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公开(公告)号：JP2016533165A
公开(公告)日：2016-10-27
申请号：JP2016517526
申请日：2014-09-26
Applicant: ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー , ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー , ナント ホールディングス アイピー,エルエルシー , ナント ホールディングス アイピー,エルエルシー
Inventor： ザキャリー サンボーン，ジョン , ザキャリー サンボーン，ジョン , ジョゼフ ヴァスク，チャールズ , ジョゼフ ヴァスク，チャールズ , チャールズ ベンズ，ステファン , チャールズ ベンズ，ステファン , ラビザド，シャールーズ , ヘンスリー，ニコール , ソン‐シオン，パトリック
CPC classification number: G06F19/22
Abstract: 企図されるシステムおよび方法は、複数のウイルスゲノム配列を含むキメラ参照配列を用いて組込みおよび共増幅事象を確認/定量化する。最も典型的には、ウイルスゲノム配列は単一の染色体としてキメラ参照配列にまとめられ、このキメラ参照配列はBAM形式である。【選択図】図4
Abstract translation: 该系统和方法考虑检查/量化使用包括多个病毒基因组序列的嵌合参考序列中的集成和共扩增的事件。 最典型地，所述病毒基因组序列被组合成嵌合参考序列作为一个单一的染色体，嵌合参考序列是BAM格式。 点域4
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公开(公告)号：JP2015534697A
公开(公告)日：2015-12-03
申请号：JP2015536870
申请日：2013-10-09
Applicant: ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー , ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー
Inventor： ジョゼフ ヴァスク，チャールズ , ジョゼフ ヴァスク，チャールズ , セジウィック，アンドリュー．ジェー , チャールズ ベンツ，ステファン , チャールズ ベンツ，ステファン
IPC: G06F19/24
CPC classification number: G06F19/12 , G06F19/24 , G06F19/3437 , G16H50/50
Abstract: 考案されたシステムおよび方法は、確率グラフィカルモデルを使用した、生物学的経路の調節型相互作用の機械学習および同定、特に、調節型パラメータの中での相互作用の相関の同定を提供する。【選択図】図1
Abstract translation: 它设计的系统和方法中使用的概率图模型，机器学习和生物学途径，特别是调控相互作用的鉴定，提供了一种用于调节参数中的识别的相关性的相互作用。 点域1
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公开(公告)号：JP2016532921A
公开(公告)日：2016-10-20
申请号：JP2016516789
申请日：2014-05-28
Applicant: ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー , ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー
Inventor： チャールズ ベンズ，ステファン , チャールズ ベンズ，ステファン , スゼト，クリストファー
CPC classification number: G06F19/10 , G06F19/12 , G06F19/345 , G16H50/20
Abstract: 複数の細胞もしくは組織標本からのオミックスデータが細胞もしくは組織の治療パラメータ(例えば、特定の薬剤に対する抵抗性)に関連付けられている経路要素を識別するために使用されるシステムおよび方法が提示される。このようにして識別された経路要素は、その後、治療パラメータに関して再評価される修正されたデータセットを提供するために、統計学的因子グラフモデルにおいてインシリコ調整される。このようなシステムおよび方法は、治療未経験患者に対する多剤治療の推奨のため特に役立つ。【選択図】図4
Abstract translation: 从多个细胞或组织标本的组学数据的细胞或组织的治疗参数（例如，对特定药物抗性）的系统和方法被用于识别与被呈现相关联的路径的元件。 以这种方式，所识别的通路的元件，然后，为了提供经修改的数据组重新评估用于治疗参数是在统计因子图模型调整硅。 这样的系统和方法可用于治疗初治患者的多药治疗的建议是特别有用的。 点域4
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公开(公告)号：JP2015500034A
公开(公告)日：2015-01-05
申请号：JP2014546145
申请日：2012-12-07
Applicant: ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー , ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー
Inventor： ザキャリー サンボーン，ジョン , ザキャリー サンボーン，ジョン , ジョゼフ ヴァスク，チャールズ , ジョゼフ ヴァスク，チャールズ , チャールズ ベンツ，ステファン , チャールズ ベンツ，ステファン
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12Q2600/106 , C12Q2600/172 , G06F19/18 , G06F19/22 , G06F19/24 , G16H50/20
Abstract: 企図したシステムおよび方法により、ペアエンド配列解析および分離リード精緻化を使用する、計算ゲノム解析が可能になり、それによって高いコピー数および再構成の方向に関連付けられた高信頼度の切断点を同定し、次いでこれは二重微小(DM)の完全な再構築に対する基礎になる。特に好ましい態様では、DMは腫瘍遺伝子もしくは腫瘍抑制遺伝子も含み、かつ/または血液もしくは血液由来の液内に見出され得る。【選択図】図6
Abstract translation: 该系统和方法预期用途配对末端序列分析和分离导致的阐述，计算基因组分析成为可能，从而获得高拷贝数和与所述重构的识别的方向相关联的一个可靠切割点 ，然后成为为双分钟（DM）的完整重建的基础。 在特别优选的实施例中，DM可以在癌基因或肿瘤抑制基因可包括，和/或血液或源自血液的液中找到。 点域6
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公开(公告)号：JP2017504093A
公开(公告)日：2017-02-02
