公开(公告)号：JP2009507472A

公开(公告)日：2009-02-26

申请号：JP2008527221

申请日：2006-08-16

申请人： ザ チルドレンズ マーシー ホスピタル

发明人： ヘザー ニューカーク

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6827 ,  C12Q1/6834 ,  G01N33/54346 ,  Y10T436/143333 ,  C12Q2565/626 ,  C12Q2563/155 ,  C12Q2545/114 ,  C12Q2563/149 ,  C12Q2537/157

摘要： 新規な懸濁ハイブリダイゼーション試験を用いてフローサイトメトリによる核酸コピー数を測定した。 該試験は、分光学的に異なるポリスチレンマイクロスフェアに接合された長さ１００〜２３０４ｂｐの範囲の低コピー（Ｉｃ）産生物で実証された。 本明細書に示される実施例では、これら接合マイクロスフェアは、細胞遺伝子学的細胞ペレットから抽出され、ビオチン−ｄＵＴＰで標識されたゲノムＤＮＡ中の相同配列を検出するためのマルチハイブリダイゼーションプローブとして用いられた。 ハイブリダイゼーションは、フィコエリトリンで標識されたストレプトアビジンを用いて検出され、フローサイトメトリにより分析された。 コピー数の差異は、患者試料のゲノムＤＮＡ中の２倍体参照プローブをもつ試験プローブと、異常細胞株との平均蛍光強度の比較により区別された。 この試験は、染色体コンテクストに無関係に、２アレル参照配列由来の試験遺伝子座における単一アレルと３アレルの区別が可能である。 この試験は、相同標的の精確なコピー数決定のためにＩｃプローブが充分に特異的でかつ感度が高いため、遺伝子座特異的標的ＤＮＡの事前の増幅が必要な従来の方法の改良である。 その高い感度と精度のため、この試験は、核酸コピー数の測定のための、ヒト、疾患の動物モデルおよび溶液中のゲノムコピー数の測定、転写レベルの測定、法医学的ＤＮＡ分析および農業における品質管理などの各種適用のために有用である。
【選択図】図１

公开(公告)号：JP2009501005A

公开(公告)日：2009-01-15

申请号：JP2008519532

申请日：2006-06-28

申请人： ジーイー・ヘルスケア・バイオサイエンス・コーポレイション

发明人： ネルソン，ジョン・アール ,  パラニアッパン，チョッカリンガム ,  フラー，カール・ダブリュ

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12N15/09

CPC分类号： C12Q1/6809 ,  C12Q2565/501 ,  C12Q2521/131 ,  C12Q2563/155 ,  C12Q2535/101

摘要： 本発明では、オリゴヌクレオチドプローブを生成する新規なアプローチと、これらのプローブを、アレイ又はビーズ上の被験オリゴヌクレオチドとハイブリダイズさせることによって、遺伝子発現のプロファイリングに使用するアプローチを提供する。 このアプローチでは、相補的なオリゴヌクレオチドプローブに、染料又はハプテン標識ｄｄＮＴＰと鋳型との混合物の溶液を使用して標識を行う。 次に、この標識したオリゴヌクレオチドプローブを、固相担体上の被験オリゴヌクレオチドとのハイブリダイゼーションに使用し、ハイブリダイゼーションの成否を、固相担体上の信号を利用して監視する。 このアプローチでは、プローブの内容がシンプルにしたため、ハイブリダイゼーションの時間が大幅に短縮される。 この方法は、少数の遺伝子、例えば、特定の疾病又は状態についての遺伝子のシグナチャーセットについて解析する場合に特に有用である。
【選択図】 図１Ａ

公开(公告)号：JP2008000143A

公开(公告)日：2008-01-10

申请号：JP2007231588

申请日：2007-09-06

申请人： Nanosphere Inc ,  ナノスフェアー インコーポレイテッドNanosphere Inc.

