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公开(公告)号：CN105980861B
公开(公告)日：2018-08-24
申请号：CN201480067418.2
申请日：2014-12-09
申请人： 加利福尼亚大学董事会
CPC分类号： G01N33/487 , G01N30/7233 , G01N33/88 , G01N33/92 , G01N2800/085 , G06F19/18 , Y02A90/24 , Y02A90/26
摘要： 本发明涉及基本上非侵入性的肝病诊断，特别是能够在早期阶段干预该疾病进展的基本上非侵入性的肝病诊断。本发明还涉及使用血浆生物标记物来将非酒精性脂肪性肝炎(NASH)区分于非酒精性脂肪肝(NAFL)和非‑非酒精性脂肪肝病(NAFLD)以及正常对照。具体而言，本发明涉及使用血浆中游离类二十烷酸和其他多不饱和脂肪酸(PUFA)代谢物水平来将NASH区分于NAFL和非‑NAFLD的正常对照。
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公开(公告)号：CN105324670B
公开(公告)日：2018-08-03
申请号：CN201380076425.4
申请日：2013-05-09
申请人： 宝洁公司
摘要： 本发明提供了评估受检哺乳动物是否具有目标病症的方法,该方法包括使用于评估所述受检哺乳动物是否具有所述目标病症的第组生物标记的丰度和第二组生物标记的丰度的函数公式化。还提供了用于评估受检哺乳动物是否具有目标病症的计算机辅助系统以及用于评估受检哺乳动物是否具有目标病症的计算机可读介质。
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公开(公告)号：CN108351915A
公开(公告)日：2018-07-31
申请号：CN201680062241.6
申请日：2016-08-26
申请人： 纽约市哥伦比亚大学信托人
发明人： 马里亚诺·贾维尔·阿尔瓦雷茨 , 安德里亚·卡利法诺
摘要： 本文公开了用于测定基因表达标记中的调节子富集的方法。实例性方法可包括获得调节子的一组转录靶标。所述方法可包括通过将测试样品的基因表达谱与代表对照表型的多个样品的基因表达谱进行比较来获得基因表达标记。所述方法可包括计算所述基因表达标记中每一调节子的调节子富集得分。所述方法可包括确定所述对照表型中的对照样品的数目是否高于预定阈值以支持使用重排测定来评估统计显著性。所述方法可包括，响应于确定所述对照样品的数目高于所述预定阈值，通过将每一调节子富集得分与空模型进行比较来计算显著性值。
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公开(公告)号：CN103853916B
公开(公告)日：2018-07-27
申请号：CN201410051950.7
申请日：2008-07-23
申请人： 香港中文大学
CPC分类号： C12Q1/6883 , C12Q1/6827 , C12Q1/6888 , C12Q2600/112 , C12Q2600/154 , C12Q2600/156 , G01N2800/387 , G06F19/18 , G06F19/22 , C12Q2521/331 , C12Q2537/16
摘要： 本发明提供了利用部分胎儿浓度确定核酸序列失衡的方法、系统和装置。选取了用于确定,例如,两个序列(或两组序列)的比率的失衡的个或多个截止值。可以至少部分地基于含有母体核酸序列背景的诸如母体血浆的样品中胎儿DNA的百分比来确定所述截止值。还可以基于每反应的序列的平均浓度来确定该截止值。在方面,从估计含有特定核酸序列的信息孔的比例来确定该截止值,其中该比例基于上文所述的百分比和/或平均浓度来确定。可以利用诸如序贯概率比检验(SPRT)的许多不同类型的方法来确定该截止值。
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公开(公告)号：CN108319814A
公开(公告)日：2018-07-24
申请号：CN201810082985.5
申请日：2018-01-29
申请人： 中国科学院生物物理研究所
IPC分类号： G06F19/18
CPC分类号： G06F19/18
摘要： 本发明公开了基于染色体空间相互作用预测长非编码RNA生物学功能的方法。本发明的方法包括如下步骤：1)选择候选长非编码RNA；2)确定长非编码RNA在全基因组范围内的结合位点；3)确定组织细胞中染色体精细的空间相互作用数据；4)预测长非编码RNA的靶基因；5)GO功能富集分析，预测长非编码RNA的生物学功能。本发明的方法能够结合最新的染色体空间相互作用数据，提高长非编码RNA生物学功能预测的准确性。
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公开(公告)号：CN108271395A
公开(公告)日：2018-07-10
申请号：CN201680038758.1
申请日：2016-07-21
申请人： 阿瑞斯遗传股份有限公司