申请号：JP2016531069
申请日：2014-11-13
Applicant: ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー , ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー
Inventor： チャールズ ベンズ，ステファン , チャールズ ベンズ，ステファン , ザキャリー サンボーン，ジョン , ザキャリー サンボーン，ジョン , ジョゼフ ヴァスク，チャールズ , ジョゼフ ヴァスク，チャールズ
IPC: G06F19/22
CPC classification number: H04L67/06 , G06F17/30076 , G06F19/22 , G06F19/28
Abstract: 「オミクス」デジタルデータ移送システムおよび方法が開示される。開示されたシステムおよび方法は、1または複数の配列決定装置による機械固有注釈と、オミクス出力ファイルの1または複数の属性に関するユーザ入力とに基づいて、多数のオミクス出力ファイルの移送グループを構成する移送サーバを用いる。【選択図】図1
Abstract translation: “组学”数字数据传送系统和方法中公开。 所公开的系统和方法，传送到一个特定的机器的注释的一个或多个测序装置，基于用于组学输出文件的一个或多个属性的用户输入，构成多OMICS输出文件的传输组 使用服务器的。 点域1
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：JP2015500535A
公开(公告)日：2015-01-05
申请号：JP2014546125
申请日：2012-12-07
Applicant: ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー , ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー
Inventor： ジョゼフ ヴァスク，チャールズ , ジョゼフ ヴァスク，チャールズ , ザキャリー サンボーン，ジョン , ザキャリー サンボーン，ジョン , ベンツ，ステファン
IPC: G06F19/26
CPC classification number: G06T3/40 , G06F19/22 , G06F19/26 , G06F19/28 , G06T2200/24 , G09G5/373 , G09G2340/045 , G09G2354/00
Abstract: ゲノム可視化システムが、配列オブジェクト内のスケール関連アノテーションにより、情報内容の表示に適応する、ゲノムデータの動的可視化のためのシステムおよび方法が提供される。【選択図】図2
Abstract translation: 基因组可视化系统，在阵列的对象的尺度相关的注解，适应于信息内容，用于基因组数据的动态可视化的系统和方法的显示设置。 .The
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公开(公告)号：JP6611873B2
公开(公告)日：2019-11-27
申请号：JP2018134832
申请日：2018-07-18
Applicant: ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー
Inventor： ヴァスク,チャールズ ジョゼフ , セジウィック,アンドリュー.ジェー , ベンツ,ステファン チャールズ
IPC: G16B40/00
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公开(公告)号：JP2018195325A
公开(公告)日：2018-12-06
申请号：JP2018134832
申请日：2018-07-18
Applicant: ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー
Inventor： ヴァスク,チャールズ ジョゼフ , セジウィック,アンドリュー.ジェー , ベンツ,ステファン チャールズ
IPC: G06F19/24
Abstract: 【課題】経路モデルが各々の進路を介して互いに結合した複数の経路要素を有する確率グラフィカルモデルを使用し、生物学的経路の調節型相互作用を学習かつ同定する多様なシステム及び方法の提供。 【解決手段】エコシステム100において、学習エンジン110は、複数のオミックスデータセットを受信するオミックス入力インターフェース120と、インターフェースと結合したオミックス処理モジュール170で構成され、複数の経路要素を有する経路モデル150にアクセスし、複数の経路要素の内少なくとも2つの要素が、複数の調節型パラメータの関数として、活性を調節する調節ノードを有する進路を介して互いに結合し、オミックス入力インターフェース120を介して、オミックスデータセットの少なくとも1つを取得し、少なくとも1つのオミックスデータセット及び経路モデルに基づき、複数の調節型パラメータの中で相互作用の相関の組み合わせを推測する。 【選択図】図1
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公开(公告)号：JP2018190441A
公开(公告)日：2018-11-29
申请号：JP2018134932
申请日：2018-07-18
Applicant: ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー
Inventor： ベンズ,ステファン チャールズ , スゼト,クリストファー
Abstract: 【課題】異常細胞もしくは組織内の1つまたは複数の経路のインシリコ反応を予測し、治療未経験患者に対する多剤治療の推奨のための計算機モデルおよび方法を提供する。 【解決手段】経路モデルデータベースは、多数の区別できる異常細胞のオミックスデータにそれぞれ由来する多数の区別できるデータセットを記憶し、各データセットは、複数の経路要素データを備える。機械学習システムは、次に、複数の区別できるデータセットのうち少なくとも一部を受け取り、異常細胞の治療パラメータの状態に関連付けられた区別できるデータセット内の決定的な経路要素を識別する。経路解析エンジンは、次に、異常細胞から区別できるデータセットのうち少なくとも1つを受け取り、データセット内の決定的な経路要素は、次に、修正されたデータセットを生成するために経路解析エンジンにおいて調整される。 【選択図】図4
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公开(公告)号：JP6374057B2
公开(公告)日：2018-08-15
申请号：JP2017111952
申请日：2017-06-06
Applicant: ファイヴ3 ゲノミクス,エルエルシー
Inventor： ヴァスク,チャールズ ジョゼフ , セジウィック,アンドリュー.ジェー , ベンツ,ステファン チャールズ
IPC: G06F19/24
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