发明人： MIRKIN CHAD A ,  PARK SO-JUNG ,  NAM JWA-MIN

IPC分类号： C12N15/09 ,  C12Q1/68 ,  C07H21/00 ,  C07H21/02 ,  C07H21/04 ,  G01N33/53 ,  G01N33/553

CPC分类号： C12Q1/6827 ,  B82Y30/00 ,  C07H21/00 ,  C12Q1/6825 ,  C12Q1/6834 ,  C12Q2563/179 ,  C12Q2563/155 ,  C12Q2525/197

摘要： PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a screening method for detecting the presence or absence of one or more proteins, such as an antibody, in a sample. SOLUTION: A screening method, a composition, and a kit each for detecting the presence or absence of one or more target analytes, for example, a protein such as an antibody in the sample is provided. Especially, a method for using reporter oligonucleotides as biochemical barcodes to detect protein structures or other target analytes in one solution is provided. COPYRIGHT: (C)2008,JPO&INPIT

摘要翻译： 待解决的问题：提供一种用于检测样品中一种或多种蛋白质（例如抗体）的存在或不存在的筛选方法。 提供了一种筛选方法，组合物和试剂盒，其用于检测样品中存在或不存在一种或多种目标分析物，例如蛋白质如抗体。 特别地，提供了使用报道寡核苷酸作为生物化学条形码来检测一种溶液中的蛋白质结构或其它目标分析物的方法。 版权所有（C）2008，JPO＆INPIT

公开(公告)号：JP2007534291A

公开(公告)日：2007-11-29

申请号：JP2005509535

申请日：2003-09-15

申请人： インテル・コーポレーション

发明人： スティーブン ジェイ． キルヒ ,  テ−ウーン クー ,  シン スー ,  ナラヤン スンダララジャン ,  セレナ チャン ,  ガビ ノイバウエル ,  アンドリュー エイ． バーリン ,  ミネオ ヤマカワ ,  バルリ ラオ

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12M1/34 ,  G01N21/65 ,  G01N21/78

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C12Q2565/632 ,  C12Q2563/155 ,  C12Q2521/319

摘要： 本明細書に開示の方法および装置は、増強ラマン分光法による核酸配列決定に関する。 本発明のある態様において、ヌクレオチドは、核酸に組み込まれる前にラマン標識に共有結合する。 他の態様においては、未標識核酸を使用する。 核酸をエキソヌクレアーゼ処理すると、標識または未標識ヌクレオチドが放出され、ラマン分光法によって検出される。 本発明の別の態様において、エキソヌクレアーゼ処理によって核酸から放出されるヌクレオチドはナノ粒子に共有結合で架橋し、表面増強ラマン分光法(SERS)、表面増強共鳴ラマン分光法(SERRS)、および／またはコヒーレント反ストークスラマン分光法(CARS)によって検出される。 本発明の他の態様は核酸配列決定のための装置に関する。

摘要翻译： 本文公开的方法和装置涉及通过增强拉曼光谱进行的核酸测序。 在本发明的某些实施方案中，在掺入核酸之前，核苷酸与拉曼标记物共价连接。 在其它实施方案中，使用未标记的核酸。 核酸外切核酸处理导致通过拉曼光谱法检测的标记或未标记的核苷酸的释放。 在本发明的替代实施方案中，通过外切核酸酶处理从核酸释放的核苷酸与纳米颗粒共价交联，并通过表面增强拉曼光谱（SERS），表面增强共振拉曼光谱（SERRS）和/或相干反斯托克斯拉曼 光谱学（CARS）。 本发明的其它实施方案涉及用于核酸测序的装置。

