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公开(公告)号：CN117056774A
公开(公告)日：2023-11-14
申请号：CN202310996650.5
申请日：2017-11-07
申请人： 贝克顿迪金森公司
发明人： 胡静 , 克里斯蒂娜·范 , 大卫·罗森菲尔德 , 范珏 , 伊丽莎白·玛丽·瓦尔扎克
IPC分类号： G06F18/24 , G16B30/10 , G06F18/23 , C12Q1/6869
摘要： 本申请涉及用于细胞标记分类的方法。本文中公开了用于对细胞标记进行分类例如对信号细胞标记进行鉴定的方法和系统。在一些实施例中，该方法包括：获得使用细胞中的利用条形码被条形码化的靶创建的经条形码化的靶的测序数据，其中条形码包含细胞标记和分子标记。在对这些细胞标记分等级后，可以确定累积和图的二阶导数图的最小值。使用这些方法，基于与细胞标记相关联的具有不同序列的分子标记的数目和细胞标记阈值，可以将该细胞标记分类为信号细胞标记或噪声细胞标记。
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公开(公告)号：CN109906274B
公开(公告)日：2023-08-25
申请号：CN201780068299.6
申请日：2017-11-07
申请人： 贝克顿迪金森公司
发明人： 胡静 , 克里斯蒂娜·范 , 大卫·罗森菲尔德 , 范珏 , 伊丽莎白·玛丽·瓦尔扎克
IPC分类号： C12Q1/6869
摘要： 本文中公开了用于对细胞标记进行分类例如对信号细胞标记进行鉴定的方法和系统。在一些实施例中，该方法包括：获得使用细胞中的利用条形码被条形码化的靶创建的经条形码化的靶的测序数据，其中条形码包含细胞标记和分子标记。在对这些细胞标记分等级后，可以确定累积和图的二阶导数图的最小值。使用这些方法，基于与细胞标记相关联的具有不同序列的分子标记的数目和细胞标记阈值，可以将该细胞标记分类为信号细胞标记或噪声细胞标记。
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公开(公告)号：CN109074430B
公开(公告)日：2022-03-29
申请号：CN201780028283.2
申请日：2017-05-25
申请人： 贝克顿迪金森公司
摘要： 本文披露的是用于确定靶的数量的方法和系统。在一些实施例中，该方法包括：使用随机条形码对靶进行随机地条形码化；获得测序数据；对于这些靶中的一个或多个：对具有与该测序数据中的靶相关的不同序列的分子标记的数量进行计数；使用定向邻接鉴定靶的分子标记的簇；使用鉴定的靶的分子标记的簇对测序数据进行折叠；并估计靶的数量。
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公开(公告)号：CN111247589A
公开(公告)日：2020-06-05
申请号：CN201880068906.3
申请日：2018-09-24
申请人： 贝克顿迪金森公司
IPC分类号： G16B20/00 , G16B30/00 , G16B50/00 , G06F17/18 , C12Q1/6876 , C12Q1/6869
摘要： 本文披露的是用于确定靶的出现的方法和系统。在一些实施例中，所述方法包括：对所述靶的推定序列进行折叠；对与所述靶的推定序列相关联的分子标记序列进行折叠；以及估计所述靶的出现，其中在对所述靶的推定序列的出现进行折叠并且对噪音分子标记序列的出现进行折叠之后，估计的所述靶的出现与跟所述测序数据中的所述靶的推定序列相关联的分子标记序列的出现相关。
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公开(公告)号：CN117594126A
公开(公告)日：2024-02-23
申请号：CN202311546539.2
申请日：2017-11-07
申请人： 贝克顿迪金森公司
IPC分类号： G16B40/00 , G16B99/00 , G16B25/00 , G06F18/231
摘要： 本申请涉及用于表达谱分类的方法。本文中公开了鉴定用于区分细胞类型的靶的方法和系统。在一些实施例中，该方法包括：将细胞的表达谱层次聚类以产生树状图，其中每个叶代表不同个体细胞的表达谱。可以通过消除无效分裂(及其子)来修剪该树状图。可以将该树状图中的剩余叶独立于其在该树状图中的位置基于其彼此的距离进行合并以产生表达谱聚类。该方法可以基于在聚类中差异表达的靶来鉴定用于区分细胞类型的靶。
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公开(公告)号：CN109952612B
公开(公告)日：2023-12-01
申请号：CN201780068294.3
申请日：2017-11-07
申请人： 贝克顿迪金森公司
摘要： 本文中公开了鉴定用于区分细胞类型的靶的方法和系统。在一些实施例中，该方法包括：将细胞的表达谱层次聚类以产生树状图，其中每个叶代表不同个体细胞的表达谱。可以通过消除无效分裂(及其子)来修剪该树状图。可以将该树状图中的剩余叶独立于其在该树状图中的位置基于其彼此的距离进行合并以产生表达谱聚类。该方法可以基于在聚类中差异表达的靶来鉴定用于区分细胞类型的靶。
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