公开(公告)号：CN106960118B

公开(公告)日：2021-03-19

申请号：CN201710105754.7

申请日：2017-02-23

申请人： 邹长林

发明人： 邹长林 ,  许芳 ,  孙宪强 ,  章慧 ,  陈文豪 ,  陈星星 ,  李慧芳

IPC分类号： G16C20/40 ,  G16C20/50

摘要： 本发明涉及一种α1‑AR亚型蛋白的三维晶体结构模型及其建立方法，建立方法包括步骤：以α1‑AR亚型蛋白的氨基酸序列为探针，搜索蛋白晶体数据库，通过氨基酸序列比对得到相似度最高的同源模板β2‑AR；使用的Prime模块对α1‑AR亚型蛋白同源模建；采用Macromodel模块对同源模建得到的蛋白优化，通过模型评价得到α1‑AR亚型蛋白的三维晶体结构模型。本发明提供了α1‑AR三个亚型蛋白α1A‑AR、α1B‑AR和α1D‑AR的模型构象，为准确研究靶点和拮抗剂的构效关系提供了基础；并模建了可能的结合口袋，找到关键残基，为解释α1‑AR亚型选择性拮抗剂的选择度提供理论依据。

公开(公告)号：CN106960118A

公开(公告)日：2017-07-18

申请号：CN201710105754.7

申请日：2017-02-23

申请人： 邹长林

发明人： 邹长林 ,  许芳 ,  孙宪强 ,  章慧 ,  陈文豪 ,  陈星星 ,  李慧芳

IPC分类号： G06F19/00

CPC分类号： G06F19/705 ,  G06F19/706

摘要： 本发明涉及一种α1‑AR亚型蛋白的三维晶体结构模型及其建立方法，建立方法包括步骤：以α1‑AR亚型蛋白的氨基酸序列为探针，搜索蛋白晶体数据库，通过氨基酸序列比对得到相似度最高的同源模板β2‑AR；使用的Prime模块对α1‑AR亚型蛋白同源模建；采用Macromodel模块对同源模建得到的蛋白优化，通过模型评价得到α1‑AR亚型蛋白的三维晶体结构模型。本发明提供了α1‑AR三个亚型蛋白α1A‑AR、α1B‑AR和α1D‑AR的模型构象，为准确研究靶点和拮抗剂的构效关系提供了基础；并模建了可能的结合口袋，找到关键残基，为解释α1‑AR亚型选择性拮抗剂的选择度提供理论依据。