公开(公告)号：JP2007527325A

公开(公告)日：2007-09-27

申请号：JP2006553761

申请日：2005-02-17

申请人： ドゥ−コープ テクノロジーズ リミテッド

发明人： エラン ガッバイ，

IPC分类号： B82B1/00 ,  B82B3/00 ,  C12N1/20 ,  C12N7/00 ,  C12N15/09 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C01G41/00 ,  B82Y5/00 ,  B82Y30/00 ,  C01B13/145 ,  C01B13/322 ,  C01F11/22 ,  C01G23/006 ,  C01G49/0036 ,  C01P2004/04 ,  C01P2004/52 ,  C01P2004/64 ,  C01P2006/12 ,  C12Q1/6846 ,  C12Q2563/155

摘要： 整列した流体分子のエンベロープによって取り囲まれるナノメートルサイズのコア物質を含むナノ構造が開示される。 前記コア物質、および、前記整列した流体分子のエンベロープは定常的な物理的状態にある。 液体および前記ナノ構造を含む液体組成物も開示される。
【選択図】 なし

公开(公告)号：JP2007524347A

公开(公告)日：2007-08-30

申请号：JP2005518595

申请日：2004-02-27

申请人： ナノスフェアー インコーポレイテッドNanosphere Inc.

发明人： ピー． バオ、イジア ,  アール． ミュラー、ウーベ

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12N15/09 ,  G01N21/78 ,  G01N33/53 ,  G01N33/543 ,  G01N33/553 ,  G01N33/566 ,  G01N37/00

CPC分类号： C12Q1/6816 ,  C12Q1/6837 ,  C12Q2600/158 ,  C12Q2565/501 ,  C12Q2563/155 ,  C12Q2537/125 ,  C12Q2525/173

摘要： アレイ形式のアッセイにおいて、ナノ粒子プローブを用いて標識を使用せずに広範囲な遺伝子発現を検出するための方法およびキットが記載される。 該方法は、蛍光標識および標的の増幅に伴う問題を回避する。

公开(公告)号：JP2007516426A

公开(公告)日：2007-06-21

申请号：JP2006533143

申请日：2004-05-17

申请人： ユニバーシティー オブ ロチェスター

发明人： リ フイシャン ,  ルイス ジェイ． ロスバーグ

IPC分类号： G01N33/53 ,  C12N15/09 ,  C12Q1/68 ,  G01N20060101 ,  G01N21/78 ,  G01N21/82 ,  G01N33/531 ,  G01N33/542 ,  G01N33/553

CPC分类号： C12Q1/6816 ,  B82Y5/00 ,  B82Y10/00 ,  C12Q1/6832 ,  C12Q2563/155 ,  C12Q2527/107 ,  C12Q2565/107 ,  C12Q2565/119

摘要： 試料において標的核酸配列の存在または非存在を検出するための方法およびキットが提供されている。 方法およびキットは、金属ナノ粒子の使用および金属ナノ粒子と核酸分子の間の静電気的相互作用を含む。 方法は、金属ナノ粒子とのss-核酸およびds-核酸の示差的相互作用に頼っている。 比色検出アプローチは、コロイド懸濁液において金属ナノ粒子と静電気的に会合したss-核酸の、それらを凝集に対して安定させる能力を利用する。 タグ付けされたss-オリゴヌクレオチドプローブを含む蛍光アプローチは、ss-核酸の金属ナノ粒子上への示差的吸着を、標的にハイブリダイズしなかったプローブ上の蛍光タグの示差的消光に変換する。

公开(公告)号：JP2007516425A

公开(公告)日：2007-06-21

申请号：JP2006533082

申请日：2004-05-13

申请人： アイシス ファーマシューティカルズ インコーポレイティッド

发明人： レンデル エル． カミンズ ,  スティーブン エイ． ホフステイドラー

IPC分类号： G01N27/62 ,  C07H21/04 ,  C12N15/10 ,  C12Q1/68 ,  G01N30/00

CPC分类号： C12N15/101 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q2563/155 ,  C12Q2563/143 ,  C12Q2565/627

