Kontrollgene zur Normalisierung von Genexpressionsanalysedaten

    公开(公告)号:EP2392668A2

    公开(公告)日:2011-12-07

    申请号:EP10196834.5

    申请日:2008-02-28

    申请人: SIRS-Lab GmbH

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: Die vorliegende Erfindung betrifft ein Verfahren zur Normalisierung einer mRNA Menge in mehreren Proben umfassend a) einen Vergleich der Expressionswerte einer oder mehrerer Nukleinsäuren ausgewählt aus SEQ ID 22 bis SEQ-ID 97 über verschiedene Proben; b) Ableitung eines Wertes zur Normalisierung von Expressionswerten einer oder mehrerer Nukleinsäuren, ausgewählt aus SEQ ID 22 bis SEQ-ID 97 über mehrere Proben; und c) eine Normalisierung der Expression anderer Nukleinsäuren, welche aus mehreren Proben isoliert wurden, basierend auf Schritt b). Die Erfindung betrifft ferner einen Kit dadurch gekennzeichnet, mit einer Auswahl von Sequenzen gemäß SEQ-ID 22 bis SEQ-ID 97 zur Bestimmung von Genexpressionsprofilen in vitro in einer Patientenprobe, für eine Verwendung als Kontrollgene sowie die Verwendung von Nucleinsäuren, ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus: SEQ-ID 22 bis SEQ-ID 97 als Kontrollgene zur Normalisierung von Genexpressionsanalysedaten.

    摘要翻译: 用于从血液样品归一化基因表达数据的一组对照基因包括对应于GenBank登录号NM001562,NM001228,NM001993,NM002209,NM000587,BC002715和NM003082的七个RNA序列。 还包括独立权利要求:(1)来自上述对照基因的引物组,包含14个DNA序列,其包含用于ITGAL,SNAPC1,CASP8,C7,PPARD,IL18和F3基因的正向引物和反向引物; (2)来自上述对照基因的探针组,其包含对应于ITGAL,SNAPC1,CASP8,C7,PPARD,IL18和F3基因的7个DNA序列; (3)通过在对照核酸(如上所述的基因,引物或探针)的存在下对体外对血液样品进行基因表达测定法来检测表达几个基因的基因表达程度的信号和对照的基因表达数据的归一化 核酸,并对信号数据进行数学变换以最小化信号数据的可变性。

    Kontrollgene zur Normalisierung von Genexpressionsanalysedaten
    2.
    发明公开
    Kontrollgene zur Normalisierung von Genexpressionsanalysedaten 有权
    用于基因表达分析数据的归一化对照基因

    公开(公告)号:EP2392668A3

    公开(公告)日:2012-05-30

    申请号:EP10196834.5

    申请日:2008-02-28

    申请人: SIRS-Lab GmbH

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: Die vorliegende Erfindung betrifft ein Verfahren zur Normalisierung einer mRNA Menge in mehreren Proben umfassend a) einen Vergleich der Expressionswerte einer oder mehrerer Nukleinsäuren ausgewählt aus SEQ ID 22 bis SEQ-ID 97 über verschiedene Proben; b) Ableitung eines Wertes zur Normalisierung von Expressionswerten einer oder mehrerer Nukleinsäuren, ausgewählt aus SEQ ID 22 bis SEQ-ID 97 über mehrere Proben; und c) eine Normalisierung der Expression anderer Nukleinsäuren, welche aus mehreren Proben isoliert wurden, basierend auf Schritt b). Die Erfindung betrifft ferner einen Kit dadurch gekennzeichnet, mit einer Auswahl von Sequenzen gemäß SEQ-ID 22 bis SEQ-ID 97 zur Bestimmung von Genexpressionsprofilen in vitro in einer Patientenprobe, für eine Verwendung als Kontrollgene sowie die Verwendung von Nucleinsäuren, ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus: SEQ-ID 22 bis SEQ-ID 97 als Kontrollgene zur Normalisierung von Genexpressionsanalysedaten.

    Verfahren zur in vitro Erkennung schwerer Sepsis
    4.
    发明公开
    Verfahren zur in vitro Erkennung schwerer Sepsis 审中-公开
    Verfahren zur体外Erkennung schwerer脓毒症

    公开(公告)号:EP2366799A2

    公开(公告)日:2011-09-21

    申请号:EP10195110.1

    申请日:2004-03-31

    申请人: SIRS-Lab GmbH

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: Die vorliegende Erfindung betrifft ein Verfahren zur in vitro Erkennung von schwerer Sepsis mittels eines Genexpressionsprofils aus bis zu 130 für schwere Sepsis spezifischen DNA-Sequenzen und Fragmenten davon.

    摘要翻译: 全身炎症反应综合征(SIRS)的体外检测包括检测疾病相关基因的异常表达。 体内检测全身炎症反应综合征(SIRS)的方法包括:(1)从哺乳动物中分离样品RNA; (2)用可检测标记(M)标记RNA和/或至少一种作为SIRS特异性基因(或其片段)的DNA; (3)在杂交条件下使样品RNA与DNA接触; (4)在类似条件下将对照RNA(代表非病理状态)与DNA接触; (5)定量检测来自(M)的信号; 和(6)相对于对照,比较信号以确定样品中SIRS特异性基因是否表达更强或更弱。 还包括以下独立权利要求:(1)用于体外检测(严重)败血症或败血症样条件的类似方法,其中使用的DNA是对这些疾病特异的基因(或片段); (2)基于肽的分离和标记的SIRS,(严重)败血症或败血症样条件的体外检测的类似方法,与这些疾病特异性的抗体(Ab)的反应,并将肽与健康对照中发现的肽的水平进行比较 ; 和(3)重组或合成的核酸(部分)序列或衍生的蛋白质或肽单独或混合物中用作特定疾病的测定中的校准物,用于评估筛选活性剂的活性或毒性,和/或 用于制备用于治疗或预防特定疾病的药剂。 活性:抗菌; 免疫抑制; 抗炎。 没有给出这些活动的测试细节。 行动机制:无给予。