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公开(公告)号:CN115852022B
公开(公告)日:2024-08-13
申请号:CN202211156238.4
申请日:2021-09-16
申请人: 贵州省烟草科学研究院
IPC分类号: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , G16B30/20 , G16B30/10 , G16B20/20 , G06Q30/018 , G06K19/06 , G06K17/00
摘要: 本发明公开了基于全基因组重测序和KASP技术开发的烟草核心SNP标记及其应用。本发明基于150份烟草全基因组重测序数据,利用前期探索的数据分析方法,挖掘获得了超过百万个SNP位点,对这些位点进一步分析,利用KASP技术平台,鉴定筛选出240个SNP标记及配套KASP引物,覆盖了烟草24条染色体/连锁群,并进一步从中确定了48个核心SNP。本发明为烟草生物学研究提供了一套可信、便于后期利用的SNP标记,这套SNP标记和检测引物,可用于烟草SNP检测试剂盒开发、烟草品种DNA指纹图谱构建、烟草种质资源和遗传群体基因分型,烟草定向改良品种背景回复率检测、烟草品种纯度/真伪度检测、烟草分子标记辅助选择育种等。
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公开(公告)号:CN116622881A
公开(公告)日:2023-08-22
申请号:CN202310473323.1
申请日:2023-04-27
申请人: 贵州省烟草科学研究院
IPC分类号: C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要: 本发明涉及一种烟草全基因组SNP位点组合、探针、芯片及其应用,所述应用包括基因分型、全基因组关联分析、全基因组连锁分析、分子标记辅助选择育种、分子指纹图谱构建、遗传资源基因型鉴定中的任一项;所述烟草全基因组SNP位点组合包括18981个SNP位点,所述18981个SNP位点的物理位置是基于烟草品种K326基因组序列比对确定的;所述18981个SNP位点的物理位置信息见表1。本发明能够进行烟草种质资源或育种群体材料规模化、高通量、低成本的基因分型检测工作,满足烟草种质资源鉴定及进一步育种利用的需求,加快烟草种质资源利用和分子育种的选择效率。
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公开(公告)号:CN110387383B
公开(公告)日:2022-12-06
申请号:CN201910695031.6
申请日:2019-07-30
申请人: 贵州省烟草科学研究院
摘要: 本发明属于植物基因工程技术领域,尤其涉及一种调控NtCBT基因在烟草组织中表达的方法及其应用。本发明从栽培烟草K326基因组DNA中克隆获得NtCBT基因启动子,并在栽培烟草中验证NtCBT基因启动子三种类型的片段缺失后驱动GUS基因的表达模式;根据启动子顺式作用元件分析以及片段缺失实验,聚焦启动子中控制腺毛特异表达的核心区域。本发明研究发现启动子‑198bp~‑192bp片段(CAGTTA)的缺失能够使NtCBT基因由腺毛特异表达变为组成性表达,为解析烟草类西柏烷代谢途径的分子调控机制、腺毛特异启动子精准调控关键酶基因的表达提供新策略,为培育高类西柏烷烟草种质奠定研究基础。
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公开(公告)号:CN115261446A
公开(公告)日:2022-11-01
申请号:CN202210980928.5
申请日:2022-08-16
申请人: 贵州省烟草科学研究院
IPC分类号: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/6895
摘要: 本申请公开了抽核缓冲液、缓冲液组合、制备方法和应用,用于抽提烟草幼嫩组织单细胞核测序样本,以便对其进行snRNA‑seq测序。该抽核缓冲液包含:0.5~1.5M DTT,0.3~0.75%Triton×‑100,0.5~1.5tablet/50mL蛋白酶抑制剂,0.3~0.6U/μL RNA酶抑制剂,0.05~0.15mM精胺和0.3~0.7mM亚精胺的PBS溶液,pH值为6.5~7.5。通过本申请的抽核缓冲液、缓冲液组合及采用该缓冲液组合制备而成的烟草单细胞核样品具有背景纯度高、结团率低,保持细胞核形态完整和细胞核RNA质量满足snRNA‑seq测序的优点。
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公开(公告)号:CN107338323B
公开(公告)日:2020-09-29
申请号:CN201710802860.0
申请日:2017-09-08
申请人: 贵州省烟草科学研究院