发明人： 安德烈亚斯·凯勒 , 苏珊娜·施默尔克 , 科德·弗里德里希·施塔勒 , 克里斯蒂娜·巴克斯 , 瓦伦蒂娜·加拉塔
IPC分类号： C12Q1/689
CPC分类号： C12Q1/689 , C12Q2600/112 , C12Q2600/156 , G06F19/18 , G06F19/22
摘要： 本申请涉及确定患者感染对抗微生物药物治疗可能具有抗性的摩根氏菌属物种的方法，选择对感染了具有抗生素抗性的摩根氏菌属的患者的治疗的方法，和确定摩根氏菌属物种细菌微生物的抗生素抗性谱的方法，以及用于这些方法的计算机程序产品。在示例性的方法中，样品1用于分子测试2，然后进行采集分子指纹3。随后将结果与参考文库4进行比较，并报告结果5。
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公开(公告)号：CN108271392A
公开(公告)日：2018-07-10
申请号：CN201680044780.7
申请日：2016-08-05
申请人： 阿瑞斯遗传股份有限公司
发明人： 安德烈亚斯·凯勒 , 苏珊娜·施默尔克 , 科德·弗里德里希·施塔勒 , 克里斯蒂娜·巴克斯 , 瓦伦蒂娜·加拉塔
IPC分类号： C12Q1/6858 , G06F17/00 , G06F19/00
CPC分类号： G06F19/24 , C12Q1/689 , C12Q2600/106 , C12Q2600/156 , G06F19/18 , Y02A90/26
摘要： 本发明涉及确定患者感染对抗微生物药物治疗可能具有抗性的至少一种微生物尤其是细菌微生物的方法，选择对感染了至少一种微生物尤其是细菌微生物的患者的治疗的方法，以及确定包含至少一种基因的微生物尤其是细菌微生物的基因组结构变化的方法，以及用于这些方法的计算机程序产品。
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公开(公告)号：CN105102637B
公开(公告)日：2018-05-22
申请号：CN201480019133.1
申请日：2014-04-16
申请人： LG电子株式会社 , 延世大学校产学协力团
IPC分类号： C12Q1/6886 , G01N33/574 , G06F19/10
CPC分类号： G06F19/24 , C12Q1/6886 , C12Q2600/158 , C12Q2600/178 , C40B30/02 , G01N33/57438 , G06F19/18
摘要： 本发明公开了提取胰腺癌诊断用生物标志物的方法、用于所述方法的计算装置、胰腺癌诊断用生物标志物以及包含该生物标志物的胰腺癌诊断用装置。更具体地，本发明公开了利用在胰腺癌患者中特异性表达的基因或者获自血液或组织的与所述基因配对的微RNA来提取胰腺癌诊断用生物标志物的方法、用于所述方法的计算装置、胰腺癌诊断用生物标志物以及包含该生物标志物的胰腺癌诊断用装置。
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公开(公告)号：CN107977550A
公开(公告)日：2018-05-01
申请号：CN201711472339.1
申请日：2017-12-29
申请人： 天津科技大学
IPC分类号： G06F19/18
CPC分类号： G06F19/18
摘要： 本发明涉及一种基于压缩的快速分析致病基因算法，其主要技术特点是：将SNP基因型数据进行二进制的转换；将转换后的二进制序列进行压缩处理；确定样本个体之间相似度的评价标准；通过样本个体之间相似度的评价标准，得到样本个体之间的位点评分结果，确定一定阈值以得到候选IBD片段；选取病例组和对照组样本个体进行病例对照分析，比较病例组/病例组个体与对照组/对照组个体评价值之间的差异；鉴定SNP与疾病之间的关联。本发明设计合理，较大程度上缩短了实验分析的运行时间，提高了效率，而且可以较准确定位到致病基因上，可广泛用于一些常见疾病与基因之间关联分析的相关研究。
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公开(公告)号：CN105144190B
公开(公告)日：2018-05-01
申请号：CN201480018421.5
申请日：2014-01-29
申请人： 科德克希思公司
发明人： 格雷戈里·艾伦·科普
IPC分类号： G06G7/58
CPC分类号： C40B50/02 , C12N15/1058 , G06F19/12 , G06F19/16 , G06F19/18 , G06F19/701
摘要： 本发明提供了用于快速并有效搜索生物学上相关的数据空间的方法。更特别地，本发明提供了用于从复杂的生物分子文库或多组此类文库的中鉴定具有期望的特性的生物分子或最适于获得此类特性的生物分子的方法。本发明还提供了用于对序列‑活性关系建模的方法，包括但不限于递加或递减技术(stepwise addition or substraction techniques)、贝叶斯回归、集成回归(ensemble regression)和其他方法。本发明还提供了用于执行本文提供的方法的数字化系统和软件。
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