 , C12N15/10 , C12Q1/6806 , C40B50/06
摘要： 一种氧化含锯齿末端核酸分子的方法及还原方法与文库构建法，氧化含锯齿末端核酸分子的方法包括：提供待测样本，所述待测样本中的至少部分核酸分子具有锯齿末端，使所述待测样本中核酸分子的5‑甲基胞嘧啶残基(5mC)、5‑羟甲基胞嘧啶残基(5hmC)中的至少一种氧化，获得氧化产物。通过对未进行末端修复的待测样本中的核酸分子锯齿末端进行氧化，得到可用于还原的核酸分子，使得待测样本中核酸分子锯齿末端的甲基化水平真实还原，从而提高甲基化检测的准确性。
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