IPC分类号: C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种与烤烟品种TT7白粉病抗性紧密连锁的分子标记及其在辅助选择育种中的用途,属于农业生物技术范畴。以抗白粉病烟草TT7和感病烟草K326杂交构建F1、F2及BC群体,利用连锁定位在定位区段内开发分子标记S1、R1和S2、R2,与白粉病抗病表型共分离。使用这4对标记对后代进行PCR扩增,不同引物能扩增出相应大小的特异片段并可有效区分杂合基因型,属共显性分子标记,可追踪烟草TT7中的抗白粉病基因在后代中的遗传情况,明确后代的基因型,并可用于白粉病抗病后代筛选。
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公开(公告)号:CN110129479A
公开(公告)日:2019-08-16
申请号:CN201910455579.3
申请日:2019-05-29
申请人: 贵州省烟草科学研究院
IPC分类号: C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要: 本发明公开了一种检测烟草eIF4E-1基因单碱基插入突变的Bi-PASA标记引物及方法,所述引物序列如下:外引物P的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,外引物Q的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,内引物A的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,内引物B的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示,上述引物序列中带下划线的碱基为引入的错配碱基,小写字母碱基为非互补富含G+C序列。采用本发明的四个引物,结合一次PCR和电泳,便可以准确地检测出eIF4E-1单碱基插入突变等位基因回交转育过程中回交和自交后代的基因型,提高分子标记辅助轮回选择效率,加快育种进程。
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公开(公告)号:CN109369788A
公开(公告)日:2019-02-22
申请号:CN201811339679.1
申请日:2018-11-12
申请人: 贵州省烟草科学研究院
摘要: 本发明涉及基因工程领域,具体公开了一种来自烟草的钾转运蛋白TPK1-1及其编码基因与应用。本发明首次提供了分离自烟草的TPK1-1基因,所述TPK1-1基因全长1287bp,经功能验证,本发明提供的TPK1-1基因转入钾吸收缺陷型酵母突变株R5421后,表达所述TPK1-1基因的重组酵母重新具有了钾离子吸收和转运的功能。因此,本发明提供的TPK1-1基因具有促进钾离子吸收和转运的功能。
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公开(公告)号:CN109369787A
公开(公告)日:2019-02-22
申请号:CN201811339624.0
申请日:2018-11-12
申请人: 贵州省烟草科学研究院
摘要: 本发明涉及基因工程领域,具体公开了一种来自烟草的钾转运蛋白KUP11及其编码基因与应用。本发明首次提供了分离自烟草的KUP11基因,所述KUP11基因全长2391bp,经功能验证,本发明提供的KUP11基因转入钾吸收缺陷型酵母突变株R5421后,表达所述KUP11基因的重组酵母重新具有了钾离子吸收和转运的功能。因此,本发明提供的KUP11基因具有促进钾离子吸收和转运的功能。
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公开(公告)号:CN109354612A
公开(公告)日:2019-02-19
申请号:CN201811339759.7
申请日:2018-11-12
申请人: 贵州省烟草科学研究院
IPC分类号: C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/82
摘要: 本发明涉及烟草AKT2/3基因及应用。所述烟草AKT2/3基因及其编码蛋白质的序列分别如SEQ ID NO:1和2所示。本发明首次从烟草中克隆得到AKT2/3基因并通过酵母功能互补实验验证了该基因的生物学功能,烟草AKT2/3基因具有促进钾离子吸收和转运的功能。
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公开(公告)号:CN105586346A
公开(公告)日:2016-05-18
申请号:CN201510858859.0
申请日:2015-12-01
申请人: 贵州省烟草科学研究院
IPC分类号: C12N15/29 , C07K14/415
CPC分类号: C12N15/8283 , A01H5/00 , C07K14/415 , C12N15/8205
摘要: 本发明公开了一种烟草基因NtTCTP,其特征在于:具有SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列;其编码的蛋白质,具有SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列,该基因用于调节烟草对PVY的抗性。
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