公开(公告)号：US07792665B2

公开(公告)日：2010-09-07

申请号：US10517225

申请日：2003-06-09

申请人： Dario Alessi ,  Ricardo Biondi ,  David Komander ,  Daan Van Aalten

发明人： Dario Alessi ,  Ricardo Biondi ,  David Komander ,  Daan Van Aalten

IPC分类号： G01N31/00 ,  G06F19/00 ,  G06G7/48

CPC分类号： C07D498/22 ,  C12Q1/485 ,  C22C43/00

摘要： A method for selecting a compound for modulating the activity of phosphoinositide dependent protein kinase 1 (PDKI) is provided. The method may comprise modelling a three dimensional structure of a plurality of molecules in a computer, comparing with the three dimensional structure of the compounds with that of a reference structure such as at least part of a protein kinase catalytic domain of PDK1, and selecting the compound based on a predicted interacting ability of the molecules to the protein kinase catalytic domain. Also a method for selecting a compound for modulating the activity of hydrophobic pocket containing protein kinase is provided. In this method, the reference structures may be one or more of a phosphate binding pocket of PDK1, a hydrophobic pocket of PDK1, and αC helix or region interacting therewith of PDK1.

摘要翻译： 提供了选择用于调节磷酸肌醇依赖性蛋白激酶1（PDK1）的活性的化合物的方法。 该方法可以包括对计算机中的多个分子的三维结构进行建模，与化合物的三维结构与参考结构的三维结构（例如PDK1的蛋白激酶催化结构域的至少一部分）相比较，并且选择 基于预测的分子与蛋白激酶催化结构域的相互作用能力的化合物。 还提供了选择用于调节含有蛋白激酶的疏水口袋的活性的化合物的方法。 在该方法中，参考结构可以是PDK1的磷酸结合口袋，PDK1的疏水口袋和αC螺旋或与PDK1相互作用的区域中的一种或多种。