摘要： 本発明は、既存の方法と比較して効率的で費用効果的であるエレクトロスプレー質量分析法による後の分析のための、核酸の迅速な溶液捕獲精製法を提供する。 精製された試料がエレクトロスプレー質量分析法による分析に良好な状態になるように、本発明は、核酸の迅速な溶液捕獲を実践するために有効なキットも提供する。

公开(公告)号：JP2005535319A

公开(公告)日：2005-11-24

申请号：JP2004526591

申请日：2003-08-12

申请人： ホンコン・ディエヌエイ・チップス・リミテッドHong Kong Dna Chips Limited

发明人： チャン・ダンカン・カ−ユン ,  ユ・チェウン・ホイ ,  ラウ・ロク−ティン ,  リン・セルマ・サウ・ワー

IPC分类号： G01N33/53 ,  C12M1/00 ,  C12M1/34 ,  C12Q1/68 ,  G01N33/543 ,  G01N33/553 ,  G01N37/00

CPC分类号： C12Q1/6825 ,  C12Q1/6837 ,  Y10S435/975 ,  Y10S977/924 ,  C12Q2537/137 ,  C12Q2563/155 ,  C12Q2565/607 ,  C12Q2565/501

摘要： キャプチャープローブおよび電気的ハイブリダイゼーションを用いる生物試料中の標的DNAを検出するための装置および方法について記載する。 反応セルを、温度および物理特性により優れた酸化アルミニウムの結合表面で形成し、酸化アルミニウム表面を抗DIC抗体でコートしてキャプチャープローブが正しく配向するのに好都合な結合層を得、キャプチャープローブをDIC標識を用いて形成し、抗DIG/DIG結合を介して該セル表面に結合させる。

公开(公告)号：JP2005524857A

公开(公告)日：2005-08-18

申请号：JP2004513716

申请日：2003-05-16

申请人： インテル・コーポレーション

发明人： セレナ チャン ,  アンドリュー バーリン ,  ミネオ ヤマカワ

IPC分类号： C12Q1/68 ,  G01J3/44 ,  G01N21/65 ,  G01N33/53 ,  G01N33/543 ,  G01N33/553

CPC分类号： C12Q1/6825 ,  G01J3/44 ,  G01N21/658 ,  G01N2021/653 ,  C12Q2565/632 ,  C12Q2563/155

摘要： 本明細書に開示される方法と装置３００は金属被覆ナノ結晶性多孔質シリコン基板２４０、３４０に関する。 本発明のある実施形態では、多孔質シリコン基板１１０、２１０は希薄弗化水素酸１５０中での陽極エッチングで形成し得る。 陰極電気移動、または公知の技術により、金または銀等のラマン活性金属による薄膜被膜を多孔質シリコン１１０、２１０上に被覆する。 金属被覆基板２４０、３４０はＳＥＲＳ、ＳＥＲＲＳ、ハイパーラマン分光および／またはＣＡＲＳラマン分光に対し広い範囲の金属に富む環境を提供する。 本発明のある実施形態では、金属被覆基板２４０、３４０に金属ナノ粒子を添加してラマン信号を更に増強する事が出来る。 開示された方法および装置３００を用い、多様な被分析試料を検出、同定および／または定量するためにラマン分光を使用し得る。

摘要翻译： 本文公开的方法和装置300涉及使用金属涂覆的纳米晶体多孔硅衬底240,340的拉曼光谱。 在本发明的某些实施例中，多孔硅衬底110,210可以通过在稀氢氟酸150中的阳极蚀刻形成。 拉曼活性金属如金或银的薄涂层可以通过阴极电迁移或任何已知技术涂覆在多孔硅110,210上。 金属涂覆的基底240,340为SERS，SERRS，超拉曼和/或CARS拉曼光谱提供了广泛的金属富集环境。 在本发明的某些实施方案中，可以将金属纳米颗粒加入到金属涂覆的基底240,340中以进一步增强拉曼信号。 使用所公开的方法和装置300，可以使用拉曼光谱来检测，鉴定和/或定量各种各样的分析物。